Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
NEUROD1Q13562 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
NEUROD1Q13562 NDUFB1P1-201ENST00000435191 180 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
NEUROD1Q13562 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
NEUROD1Q13562 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
NEUROD1Q13562 FTH1P2-201ENST00000466086 412 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
NEUROD1Q13562 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
NEUROD1Q13562 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
NEUROD1Q13562 AC104393.1-201ENST00000517495 255 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
NEUROD1Q13562 AC005740.3-201ENST00000520882 344 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
NEUROD1Q13562 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
NEUROD1Q13562 MEG8-215ENST00000555354 469 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
NEUROD1Q13562 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
NEUROD1Q13562 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
NEUROD1Q13562 RNVU1-4-201ENST00000612985 164 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
NEUROD1Q13562 DOCK7-201ENST00000251157 7084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
NEUROD1Q13562 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
NEUROD1Q13562 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
NEUROD1Q13562 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
NEUROD1Q13562 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
NEUROD1Q13562 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
NEUROD1Q13562 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
NEUROD1Q13562 TRAJ18-201ENST00000390519 66 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
NEUROD1Q13562 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
NEUROD1Q13562 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
NEUROD1Q13562 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
NEUROD1Q13562 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
NEUROD1Q13562 AC017083.1-201ENST00000428093 483 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
NEUROD1Q13562 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
NEUROD1Q13562 AL359073.1-201ENST00000448036 403 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
NEUROD1Q13562 PPIAP3-201ENST00000450588 505 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
NEUROD1Q13562 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
NEUROD1Q13562 RPS27AP1-201ENST00000475545 471 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
NEUROD1Q13562 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
NEUROD1Q13562 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
NEUROD1Q13562 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
NEUROD1Q13562 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
NEUROD1Q13562 SGMS2-201ENST00000359079 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
NEUROD1Q13562 GPR34-202ENST00000378142 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
NEUROD1Q13562 ANGPTL1-202ENST00000367629 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
NEUROD1Q13562 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
NEUROD1Q13562 SNORA57.3-201ENST00000411095 141 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
NEUROD1Q13562 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
NEUROD1Q13562 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
NEUROD1Q13562 SYF2P2-201ENST00000417620 583 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
NEUROD1Q13562 TAB3-AS1-201ENST00000428263 245 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
NEUROD1Q13562 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
NEUROD1Q13562 AL445490.2-201ENST00000440492 441 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
NEUROD1Q13562 AC022431.1-201ENST00000450941 438 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
NEUROD1Q13562 AC087385.1-201ENST00000475062 312 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
NEUROD1Q13562 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
NEUROD1Q13562 MTCO3P44-201ENST00000510977 541 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
NEUROD1Q13562 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
NEUROD1Q13562 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
NEUROD1Q13562 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
NEUROD1Q13562 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
NEUROD1Q13562 AC107918.3-201ENST00000533272 382 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
NEUROD1Q13562 AC009803.1-201ENST00000551531 416 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
NEUROD1Q13562 MIR3910-1-201ENST00000580936 111 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
NEUROD1Q13562 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
NEUROD1Q13562 OR6P1-202ENST00000641540 3255 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 AC009229.4-201ENST00000623854 1947 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 VNN1-201ENST00000367928 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 ADGRL2-208ENST00000370725 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 FAM208A-202ENST00000431842 7119 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 OR6C2-202ENST00000641202 2105 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 ERBB4-203ENST00000402597 11699 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 RNF38-201ENST00000259605 5012 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 ERBIN-203ENST00000380938 4701 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 CASP1-201ENST00000353247 423 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 RNU6-283P-201ENST00000364788 107 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 RNA5SP424-201ENST00000390988 115 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 LINC02337-201ENST00000401043 374 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 FRMPD3-AS1-201ENST00000415252 457 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 AL355989.1-202ENST00000419406 408 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 AL159169.1-201ENST00000421119 127 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 CASP1-203ENST00000446369 948 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 AC010655.1-201ENST00000449336 292 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 RPL21P103-201ENST00000479921 488 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 ABCA17P-206ENST00000512848 467 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 RNA5SP164-201ENST00000516533 110 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 SOX5-AS1-201ENST00000539583 573 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 ZRANB2-AS2-213ENST00000591654 719 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 AL670379.6-201ENST00000603753 252 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 AC104763.2-201ENST00000604179 382 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
NEUROD1Q13562 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
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