Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 AC016553.1-201ENST00000513283 249 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 AC090136.1-201ENST00000520009 240 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 AP005597.4-201ENST00000526762 229 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 AC069029.1-201ENST00000558736 263 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 AC034105.4-201ENST00000568304 277 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 CR392039.5-201ENST00000623201 510 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 RNF38-203ENST00000353739 4945 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 FOXP2-224ENST00000635534 4290 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 RNF17-201ENST00000255324 5119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 RTN4-208ENST00000404909 4102 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 ZNF99-201ENST00000397104 3114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 BIRC3-201ENST00000263464 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 RNA5SP31-201ENST00000411144 127 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 AL035423.1-201ENST00000420331 213 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 AC005019.1-201ENST00000436455 431 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 RPS3AP46-201ENST00000448352 682 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 AL133547.1-201ENST00000448546 220 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 RNU7-66P-201ENST00000459469 62 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 RPL7P47-201ENST00000497299 556 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 AC024022.1-202ENST00000508911 394 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 BMPR1B-AS1-201ENST00000510795 511 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 RN7SKP18-201ENST00000516005 275 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 AC012186.2-201ENST00000569353 321 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 ZNF562-205ENST00000587392 583 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 AC009271.1-202ENST00000588803 492 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 AC024220.1-201ENST00000603675 484 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 AL670379.10-201ENST00000604330 253 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 AC110741.2-201ENST00000605278 268 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 AL670379.9-201ENST00000605428 253 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 AC104237.2-201ENST00000612456 443 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 MSANTD4-206ENST00000617528 508 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 MAP3K7-202ENST00000369325 4633 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 GABRG2-213ENST00000639046 3058 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 LINC01094-203ENST00000504675 1985 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 MTUS1-228ENST00000544260 3650 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 RNF17-204ENST00000339524 2203 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 PAPOLA-202ENST00000392990 2588 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 RAD17-202ENST00000305138 3164 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 WRN-201ENST00000298139 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 KCNJ16-203ENST00000392671 3981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 U8.11-201ENST00000384699 133 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 U8.12-201ENST00000384701 133 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 AL159169.1-201ENST00000421119 127 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 U8.18-201ENST00000459285 133 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 AC008011.1-201ENST00000545989 227 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 AC027288.1-203ENST00000552167 567 ntTSL 4 BASIC3.64□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 hsa-mir-3119-1.1-201ENST00000577602 85 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC3.64□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 AC244205.2-202ENST00000635781 342 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 THOC1-219ENST00000616322 2078 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 ABCA5-208ENST00000588877 6525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 RNF6-201ENST00000346166 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 NDST4-201ENST00000264363 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 PLPPR4-201ENST00000370184 4505 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 SYNE1-207ENST00000367255 27748 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 TLR8-202ENST00000311912 3367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 MIR423-201ENST00000362201 94 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
GTF2H3Q13889 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.2 ms