Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SMCO1Q147U7 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SMCO1Q147U7 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SMCO1Q147U7 AC093772.1-201ENST00000513519 506 ntTSL 2 BASIC0.85□□□□□ -2.27
SMCO1Q147U7 AC010261.1-201ENST00000514411 457 ntTSL 5 BASIC0.85□□□□□ -2.27
SMCO1Q147U7 AP003730.2-202ENST00000527281 774 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
SMCO1Q147U7 ZNF84-205ENST00000535439 647 ntTSL 5 BASIC0.85□□□□□ -2.27
SMCO1Q147U7 AC021549.1-201ENST00000580937 433 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
SMCO1Q147U7 BNIP3P19-201ENST00000605397 577 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SMCO1Q147U7 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SMCO1Q147U7 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SMCO1Q147U7 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SMCO1Q147U7 SPHAR-201ENST00000366688 648 ntAPPRIS P1 BASIC0.84□□□□□ -2.27
SMCO1Q147U7 RNU1-39P-201ENST00000383897 165 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SMCO1Q147U7 RNU6-657P-201ENST00000383904 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SMCO1Q147U7 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SMCO1Q147U7 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SMCO1Q147U7 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC0.84□□□□□ -2.27
SMCO1Q147U7 MTCO1P57-201ENST00000432182 261 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SMCO1Q147U7 AL360169.1-201ENST00000435116 143 ntTSL 5 BASIC0.84□□□□□ -2.27
SMCO1Q147U7 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SMCO1Q147U7 GDI2P2-201ENST00000445131 608 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SMCO1Q147U7 COX6CP18-201ENST00000448769 222 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SMCO1Q147U7 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SMCO1Q147U7 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SMCO1Q147U7 CECR9-201ENST00000453421 199 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SMCO1Q147U7 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SMCO1Q147U7 AC109927.2-201ENST00000506416 303 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SMCO1Q147U7 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC0.84□□□□□ -2.27
SMCO1Q147U7 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SMCO1Q147U7 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SMCO1Q147U7 LINC00557-201ENST00000563184 1279 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SMCO1Q147U7 AP001542.2-201ENST00000593141 364 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SMCO1Q147U7 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SMCO1Q147U7 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SMCO1Q147U7 AL590396.4-201ENST00000636779 956 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SMCO1Q147U7 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.83□□□□□ -2.28
SMCO1Q147U7 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SMCO1Q147U7 AKR1C1-201ENST00000380859 858 ntTSL 3 BASIC0.83□□□□□ -2.28
SMCO1Q147U7 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SMCO1Q147U7 AL136133.1-201ENST00000413694 376 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SMCO1Q147U7 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SMCO1Q147U7 AL139118.1-201ENST00000432707 446 ntTSL 3 BASIC0.83□□□□□ -2.28
SMCO1Q147U7 RPS15AP9-201ENST00000439856 381 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SMCO1Q147U7 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SMCO1Q147U7 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SMCO1Q147U7 RNU6-885P-201ENST00000516607 104 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SMCO1Q147U7 RNA5SP135-201ENST00000517019 125 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SMCO1Q147U7 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SMCO1Q147U7 SMIM18-201ENST00000517349 905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.83□□□□□ -2.28
SMCO1Q147U7 AC087439.1-201ENST00000517920 398 ntTSL 3 BASIC0.83□□□□□ -2.28
SMCO1Q147U7 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SMCO1Q147U7 AC078880.1-201ENST00000546696 553 ntTSL 4 BASIC0.83□□□□□ -2.28
SMCO1Q147U7 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SMCO1Q147U7 AC091132.5-202ENST00000587078 501 ntTSL 3 BASIC0.83□□□□□ -2.28
SMCO1Q147U7 AC073544.2-201ENST00000601155 540 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SMCO1Q147U7 AC011451.2-201ENST00000604303 598 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SMCO1Q147U7 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SMCO1Q147U7 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SMCO1Q147U7 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SMCO1Q147U7 AL118556.2-201ENST00000614375 824 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SMCO1Q147U7 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SMCO1Q147U7 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SMCO1Q147U7 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC0.83□□□□□ -2.28
SMCO1Q147U7 AC080188.3-201ENST00000624842 748 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SMCO1Q147U7 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.83□□□□□ -2.28
SMCO1Q147U7 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC0.82□□□□□ -2.28
SMCO1Q147U7 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SMCO1Q147U7 TXNDC8-202ENST00000374510 455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.82□□□□□ -2.28
SMCO1Q147U7 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC0.82□□□□□ -2.28
SMCO1Q147U7 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SMCO1Q147U7 RNU2-28P-201ENST00000410457 189 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SMCO1Q147U7 AL049637.1-201ENST00000424664 503 ntTSL 5 BASIC0.82□□□□□ -2.28
SMCO1Q147U7 RAC1P8-201ENST00000427086 527 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SMCO1Q147U7 MTND3P4-201ENST00000453537 303 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SMCO1Q147U7 AC021382.1-201ENST00000483523 359 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SMCO1Q147U7 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC0.82□□□□□ -2.28
SMCO1Q147U7 RNU6-760P-201ENST00000516078 97 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SMCO1Q147U7 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SMCO1Q147U7 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC0.82□□□□□ -2.28
SMCO1Q147U7 NIFKP8-201ENST00000560500 874 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SMCO1Q147U7 AC026474.1-201ENST00000562422 428 ntTSL 2 BASIC0.82□□□□□ -2.28
SMCO1Q147U7 AC004160.1-210ENST00000599875 689 ntTSL 5 BASIC0.82□□□□□ -2.28
SMCO1Q147U7 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SMCO1Q147U7 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SMCO1Q147U7 AC010894.2-203ENST00000606406 499 ntTSL 3 BASIC0.82□□□□□ -2.28
SMCO1Q147U7 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC0.82□□□□□ -2.28
SMCO1Q147U7 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SMCO1Q147U7 U6.101-201ENST00000637707 76 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SMCO1Q147U7 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.82□□□□□ -2.28
SMCO1Q147U7 DBF4P1-201ENST00000412976 1892 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SMCO1Q147U7 MTND5P11-201ENST00000511037 1812 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SMCO1Q147U7 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SMCO1Q147U7 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SMCO1Q147U7 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SMCO1Q147U7 AC069282.1-201ENST00000411911 526 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SMCO1Q147U7 LUZP4P1-201ENST00000415420 344 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SMCO1Q147U7 AC104653.2-201ENST00000435407 416 ntTSL 3 BASIC0.81□□□□□ -2.28
SMCO1Q147U7 AC007003.1-202ENST00000439318 349 ntTSL 5 BASIC0.81□□□□□ -2.28
SMCO1Q147U7 AC092001.1-201ENST00000453012 261 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
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