Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SYCP1Q15431 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SYCP1Q15431 TMEM161B-210ENST00000511218 1351 ntTSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
SYCP1Q15431 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SYCP1Q15431 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SYCP1Q15431 MEIG1-201ENST00000378240 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
SYCP1Q15431 AKR1C1-201ENST00000380859 858 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
SYCP1Q15431 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC1.75□□□□□ -2.13
SYCP1Q15431 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SYCP1Q15431 LINC00392-201ENST00000430033 557 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
SYCP1Q15431 GPM6BP2-201ENST00000432046 144 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SYCP1Q15431 MTATP6P30-201ENST00000443540 664 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SYCP1Q15431 GPM6BP1-201ENST00000446387 144 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SYCP1Q15431 AC104563.1-201ENST00000476147 376 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SYCP1Q15431 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SYCP1Q15431 FAM92A1P2-202ENST00000504766 877 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SYCP1Q15431 AC093752.1-206ENST00000511823 336 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SYCP1Q15431 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SYCP1Q15431 LINC00301-204ENST00000532591 470 ntTSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
SYCP1Q15431 AC104072.1-201ENST00000568817 668 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SYCP1Q15431 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
SYCP1Q15431 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
SYCP1Q15431 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
SYCP1Q15431 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SYCP1Q15431 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SYCP1Q15431 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SYCP1Q15431 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SYCP1Q15431 AC073052.2-202ENST00000622296 775 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
SYCP1Q15431 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
SYCP1Q15431 AC092192.1-201ENST00000633154 1018 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SYCP1Q15431 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
SYCP1Q15431 ZNF876P-202ENST00000398732 1485 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SYCP1Q15431 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SYCP1Q15431 LINC01934-201ENST00000414750 391 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
SYCP1Q15431 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
SYCP1Q15431 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SYCP1Q15431 USP9YP26-201ENST00000421008 661 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SYCP1Q15431 LINC00387-201ENST00000422609 458 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
SYCP1Q15431 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SYCP1Q15431 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
SYCP1Q15431 RPL36AP53-201ENST00000432891 316 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SYCP1Q15431 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
SYCP1Q15431 USP9YP10-201ENST00000454868 628 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SYCP1Q15431 AC092264.1-201ENST00000456002 713 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
SYCP1Q15431 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SYCP1Q15431 RNU6-150P-201ENST00000516237 95 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SYCP1Q15431 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SYCP1Q15431 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SYCP1Q15431 AP005901.2-201ENST00000581690 525 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
SYCP1Q15431 AC073544.2-201ENST00000601155 540 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SYCP1Q15431 TMEM154-204ENST00000613578 486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
SYCP1Q15431 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SYCP1Q15431 PCF11-AS1-201ENST00000602322 1516 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SYCP1Q15431 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SYCP1Q15431 AC064871.1-202ENST00000413954 382 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
SYCP1Q15431 AC244035.1-201ENST00000430042 390 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SYCP1Q15431 ZNF385D-AS2-201ENST00000436306 424 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
SYCP1Q15431 AL160287.1-201ENST00000455612 432 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
SYCP1Q15431 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SYCP1Q15431 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SYCP1Q15431 RNY4P37-201ENST00000516225 96 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SYCP1Q15431 AC027458.1-201ENST00000563639 613 ntTSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
SYCP1Q15431 AC004987.4-201ENST00000603383 338 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SYCP1Q15431 DPPA3P3-201ENST00000603842 430 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SYCP1Q15431 AC099785.1-201ENST00000605697 437 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SYCP1Q15431 DPY19L1-208ENST00000612226 607 ntTSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
SYCP1Q15431 AC091834.1-201ENST00000614543 472 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SYCP1Q15431 AC068880.4-201ENST00000623082 495 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SYCP1Q15431 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
SYCP1Q15431 LIPJ-201ENST00000371939 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
SYCP1Q15431 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SYCP1Q15431 LRRC69-201ENST00000343709 720 ntTSL 2 BASIC1.72□□□□□ -2.13
SYCP1Q15431 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SYCP1Q15431 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SYCP1Q15431 MTCO1P56-201ENST00000401674 224 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SYCP1Q15431 AL139397.2-201ENST00000404529 772 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SYCP1Q15431 AC078974.1-201ENST00000411597 223 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SYCP1Q15431 LINC01065-201ENST00000417989 577 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
SYCP1Q15431 RPL7P34-201ENST00000433316 712 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SYCP1Q15431 GTF2IP3-201ENST00000433887 494 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SYCP1Q15431 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SYCP1Q15431 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SYCP1Q15431 SSXP1-201ENST00000453640 473 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SYCP1Q15431 AL359095.1-201ENST00000457383 635 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
SYCP1Q15431 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SYCP1Q15431 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SYCP1Q15431 SMIM18-201ENST00000517349 905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.72□□□□□ -2.13
SYCP1Q15431 CA1-215ENST00000522389 551 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
SYCP1Q15431 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SYCP1Q15431 AC023825.1-201ENST00000566704 1030 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SYCP1Q15431 AC012213.3-201ENST00000577199 777 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SYCP1Q15431 AC091057.3-201ENST00000602684 733 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SYCP1Q15431 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SYCP1Q15431 AC018638.7-201ENST00000605836 1114 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SYCP1Q15431 AC092953.2-201ENST00000608000 699 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SYCP1Q15431 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
SYCP1Q15431 AL512506.1-201ENST00000613918 449 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SYCP1Q15431 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
SYCP1Q15431 AC092447.10-201ENST00000620607 1652 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SYCP1Q15431 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
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