Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SCARB2Q14108 SNORA26.8-201ENST00000391306 124 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SCARB2Q14108 AC005162.2-201ENST00000411479 578 ntTSL 4 BASIC2.58□□□□□ -2
SCARB2Q14108 AC107081.1-201ENST00000414975 361 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SCARB2Q14108 C1DP2-201ENST00000418167 426 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SCARB2Q14108 AL160272.1-201ENST00000421509 521 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
SCARB2Q14108 AL109947.1-201ENST00000423747 382 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
SCARB2Q14108 AC064852.1-201ENST00000427571 851 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
SCARB2Q14108 AL078581.2-201ENST00000446392 378 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
SCARB2Q14108 AL158210.1-201ENST00000448835 500 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
SCARB2Q14108 RNA5SP269-201ENST00000459032 137 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SCARB2Q14108 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
SCARB2Q14108 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
SCARB2Q14108 AC117522.3-201ENST00000507974 584 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SCARB2Q14108 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SCARB2Q14108 AC119751.5-201ENST00000514077 770 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SCARB2Q14108 MTCYBP20-201ENST00000524239 1129 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SCARB2Q14108 AP001646.1-201ENST00000527936 915 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SCARB2Q14108 AC239802.1-201ENST00000531288 406 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
SCARB2Q14108 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SCARB2Q14108 AC008083.3-201ENST00000547777 329 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
SCARB2Q14108 AL138976.2-201ENST00000563989 694 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SCARB2Q14108 AC025678.1-201ENST00000567861 338 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SCARB2Q14108 MIR4444-1-201ENST00000581696 74 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SCARB2Q14108 MIR4444-2-201ENST00000584390 74 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SCARB2Q14108 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SCARB2Q14108 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SCARB2Q14108 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SCARB2Q14108 AP003485.2-201ENST00000623636 610 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SCARB2Q14108 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
SCARB2Q14108 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
SCARB2Q14108 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SCARB2Q14108 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
SCARB2Q14108 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
SCARB2Q14108 RNU4-21P-201ENST00000362802 126 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SCARB2Q14108 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SCARB2Q14108 AL138885.1-201ENST00000405921 675 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SCARB2Q14108 NUP35P1-201ENST00000422734 947 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SCARB2Q14108 AC092447.3-201ENST00000426027 686 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SCARB2Q14108 GPR143P-201ENST00000434155 205 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SCARB2Q14108 AC112518.1-201ENST00000436089 575 ntTSL 4 BASIC2.57□□□□□ -2
SCARB2Q14108 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
SCARB2Q14108 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SCARB2Q14108 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SCARB2Q14108 KLF3P2-201ENST00000465138 268 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SCARB2Q14108 Z84488.1-201ENST00000476099 530 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
SCARB2Q14108 FSBP-201ENST00000481490 1158 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
SCARB2Q14108 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SCARB2Q14108 AC063919.1-201ENST00000514281 254 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
SCARB2Q14108 RNU6-1220P-201ENST00000517126 108 ntBASIC2.57□□□□□ -2
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SCARB2Q14108 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SCARB2Q14108 AC008741.1-201ENST00000569456 510 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
SCARB2Q14108 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
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SCARB2Q14108 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SCARB2Q14108 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SCARB2Q14108 ANKRD20A17P-201ENST00000511745 1330 ntBASIC2.57□□□□□ -2
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SCARB2Q14108 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
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SCARB2Q14108 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SCARB2Q14108 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SCARB2Q14108 RAP1BP3-201ENST00000407180 549 ntBASIC2.56□□□□□ -2
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SCARB2Q14108 SNORA74D-201ENST00000516404 141 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SCARB2Q14108 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
SCARB2Q14108 AC136619.2-201ENST00000563361 631 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SCARB2Q14108 MIR4429-201ENST00000580105 73 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SCARB2Q14108 AC245014.2-201ENST00000603689 287 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SCARB2Q14108 AC246785.4-201ENST00000605374 287 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SCARB2Q14108 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SCARB2Q14108 TIMM9-202ENST00000395159 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
SCARB2Q14108 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SCARB2Q14108 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SCARB2Q14108 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SCARB2Q14108 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
SCARB2Q14108 CASP3-203ENST00000393588 677 ntTSL 4 BASIC2.55□□□□□ -2
SCARB2Q14108 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SCARB2Q14108 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SCARB2Q14108 AL663023.1-201ENST00000412932 853 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
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