Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 AC007014.2-201ENST00000615581 479 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RAB6CQ53S08 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RAB6CQ53S08 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
RAB6CQ53S08 AC006355.2-201ENST00000629240 317 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
RAB6CQ53S08 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
RAB6CQ53S08 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
RAB6CQ53S08 AC005183.1-201ENST00000603687 1979 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RAB6CQ53S08 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
RAB6CQ53S08 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
RAB6CQ53S08 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
RAB6CQ53S08 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 RNU6-903P-201ENST00000391270 109 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 AC000111.3-201ENST00000433478 193 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 CALM1P1-201ENST00000442082 433 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 AC012181.1-201ENST00000479895 423 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 MEPE-206ENST00000511670 550 ntTSL 4 BASIC2.9□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 RNU4-29P-201ENST00000515943 174 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 PSMA4-204ENST00000558094 651 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 AC093732.2-201ENST00000607950 274 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 AC104458.1-201ENST00000608243 463 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 SLC16A7-201ENST00000261187 11777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 Y_RNA.89-201ENST00000363031 102 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 RNA5SP38-201ENST00000410750 119 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 AL138737.1-202ENST00000418834 876 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 MRPS10P2-201ENST00000431226 381 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 AC074124.1-201ENST00000502368 375 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 IGHV3-76-201ENST00000522465 295 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 AC007368.1-201ENST00000536422 974 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 MRPL51-203ENST00000538814 501 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 AC005909.1-201ENST00000577835 755 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 AP000907.4-201ENST00000604143 237 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 AC068944.2-201ENST00000610373 403 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 U6.42-201ENST00000618440 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 MAPK8-202ENST00000374174 739 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 AKR1C1-201ENST00000380859 858 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 MIR591-201ENST00000385290 95 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 AL356057.3-201ENST00000402607 340 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 RPS24P13-201ENST00000442520 397 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 AC026780.2-201ENST00000503489 730 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 RNU6-1178P-201ENST00000516674 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 RNU6-835P-201ENST00000516974 104 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.4 ms