| RUNX2 | Q13950 | AC007631.1-201 | ENST00000578545 | 189 nt | TSL 3 BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | NRBF2P5-201 | ENST00000603087 | 788 nt | BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC012119.1-201 | ENST00000603184 | 222 nt | BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC080078.1-201 | ENST00000603643 | 410 nt | TSL 3 BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC007179.3-201 | ENST00000604976 | 235 nt | BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | KCNQ1OT1_3.1-201 | ENST00000616504 | 116 nt | BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC010722.1-201 | ENST00000622595 | 582 nt | TSL 5 BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC090617.10-201 | ENST00000624308 | 134 nt | BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC099654.14-201 | ENST00000638599 | 341 nt | BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ARHGAP12-201 | ENST00000311380 | 4625 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | CASC19-280 | ENST00000642102 | 1351 nt | BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | HTR2B-201 | ENST00000258400 | 2246 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RICTOR-201 | ENST00000296782 | 7505 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.07 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AGTR1-204 | ENST00000418473 | 2071 nt | TSL 5 BASIC | 3.07 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | NBPF20-201 | ENST00000369373 | 18760 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 3.07 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | GMFB-208 | ENST00000554908 | 6721 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.07 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | PHF3-202 | ENST00000393387 | 6947 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.07 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | KRTAP15-1-201 | ENST00000334067 | 671 nt | APPRIS P1 BASIC | 3.07 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.88-201 | ENST00000363029 | 99 nt | BASIC | 3.07 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-799P-201 | ENST00000363567 | 107 nt | BASIC | 3.07 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-884P-201 | ENST00000363889 | 107 nt | BASIC | 3.07 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Z98749.2-208 | ENST00000381646 | 500 nt | BASIC | 3.07 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNY3P14-201 | ENST00000384309 | 102 nt | BASIC | 3.07 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-166P-201 | ENST00000384371 | 107 nt | BASIC | 3.07 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL356776.1-201 | ENST00000406574 | 447 nt | BASIC | 3.07 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU2-3P-201 | ENST00000410144 | 191 nt | BASIC | 3.07 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNA5SP120-201 | ENST00000410900 | 112 nt | BASIC | 3.07 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL592148.1-201 | ENST00000413568 | 445 nt | BASIC | 3.07 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC062039.1-201 | ENST00000414394 | 565 nt | TSL 2 BASIC | 3.07 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RPL26P27-201 | ENST00000414397 | 437 nt | BASIC | 3.07 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL353621.1-201 | ENST00000418219 | 243 nt | BASIC | 3.07 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL139413.1-201 | ENST00000421309 | 217 nt | BASIC | 3.07 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LINC01402-201 | ENST00000422226 | 279 nt | TSL 3 BASIC | 3.07 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC241644.2-201 | ENST00000426504 | 480 nt | TSL 3 BASIC | 3.07 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | HMGB1P9-201 | ENST00000429856 | 646 nt | BASIC | 3.07 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL451060.1-203 | ENST00000431307 | 362 nt | TSL 3 BASIC | 3.07 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | CST9LP2-201 | ENST00000437612 | 320 nt | BASIC | 3.07 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MTATP6P23-201 | ENST00000440153 | 476 nt | BASIC | 3.07 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | BRK1P2-201 | ENST00000442875 | 223 nt | BASIC | 3.07 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MYCBP2-AS1-203 | ENST00000450627 | 349 nt | TSL 3 BASIC | 3.07 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MTATP6P7-201 | ENST00000453315 | 681 nt | BASIC | 3.07 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-1208P-201 | ENST00000459588 | 107 nt | BASIC | 3.07 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | DYNLL1P5-201 | ENST00000467158 | 270 nt | BASIC | 3.07 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | TRBV1-201 | ENST00000476502 | 284 nt | BASIC | 3.07 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RPS29P20-201 | ENST00000489592 | 171 nt | BASIC | 3.07 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MTCO2P30-201 | ENST00000503662 | 364 nt | BASIC | 3.07 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC114786.4-201 | ENST00000508771 | 728 nt | BASIC | 3.07 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC016556.1-201 | ENST00000510004 | 935 nt | TSL 2 BASIC | 3.07 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC008716.1-201 | ENST00000511084 | 513 nt | BASIC | 3.07 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LINC02122-201 | ENST00000511395 | 577 nt | TSL 4 BASIC | 3.07 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU4ATAC3P-201 | ENST00000516699 | 126 nt | BASIC | 3.07 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORA31.19-201 | ENST00000517079 | 126 nt | BASIC | 