Protein–RNA interactions for Protein: Q15286

RAB35, Ras-related protein Rab-35, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB35Q15286 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
RAB35Q15286 AL589740.1-207ENST00000607823 1962 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
RAB35Q15286 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
RAB35Q15286 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
RAB35Q15286 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
RAB35Q15286 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
RAB35Q15286 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RAB35Q15286 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RAB35Q15286 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RAB35Q15286 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RAB35Q15286 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
RAB35Q15286 LINC01780-201ENST00000420059 442 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
RAB35Q15286 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
RAB35Q15286 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
RAB35Q15286 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
RAB35Q15286 LINC02195-201ENST00000443373 294 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
RAB35Q15286 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RAB35Q15286 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RAB35Q15286 AP000852.1-201ENST00000472460 573 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RAB35Q15286 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC2.3□□□□□ -2.04
RAB35Q15286 LAMTOR3P2-201ENST00000504479 232 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RAB35Q15286 AL136537.1-201ENST00000508199 538 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
RAB35Q15286 LINC02500-201ENST00000512547 493 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
RAB35Q15286 AC110296.1-201ENST00000515680 341 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
RAB35Q15286 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RAB35Q15286 RNU6-123P-201ENST00000516163 102 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RAB35Q15286 Y_RNA.688-201ENST00000516565 95 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RAB35Q15286 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RAB35Q15286 MTND2P38-201ENST00000522536 667 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RAB35Q15286 SPINK7-205ENST00000523535 299 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
RAB35Q15286 HOMER1-205ENST00000535690 642 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
RAB35Q15286 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
RAB35Q15286 AL121821.2-201ENST00000556081 394 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RAB35Q15286 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
RAB35Q15286 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RAB35Q15286 NRBF2P1-201ENST00000587407 859 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RAB35Q15286 AC110760.3-201ENST00000598794 467 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RAB35Q15286 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RAB35Q15286 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RAB35Q15286 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
RAB35Q15286 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RAB35Q15286 AC104237.2-201ENST00000612456 443 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RAB35Q15286 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
RAB35Q15286 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RAB35Q15286 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
RAB35Q15286 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
RAB35Q15286 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
RAB35Q15286 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
RAB35Q15286 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
RAB35Q15286 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
RAB35Q15286 ELL2P3-201ENST00000457883 1602 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RAB35Q15286 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RAB35Q15286 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RAB35Q15286 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RAB35Q15286 Y_RNA.201-201ENST00000364052 96 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RAB35Q15286 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RAB35Q15286 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
RAB35Q15286 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RAB35Q15286 LINC00301-202ENST00000412599 772 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
RAB35Q15286 USP9YP6-201ENST00000413550 854 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RAB35Q15286 AC002456.1-201ENST00000415965 317 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
RAB35Q15286 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
RAB35Q15286 RPL31P35-201ENST00000431058 377 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RAB35Q15286 MTATP6P16-201ENST00000434543 526 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RAB35Q15286 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RAB35Q15286 AC244505.5-201ENST00000443639 207 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RAB35Q15286 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
RAB35Q15286 USP9YP29-201ENST00000445112 563 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RAB35Q15286 LINC01069-201ENST00000452933 546 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
RAB35Q15286 AC022447.1-201ENST00000515358 464 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RAB35Q15286 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RAB35Q15286 Y_RNA.695-201ENST00000516715 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RAB35Q15286 SMIM18-201ENST00000517349 905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
RAB35Q15286 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
RAB35Q15286 LINC02545-201ENST00000525381 306 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
RAB35Q15286 ZNF84-205ENST00000535439 647 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
RAB35Q15286 ADI1P3-201ENST00000549509 470 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RAB35Q15286 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
RAB35Q15286 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RAB35Q15286 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RAB35Q15286 AL022154.1-201ENST00000604698 785 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RAB35Q15286 AL139286.2-201ENST00000606838 396 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RAB35Q15286 AC116312.1-201ENST00000606841 314 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RAB35Q15286 AC126118.1-201ENST00000607744 628 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RAB35Q15286 AL161734.1-201ENST00000609720 557 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RAB35Q15286 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RAB35Q15286 AC024940.5-201ENST00000622889 474 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RAB35Q15286 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
RAB35Q15286 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RAB35Q15286 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
RAB35Q15286 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
RAB35Q15286 ANKRD36BP1-202ENST00000604892 1417 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RAB35Q15286 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
RAB35Q15286 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
RAB35Q15286 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RAB35Q15286 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RAB35Q15286 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RAB35Q15286 AL356057.3-201ENST00000402607 340 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RAB35Q15286 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
RAB35Q15286 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.5 ms