Protein–RNA interactions for Protein: Q14541

HNF4G, Hepatocyte nuclear factor 4-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF4GQ14541 AC007631.1-201ENST00000578545 189 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
HNF4GQ14541 AC093227.2-201ENST00000589357 285 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
HNF4GQ14541 KLKP1-201ENST00000595979 403 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
HNF4GQ14541 SNORA62.6-201ENST00000606322 83 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
HNF4GQ14541 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
HNF4GQ14541 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
HNF4GQ14541 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
HNF4GQ14541 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
HNF4GQ14541 KNL1-202ENST00000399668 7607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
HNF4GQ14541 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
HNF4GQ14541 ZNF99-201ENST00000397104 3114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
HNF4GQ14541 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
HNF4GQ14541 RTN4-208ENST00000404909 4102 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
HNF4GQ14541 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HNF4GQ14541 AF117829.1-206ENST00000621883 3802 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HNF4GQ14541 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HNF4GQ14541 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
HNF4GQ14541 FMNL2-202ENST00000475377 3648 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
HNF4GQ14541 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HNF4GQ14541 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
HNF4GQ14541 MIR554-201ENST00000384874 96 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HNF4GQ14541 RNA5SP424-201ENST00000390988 115 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HNF4GQ14541 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HNF4GQ14541 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HNF4GQ14541 AC074085.1-201ENST00000413598 418 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HNF4GQ14541 AC006989.1-201ENST00000427212 131 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HNF4GQ14541 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HNF4GQ14541 GOT2P5-201ENST00000433995 546 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HNF4GQ14541 AL138900.2-201ENST00000434098 156 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
HNF4GQ14541 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
HNF4GQ14541 MRPS31P2-201ENST00000451581 518 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HNF4GQ14541 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HNF4GQ14541 RN7SL283P-201ENST00000489055 303 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HNF4GQ14541 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HNF4GQ14541 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
HNF4GQ14541 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HNF4GQ14541 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HNF4GQ14541 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HNF4GQ14541 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HNF4GQ14541 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
HNF4GQ14541 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
HNF4GQ14541 AC093515.1-201ENST00000567103 445 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
HNF4GQ14541 AC007151.1-201ENST00000572774 483 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HNF4GQ14541 AC138761.3-201ENST00000579993 334 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HNF4GQ14541 AC098617.1-215ENST00000594798 1152 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
HNF4GQ14541 AC245389.1-201ENST00000605141 529 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HNF4GQ14541 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HNF4GQ14541 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HNF4GQ14541 SNORD39.4-201ENST00000620099 78 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HNF4GQ14541 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HNF4GQ14541 SEPT14P19-202ENST00000632397 370 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
HNF4GQ14541 CCNYL2-203ENST00000638057 730 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
HNF4GQ14541 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HNF4GQ14541 MS4A1-212ENST00000534668 3475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
HNF4GQ14541 PRKACB-217ENST00000610457 4206 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
HNF4GQ14541 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HNF4GQ14541 AL049641.1-201ENST00000441055 1948 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HNF4GQ14541 RNF17-204ENST00000339524 2203 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HNF4GQ14541 IQCH-201ENST00000335894 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
HNF4GQ14541 LINC00862-202ENST00000367356 759 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HNF4GQ14541 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HNF4GQ14541 PVALB-202ENST00000404171 422 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HNF4GQ14541 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HNF4GQ14541 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HNF4GQ14541 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HNF4GQ14541 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HNF4GQ14541 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HNF4GQ14541 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HNF4GQ14541 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HNF4GQ14541 AL445584.1-201ENST00000431451 330 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HNF4GQ14541 AC090617.2-201ENST00000433167 404 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HNF4GQ14541 RPS3AP52-201ENST00000435639 297 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HNF4GQ14541 LINC01628-201ENST00000444266 397 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HNF4GQ14541 LINC00302-201ENST00000444515 302 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
HNF4GQ14541 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HNF4GQ14541 NDUFAF4P3-201ENST00000456468 525 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HNF4GQ14541 AL136097.2-201ENST00000457003 333 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HNF4GQ14541 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HNF4GQ14541 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HNF4GQ14541 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HNF4GQ14541 AC026780.2-201ENST00000503489 730 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HNF4GQ14541 NDUFB9P3-201ENST00000521269 501 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HNF4GQ14541 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HNF4GQ14541 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HNF4GQ14541 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HNF4GQ14541 AL670379.10-201ENST00000604330 253 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HNF4GQ14541 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HNF4GQ14541 APOOP1-201ENST00000604695 592 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HNF4GQ14541 AL670379.9-201ENST00000605428 253 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HNF4GQ14541 TEX41-280ENST00000629185 591 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HNF4GQ14541 TOPORSLP1-203ENST00000493279 2871 ntTSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HNF4GQ14541 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HNF4GQ14541 ZNF99-202ENST00000596209 7817 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HNF4GQ14541 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HNF4GQ14541 SAMD3-214ENST00000532763 3690 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
HNF4GQ14541 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
HNF4GQ14541 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
HNF4GQ14541 PHTF2-201ENST00000248550 4778 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
HNF4GQ14541 DOCK7-202ENST00000340370 6731 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
HNF4GQ14541 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.5 ms