Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 HSPA8P13-201ENST00000523715 472 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
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TCOF1Q13428 AC011509.1-201ENST00000589512 164 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
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TCOF1Q13428 RNU6-40P-201ENST00000384254 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TCOF1Q13428 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TCOF1Q13428 RNU6-878P-201ENST00000384578 110 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
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TCOF1Q13428 EPGN-209ENST00000514968 312 ntTSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
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TCOF1Q13428 MIR2909-201ENST00000617113 69 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TCOF1Q13428 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
TCOF1Q13428 C1GALT1-202ENST00000402468 930 ntTSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
TCOF1Q13428 AL139098.1-201ENST00000407291 389 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TCOF1Q13428 LURAP1L-AS1-201ENST00000417638 799 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
TCOF1Q13428 EDNRB-AS1-201ENST00000422405 601 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
TCOF1Q13428 CR848007.2-201ENST00000424918 787 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TCOF1Q13428 ZNF863P-201ENST00000426746 417 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
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