Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW4

ZNF248, Zinc finger protein 248, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF248Q8NDW4 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
ZNF248Q8NDW4 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ZNF248Q8NDW4 RNU6-1074P-201ENST00000383995 104 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ZNF248Q8NDW4 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ZNF248Q8NDW4 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ZNF248Q8NDW4 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ZNF248Q8NDW4 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ZNF248Q8NDW4 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ZNF248Q8NDW4 AL078587.1-201ENST00000448580 542 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ZNF248Q8NDW4 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ZNF248Q8NDW4 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ZNF248Q8NDW4 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ZNF248Q8NDW4 GMFBP1-201ENST00000467831 427 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ZNF248Q8NDW4 AC006512.1-201ENST00000468816 291 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ZNF248Q8NDW4 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ZNF248Q8NDW4 RPS15AP36-201ENST00000492022 382 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ZNF248Q8NDW4 ANKRD36B-207ENST00000497329 649 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
ZNF248Q8NDW4 SLC25A46-206ENST00000509432 1596 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ZNF248Q8NDW4 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ZNF248Q8NDW4 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ZNF248Q8NDW4 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ZNF248Q8NDW4 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ZNF248Q8NDW4 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ZNF248Q8NDW4 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ZNF248Q8NDW4 ANP32BP3-201ENST00000559213 706 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ZNF248Q8NDW4 AC018638.8-201ENST00000588755 281 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ZNF248Q8NDW4 BNIP3P10-201ENST00000605360 577 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ZNF248Q8NDW4 ATP1B3P1-201ENST00000605365 821 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ZNF248Q8NDW4 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ZNF248Q8NDW4 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ZNF248Q8NDW4 AC007218.2-201ENST00000636913 179 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ZNF248Q8NDW4 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
ZNF248Q8NDW4 ZNF479-202ENST00000331162 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
ZNF248Q8NDW4 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ZNF248Q8NDW4 ASNSP3-201ENST00000451989 1306 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ZNF248Q8NDW4 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
ZNF248Q8NDW4 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ZNF248Q8NDW4 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ZNF248Q8NDW4 PRKACB-217ENST00000610457 4206 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ZNF248Q8NDW4 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ZNF248Q8NDW4 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ZNF248Q8NDW4 RNU6-996P-201ENST00000365438 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ZNF248Q8NDW4 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ZNF248Q8NDW4 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ZNF248Q8NDW4 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ZNF248Q8NDW4 RNU6-903P-201ENST00000391270 109 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ZNF248Q8NDW4 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ZNF248Q8NDW4 AL645937.1-202ENST00000421799 937 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ZNF248Q8NDW4 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ZNF248Q8NDW4 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ZNF248Q8NDW4 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ZNF248Q8NDW4 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ZNF248Q8NDW4 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ZNF248Q8NDW4 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ZNF248Q8NDW4 AC020550.1-201ENST00000447385 163 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ZNF248Q8NDW4 AP000431.2-201ENST00000450653 790 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ZNF248Q8NDW4 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ZNF248Q8NDW4 AC108059.3-201ENST00000456388 214 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ZNF248Q8NDW4 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ZNF248Q8NDW4 RNU7-63P-201ENST00000459054 62 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ZNF248Q8NDW4 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ZNF248Q8NDW4 MLLT10P2-201ENST00000506434 249 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ZNF248Q8NDW4 RNU4ATAC8P-201ENST00000516196 109 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ZNF248Q8NDW4 AC113145.1-201ENST00000522408 412 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ZNF248Q8NDW4 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ZNF248Q8NDW4 FAM60DP-201ENST00000524174 632 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ZNF248Q8NDW4 OR4R1P-201ENST00000529879 463 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ZNF248Q8NDW4 AC092745.2-201ENST00000537764 620 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ZNF248Q8NDW4 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ZNF248Q8NDW4 AC093027.1-201ENST00000546698 429 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ZNF248Q8NDW4 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ZNF248Q8NDW4 DNAJC8P1-201ENST00000554535 372 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ZNF248Q8NDW4 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ZNF248Q8NDW4 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ZNF248Q8NDW4 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ZNF248Q8NDW4 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ZNF248Q8NDW4 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ZNF248Q8NDW4 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ZNF248Q8NDW4 AC138761.3-201ENST00000579993 334 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ZNF248Q8NDW4 AP001330.4-201ENST00000604350 154 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ZNF248Q8NDW4 AC004908.2-201ENST00000609090 574 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ZNF248Q8NDW4 AC093838.1-201ENST00000613014 469 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ZNF248Q8NDW4 AL603758.1-201ENST00000618654 241 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ZNF248Q8NDW4 IL1RL1-204ENST00000409584 2693 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ZNF248Q8NDW4 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
ZNF248Q8NDW4 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ZNF248Q8NDW4 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ZNF248Q8NDW4 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
ZNF248Q8NDW4 RNU6-552P-201ENST00000362869 119 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ZNF248Q8NDW4 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ZNF248Q8NDW4 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ZNF248Q8NDW4 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ZNF248Q8NDW4 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ZNF248Q8NDW4 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ZNF248Q8NDW4 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ZNF248Q8NDW4 AL139397.2-201ENST00000404529 772 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ZNF248Q8NDW4 AL356432.1-201ENST00000405809 419 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ZNF248Q8NDW4 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ZNF248Q8NDW4 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ZNF248Q8NDW4 LINC02263-203ENST00000426240 515 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.2 ms