Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 AC008264.1-201ENST00000447612 367 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 RPL21P10-201ENST00000463521 490 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 TRBV1-201ENST00000476502 284 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 FGF7P4-201ENST00000509595 295 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 FCF1P8-201ENST00000510322 597 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 AC106744.2-202ENST00000515123 448 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 AC106782.4-201ENST00000568264 210 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 LPP-220ENST00000617246 18220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 GABRG2-222ENST00000639975 3662 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC3.4□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 SNORD46.1-201ENST00000364139 104 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 RNVU1-14-201ENST00000384770 164 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 MIR1290-201ENST00000408735 78 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 RNA5SP129-201ENST00000410276 118 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 RPL23AP82-202ENST00000427528 469 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 AC012081.1-201ENST00000462382 477 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 CENPBD1P1-201ENST00000464061 469 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 SNORA64.4-201ENST00000516632 81 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 AC068657.1-201ENST00000520807 306 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 PCED1B-AS1-208ENST00000551898 359 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 MTCO3P23-201ENST00000561363 289 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 AC015911.6-201ENST00000588445 457 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 AC005498.1-201ENST00000592125 465 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 SRGNP1-201ENST00000603392 451 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 ATP1B3P1-201ENST00000605365 821 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 AC087045.1-201ENST00000605856 382 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 STARD13-AS-221ENST00000608197 604 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 ROS1-202ENST00000368508 7435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 MARCH7-202ENST00000409175 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 SLAIN1-203ENST00000351546 2394 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 OR5I1-201ENST00000301532 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 U3.42-201ENST00000408746 214 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 AC019155.3-201ENST00000454957 600 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 RN7SL283P-201ENST00000489055 303 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 AC110799.1-201ENST00000509098 449 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 AC074250.1-201ENST00000511117 192 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 TBCAP3-201ENST00000512475 312 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 AC090136.1-201ENST00000520009 240 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 AC093027.1-201ENST00000546698 429 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 AL132780.1-202ENST00000548322 591 ntTSL 4 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 AC011611.1-201ENST00000552179 197 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 AC005476.1-201ENST00000554427 397 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 AC092120.1-201ENST00000562211 420 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 TTN-AS1-243ENST00000591867 748 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 AC243960.4-201ENST00000600532 288 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 AC080078.1-201ENST00000603643 410 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 MBNL1-206ENST00000357472 5256 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 MBNL3-204ENST00000370853 2661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 AC008568.2-201ENST00000623862 2313 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 AC017071.1-201ENST00000564407 2204 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 Y_RNA.813-201ENST00000364639 102 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
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