Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 LINC00279-201ENST00000413486 473 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 RPS27AP12-201ENST00000429552 465 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 OR4C10P-201ENST00000434991 931 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 AC011897.1-201ENST00000450715 346 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 RPL23AP24-201ENST00000458203 385 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 AP000873.1-201ENST00000463987 400 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 RPL21P126-201ENST00000470049 478 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 AC093297.2-204ENST00000508945 295 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 GMPSP1-201ENST00000514075 579 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 RN7SKP234-201ENST00000517173 224 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 AC100871.2-201ENST00000522005 327 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 ASB8-204ENST00000536071 568 ntTSL 4 BASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 ATP5J2P6-201ENST00000565203 266 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 RPL7P50-201ENST00000600588 727 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 AC073657.2-201ENST00000605661 303 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 AC008035.1-201ENST00000607353 448 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 Xist_exon1.1-201ENST00000618930 85 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 LINC01232-201ENST00000625254 836 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 ZNF254-202ENST00000357002 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 CCDC91-201ENST00000381259 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 SOS1-203ENST00000426016 8517 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 XPO4-201ENST00000255305 9921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 WDR49-207ENST00000479765 2108 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 GAB1-203ENST00000505913 2477 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 CNTN5-209ENST00000528682 3800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 TMEM38B-201ENST00000374688 3956 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 SCAI-201ENST00000336505 12079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 MPDZ-211ENST00000536827 6176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 AL360270.1-201ENST00000440689 2359 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 ATG12-208ENST00000509910 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 KIF15-203ENST00000425755 3460 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 GTDC1-202ENST00000344850 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 PLEKHG7-203ENST00000638590 3267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 GABRG2-210ENST00000638772 7669 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 PCDH11X-204ENST00000373088 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 CCNT2-201ENST00000264157 6917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
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FOXE3Q13461 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
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FOXE3Q13461 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
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FOXE3Q13461 AC104662.3-202ENST00000507794 4055 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 AC015813.1-202ENST00000577267 4056 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 SETDB2-202ENST00000317257 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 CNGB3-201ENST00000320005 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 NR3C1-206ENST00000424646 4591 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 AP1G1-207ENST00000564155 2723 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 ZFYVE16-201ENST00000338008 6773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 UTP20-201ENST00000261637 9025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 SEC31A-237ENST00000513858 3687 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 CUL2-201ENST00000374746 3903 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 USP8P1-201ENST00000494673 3183 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 TM4SF18-201ENST00000296059 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 PTPN22-207ENST00000528414 3424 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 SNORA62-201ENST00000365493 153 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 BPY2-202ENST00000382585 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
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