Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 LINC01897-203ENST00000591503 369 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 AC068276.1-201ENST00000605793 379 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 CRLS1-202ENST00000378868 994 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 RPS3AP3-201ENST00000411933 242 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 SPATA17-AS1-201ENST00000415765 420 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 NPM1P11-201ENST00000417106 855 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 ELOCP4-201ENST00000420090 333 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 PCDH9-AS4-201ENST00000456459 436 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 AC093899.1-201ENST00000457984 376 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 RNA5SP269-201ENST00000459032 137 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 TRBV1-201ENST00000476502 284 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 BET1P1-201ENST00000482276 359 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 AC103957.1-202ENST00000519814 735 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 OSBPL9P5-201ENST00000542581 171 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 MIR3682-201ENST00000581338 84 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 AC007621.1-201ENST00000604544 437 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 AC011939.3-201ENST00000613686 466 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 AC078883.4-201ENST00000623218 367 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.48□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 MLIP-AS1-201ENST00000434196 1534 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 U8.3-201ENST00000363321 132 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 RN7SKP226-201ENST00000364912 300 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 SNORD116-8-201ENST00000384365 95 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 AF228730.1-201ENST00000397972 663 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 RPS3AP36-201ENST00000398190 775 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 HMGN1P14-201ENST00000412459 517 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 LINC01412-201ENST00000413525 362 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 AL138737.1-202ENST00000418834 876 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 LINC01758-201ENST00000448001 458 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 DPPA3P1-201ENST00000448050 469 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 AL358075.2-201ENST00000452785 339 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 snoU109.1-201ENST00000459339 135 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 RAP1BP2-201ENST00000478270 544 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 AC098591.2-201ENST00000510152 315 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 AC093206.1-201ENST00000515364 497 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 RN7SKP24-201ENST00000515888 284 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 AC060788.1-201ENST00000521318 469 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 AC007151.1-201ENST00000572774 483 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 Z94722.1-201ENST00000604328 474 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 AC135507.1-201ENST00000607214 561 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 AC005332.10-201ENST00000612725 619 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 AC130324.3-201ENST00000614165 542 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 RGS13-201ENST00000391995 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
CLPPQ16740 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 FGF7P2-201ENST00000332473 296 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 RNY3P10-201ENST00000384764 102 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 AL109913.1-201ENST00000421173 514 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 EDNRB-AS1-201ENST00000422405 601 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 AL135908.1-201ENST00000431394 446 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 RPS24P1-201ENST00000438550 371 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 LINC01813-201ENST00000451034 712 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 AL033528.1-201ENST00000453780 140 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 SNRPGP9-201ENST00000456025 225 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 ZBTB20-AS2-201ENST00000478301 372 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 AC082650.1-201ENST00000503542 575 ntTSL 4 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 AC109927.2-201ENST00000506416 303 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
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