Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 TIMM9-203ENST00000555061 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
NCF4Q15080 AC018554.1-201ENST00000565506 800 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
NCF4Q15080 MIR544B-201ENST00000582372 78 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
NCF4Q15080 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
NCF4Q15080 AC068276.1-201ENST00000605793 379 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
NCF4Q15080 AL356596.1-201ENST00000624230 379 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
NCF4Q15080 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
NCF4Q15080 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
NCF4Q15080 RABGGTB-202ENST00000370826 512 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
NCF4Q15080 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
NCF4Q15080 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
NCF4Q15080 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
NCF4Q15080 USP9YP6-201ENST00000413550 854 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
NCF4Q15080 VPS26BP1-201ENST00000417155 755 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
NCF4Q15080 AC017048.2-201ENST00000431455 822 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
NCF4Q15080 AL356124.2-201ENST00000442449 391 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
NCF4Q15080 CHODL-AS1-201ENST00000447175 1117 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
NCF4Q15080 AL135787.1-201ENST00000450154 302 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
NCF4Q15080 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
NCF4Q15080 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
NCF4Q15080 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
NCF4Q15080 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
NCF4Q15080 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
NCF4Q15080 AF213884.2-201ENST00000510417 903 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
NCF4Q15080 CD44-AS1-201ENST00000528869 587 ntTSL 4 BASIC1.95□□□□□ -2.1
NCF4Q15080 DEFB108A-201ENST00000530110 222 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
NCF4Q15080 AC068587.4-201ENST00000533893 186 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
NCF4Q15080 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
NCF4Q15080 AC008147.1-201ENST00000551284 325 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
NCF4Q15080 BNIP3P23-201ENST00000599655 511 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
NCF4Q15080 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
NCF4Q15080 AC025811.1-201ENST00000604312 472 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
NCF4Q15080 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
NCF4Q15080 AL139022.2-201ENST00000606934 443 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
NCF4Q15080 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
NCF4Q15080 AC013470.2-206ENST00000636804 771 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
NCF4Q15080 AC006927.4-201ENST00000639187 543 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
NCF4Q15080 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
NCF4Q15080 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
NCF4Q15080 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
NCF4Q15080 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
NCF4Q15080 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
NCF4Q15080 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
NCF4Q15080 RNU6-83P-201ENST00000384568 112 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
NCF4Q15080 RNU6-925P-201ENST00000384629 104 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
NCF4Q15080 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
NCF4Q15080 AP000432.1-201ENST00000416641 516 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
NCF4Q15080 GPC5-IT1-201ENST00000416664 658 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
NCF4Q15080 MTCO2P21-201ENST00000419780 677 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
NCF4Q15080 AL157786.1-206ENST00000424422 551 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
NCF4Q15080 LARP1BP3-201ENST00000437229 869 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
NCF4Q15080 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
NCF4Q15080 MTND4P25-201ENST00000441039 533 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
NCF4Q15080 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
NCF4Q15080 RPL7P12-201ENST00000446719 750 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
NCF4Q15080 AL157373.1-201ENST00000456036 276 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
NCF4Q15080 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
NCF4Q15080 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
NCF4Q15080 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
NCF4Q15080 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
NCF4Q15080 DUXAP1-201ENST00000556632 463 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
NCF4Q15080 MTND1P8-201ENST00000571424 950 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
NCF4Q15080 AL513324.1-201ENST00000575236 632 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
NCF4Q15080 AC009974.1-201ENST00000608881 455 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
NCF4Q15080 AC103710.2-201ENST00000609912 942 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
NCF4Q15080 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
NCF4Q15080 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
NCF4Q15080 ZNF736P9Y-201ENST00000439586 1345 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
NCF4Q15080 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
NCF4Q15080 RNU6-931P-201ENST00000363850 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
NCF4Q15080 RNU5A-8P-201ENST00000364102 114 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
NCF4Q15080 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
NCF4Q15080 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
NCF4Q15080 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.93□□□□□ -2.1
NCF4Q15080 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
NCF4Q15080 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
NCF4Q15080 LINC00397-201ENST00000422074 344 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
NCF4Q15080 AL391336.1-201ENST00000424678 484 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
NCF4Q15080 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
NCF4Q15080 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
NCF4Q15080 LINC02195-201ENST00000443373 294 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
NCF4Q15080 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
NCF4Q15080 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
NCF4Q15080 RPL23AP35-201ENST00000451906 501 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
NCF4Q15080 AC010976.1-211ENST00000454503 644 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
NCF4Q15080 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
NCF4Q15080 AC022272.1-201ENST00000503478 777 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
NCF4Q15080 AC026780.2-201ENST00000503489 730 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
NCF4Q15080 AC082650.1-201ENST00000503542 575 ntTSL 4 BASIC1.93□□□□□ -2.1
NCF4Q15080 MTND4P2-201ENST00000507767 1203 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
NCF4Q15080 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
NCF4Q15080 MRPS33P3-201ENST00000513456 322 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
NCF4Q15080 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC1.93□□□□□ -2.1
NCF4Q15080 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
NCF4Q15080 AC018541.1-202ENST00000518687 584 ntTSL 4 BASIC1.93□□□□□ -2.1
NCF4Q15080 AP004247.1-201ENST00000531556 1289 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
NCF4Q15080 AC013828.2-201ENST00000532487 235 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
NCF4Q15080 AP000462.2-203ENST00000540545 715 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
NCF4Q15080 ANP32BP3-201ENST00000559213 706 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
NCF4Q15080 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.3 ms