Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 BCL2L15-203ENST00000393320 276 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 LURAP1L-AS1-201ENST00000417638 799 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 AC006366.1-201ENST00000422002 759 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 HMGB3P12-201ENST00000438745 556 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 ZNF736P5Y-201ENST00000451173 805 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 AL160287.1-201ENST00000455612 432 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 PMCHL2-203ENST00000457791 237 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 GTF2IP9-201ENST00000502460 301 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 FAM92A1P2-202ENST00000504766 877 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 MTND4P2-201ENST00000507767 1203 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 AC023866.1-201ENST00000518064 579 ntTSL 4 BASIC2.05□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 AC027701.1-201ENST00000520155 823 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 AC090796.1-201ENST00000520370 567 ntTSL 4 BASIC2.05□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 FAM92A1P1-201ENST00000528023 890 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 LINC02235-201ENST00000534675 466 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 AC084756.1-201ENST00000558237 606 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 MIR4307-201ENST00000582802 84 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 AC099566.1-211ENST00000595188 737 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 AC106052.1-201ENST00000608029 497 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 AC093591.3-201ENST00000634516 308 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC2.05□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 CKAP2P1-201ENST00000555477 2049 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 RNU6-157P-201ENST00000383957 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 MTCO2P21-201ENST00000419780 677 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 AL596220.1-202ENST00000429768 314 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 AL590399.3-201ENST00000438072 543 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 AC114485.1-201ENST00000447916 657 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 AC093899.1-201ENST00000457984 376 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 AL139824.2-201ENST00000458731 1095 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 MTND4P16-201ENST00000466108 1367 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 PCAT4-202ENST00000514836 373 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 RNU6-1092P-201ENST00000516955 87 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 AL031716.1-201ENST00000569106 530 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 LINC01893-201ENST00000581750 479 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 AC021755.4-201ENST00000616620 456 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 MT-ND4L-201ENST00000361335 297 ntAPPRIS P1 BASIC2.03□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 RNU5E-1-201ENST00000362477 120 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 AL139413.1-201ENST00000421309 217 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 LINC01674-201ENST00000427446 504 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 DNAJC19P4-201ENST00000440115 345 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 AC073174.1-201ENST00000444155 415 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 LINC01758-201ENST00000448001 458 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 AC109927.2-201ENST00000506416 303 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 AC078778.1-201ENST00000547177 735 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 LINC02464-201ENST00000552060 368 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 AL049838.1-201ENST00000563647 981 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 LINC01899-202ENST00000583756 575 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 AP000860.1-201ENST00000605250 559 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
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