Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 AC112198.2-201ENST00000426589 6996 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
E2F4Q16254 RNU1-43P-201ENST00000365052 165 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
E2F4Q16254 MIR600-201ENST00000385007 98 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
E2F4Q16254 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
E2F4Q16254 RN7SKP206-201ENST00000410823 293 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
E2F4Q16254 RPS26P39-201ENST00000469206 341 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
E2F4Q16254 UQCRHP4-201ENST00000471686 272 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
E2F4Q16254 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
E2F4Q16254 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
E2F4Q16254 ATP5LP3-201ENST00000514223 304 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
E2F4Q16254 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
E2F4Q16254 AC009446.1-202ENST00000521131 473 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
E2F4Q16254 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
E2F4Q16254 CT45A5-202ENST00000617203 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
E2F4Q16254 ZNF285-205ENST00000614994 6012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
E2F4Q16254 LINC00283-201ENST00000430111 1947 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
E2F4Q16254 DNAJC9-AS1-204ENST00000440197 2865 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
E2F4Q16254 LINC01091-203ENST00000514823 5262 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
E2F4Q16254 RAB30-212ENST00000533486 9929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
E2F4Q16254 CLEC1B-204ENST00000428126 3054 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
E2F4Q16254 LRIT3-201ENST00000327908 3781 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
E2F4Q16254 SLC38A9-223ENST00000515629 2673 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
E2F4Q16254 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
E2F4Q16254 SNORA17.1-201ENST00000362945 126 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
E2F4Q16254 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
E2F4Q16254 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
E2F4Q16254 AC007738.1-201ENST00000413892 348 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
E2F4Q16254 AL161618.1-201ENST00000438738 761 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
E2F4Q16254 AL450023.3-201ENST00000440592 271 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
E2F4Q16254 AC078918.1-201ENST00000498515 228 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
E2F4Q16254 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
E2F4Q16254 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
E2F4Q16254 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
E2F4Q16254 MTND6P33-201ENST00000571794 183 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
E2F4Q16254 MIR3176-201ENST00000582210 90 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
E2F4Q16254 RNF123-214ENST00000629802 207 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
E2F4Q16254 BMS1P21-201ENST00000634565 365 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
E2F4Q16254 AL034408.1-202ENST00000636088 415 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
E2F4Q16254 RBBP6-203ENST00000381039 3384 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
E2F4Q16254 BBX-203ENST00000402543 3980 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
E2F4Q16254 PEAK1-201ENST00000312493 11512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
E2F4Q16254 XIST-204ENST00000429829 19275 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
E2F4Q16254 ATF7IP2-202ENST00000356427 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
E2F4Q16254 ZNF891-201ENST00000537226 15455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
E2F4Q16254 OR6B1-202ENST00000641698 5153 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
E2F4Q16254 PPIG-201ENST00000260970 6368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
E2F4Q16254 RNU6-600P-201ENST00000362524 99 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
E2F4Q16254 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
E2F4Q16254 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
E2F4Q16254 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
E2F4Q16254 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
E2F4Q16254 SNORA77-201ENST00000408716 125 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
E2F4Q16254 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
E2F4Q16254 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
E2F4Q16254 RPL35AP21-201ENST00000437667 333 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
E2F4Q16254 RPS29P9-201ENST00000440360 171 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
E2F4Q16254 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
E2F4Q16254 LINC01150-201ENST00000455671 315 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
E2F4Q16254 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
E2F4Q16254 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
E2F4Q16254 AP006245.2-201ENST00000522004 300 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
E2F4Q16254 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
E2F4Q16254 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
E2F4Q16254 SP2-AS1-204ENST00000585280 405 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
E2F4Q16254 AC100827.5-201ENST00000615883 426 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
E2F4Q16254 AC104623.2-202ENST00000623477 4002 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
E2F4Q16254 STAG2-203ENST00000371145 4393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
E2F4Q16254 CASP10-204ENST00000346817 3926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
E2F4Q16254 ADGRL3-217ENST00000514591 6297 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
E2F4Q16254 WDR12-201ENST00000261015 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
E2F4Q16254 FAM184A-204ENST00000368475 3392 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
E2F4Q16254 SPOCK3-225ENST00000535728 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
E2F4Q16254 PCDH15-203ENST00000373955 4230 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
E2F4Q16254 VPS13C-204ENST00000395898 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
E2F4Q16254 DCTN4-201ENST00000424236 4054 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
E2F4Q16254 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
E2F4Q16254 RNMT-209ENST00000592764 4108 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
E2F4Q16254 HDX-202ENST00000373177 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
E2F4Q16254 AHNAK-202ENST00000378024 18787 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
E2F4Q16254 MBNL1-203ENST00000324196 5225 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
E2F4Q16254 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
E2F4Q16254 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
E2F4Q16254 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
E2F4Q16254 MIR607-201ENST00000385241 96 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
E2F4Q16254 VDAC1P3-201ENST00000434069 851 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
E2F4Q16254 AL691497.1-201ENST00000443270 449 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
E2F4Q16254 RN7SL443P-201ENST00000464331 290 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
E2F4Q16254 BX284632.1-201ENST00000478218 541 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
E2F4Q16254 AC073073.1-201ENST00000493920 463 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
E2F4Q16254 Vault.1-201ENST00000516474 102 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
E2F4Q16254 RPL23AP53-201ENST00000521854 457 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
E2F4Q16254 IPO5P1-202ENST00000600039 287 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
E2F4Q16254 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
E2F4Q16254 AL355480.1-201ENST00000629041 99 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
E2F4Q16254 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
E2F4Q16254 DNAH7-202ENST00000409063 1845 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
E2F4Q16254 SCN1A-209ENST00000635750 8299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
E2F4Q16254 WDHD1-201ENST00000360586 5996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
E2F4Q16254 AK9-202ENST00000355283 2499 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
E2F4Q16254 ZC3H12B-201ENST00000338957 7256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.4 ms