3.07 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | OR56A5-202 | ENST00000532411 | 942 nt | APPRIS P1 BASIC | 3.07 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AP000790.2-201 | ENST00000534388 | 522 nt | TSL 3 BASIC | 3.07 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | TRAV37-201 | ENST00000553906 | 342 nt | BASIC | 3.07 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL512791.1-201 | ENST00000555853 | 300 nt | TSL 3 BASIC | 3.07 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LRRC37A5P-203 | ENST00000580181 | 585 nt | BASIC | 3.07 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL355598.1-201 | ENST00000604169 | 202 nt | BASIC | 3.07 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | NUTF2P8-201 | ENST00000604593 | 363 nt | BASIC | 3.07 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC073657.2-201 | ENST00000605661 | 303 nt | BASIC | 3.07 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC092807.2-201 | ENST00000609367 | 243 nt | BASIC | 3.07 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC022418.1-201 | ENST00000624118 | 445 nt | BASIC | 3.07 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MTND5P1-201 | ENST00000445440 | 1375 nt | BASIC | 3.07 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MTND4P35-201 | ENST00000604257 | 1375 nt | BASIC | 3.07 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | THOC2-201 | ENST00000245838 | 5609 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 3.07 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | DMD-201 | ENST00000288447 | 3856 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.07 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SRP72P2-201 | ENST00000344851 | 1979 nt | BASIC | 3.07 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ROCK2-203 | ENST00000401753 | 4017 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.07 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MUC7-202 | ENST00000413702 | 2540 nt | APPRIS P2 TSL 4 BASIC | 3.07 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | FAP-201 | ENST00000188790 | 2780 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 3.06 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | NEB-218 | ENST00000603639 | 25578 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 3.06 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | NEB-219 | ENST00000604864 | 25578 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 3.06 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-384P-201 | ENST00000364900 | 104 nt | BASIC | 3.06 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SPRR2E-201 | ENST00000368750 | 678 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.06 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | BTLA-202 | ENST00000383680 | 726 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 3.06 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU1-73P-201 | ENST00000383971 | 164 nt | BASIC | 3.06 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | TRAJ31-201 | ENST00000390506 | 57 nt | APPRIS P1 BASIC | 3.06 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU1-101P-201 | ENST00000391171 | 127 nt | BASIC | 3.06 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNA5SP31-201 | ENST00000411144 | 127 nt | BASIC | 3.06 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-607P-201 | ENST00000411283 | 108 nt | BASIC | 3.06 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | CYCSP33-201 | ENST00000414485 | 327 nt | BASIC | 3.06 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC016710.1-201 | ENST00000421326 | 466 nt | TSL 3 BASIC | 3.06 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL500522.1-201 | ENST00000423667 | 318 nt | TSL 3 BASIC | 3.06 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC098614.2-201 | ENST00000426040 | 255 nt | BASIC | 3.06 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL355314.2-201 | ENST00000427182 | 436 nt | TSL 3 BASIC | 3.06 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL121601.2-201 | ENST00000438019 | 707 nt | BASIC | 3.06 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | CYCSP32-201 | ENST00000440548 | 321 nt | BASIC | 3.06 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | IGKV1OR-3-201 | ENST00000446944 | 348 nt | BASIC | 3.06 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL441989.1-201 | ENST00000454204 | 382 nt | TSL 3 BASIC | 3.06 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | HMGN1P18-201 | ENST00000457642 | 277 nt | BASIC | 3.06 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LINC02269-201 | ENST00000509968 | 511 nt | TSL 3 BASIC | 3.06 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | KLRA1P-202 | ENST00000510134 | 1410 nt | TSL 5 BASIC | 3.06 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC034223.1-201 | ENST00000511054 | 599 nt | TSL 3 BASIC | 3.06 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC114316.1-201 | ENST00000511323 | 278 nt | TSL 5 BASIC | 3.06 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC074344.1-201 | ENST00000512823 | 224 nt | BASIC | 3.06 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | IGHV3-76-201 | ENST00000522465 | 295 nt | BASIC | 3.06 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MS4A4E-206 | ENST00000528394 | 555 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.06 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | UEVLD-208 | ENST00000535484 | 1963 nt | TSL 2 BASIC | 3.06 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC023050.3-201 | ENST00000541142 | 333 nt | BASIC | 3.06 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR2682-201 | ENST00000580305 | 110 nt | BASIC | 3.06 | □□□□□ -1.92 | | |