Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

Predictions only

Length 1,112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 TRAJ16-201ENST00000390521 60 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PDE3BQ13370 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PDE3BQ13370 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PDE3BQ13370 AC010975.1-201ENST00000443301 669 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PDE3BQ13370 HMGB3P30-201ENST00000457863 606 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PDE3BQ13370 AC092451.1-201ENST00000480211 153 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PDE3BQ13370 AC015911.1-201ENST00000495111 156 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PDE3BQ13370 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PDE3BQ13370 RNU6-264P-201ENST00000517134 104 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PDE3BQ13370 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PDE3BQ13370 RN7SKP289-201ENST00000517244 295 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PDE3BQ13370 AC087341.1-201ENST00000521490 491 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PDE3BQ13370 AC113192.5-201ENST00000528779 486 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PDE3BQ13370 AP006287.2-201ENST00000529036 502 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PDE3BQ13370 AC055720.1-201ENST00000539552 475 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PDE3BQ13370 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PDE3BQ13370 SNORD39.4-201ENST00000620099 78 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PDE3BQ13370 ABCC9-201ENST00000261200 8293 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PDE3BQ13370 GABRG2-213ENST00000639046 3058 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PDE3BQ13370 CD80-201ENST00000264246 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
PDE3BQ13370 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
PDE3BQ13370 BCLAF1-213ENST00000530767 4186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
PDE3BQ13370 AC024940.1-206ENST00000632817 4299 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PDE3BQ13370 SYT14-204ENST00000472886 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
PDE3BQ13370 TLR10-206ENST00000508334 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
PDE3BQ13370 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PDE3BQ13370 IQCH-201ENST00000335894 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
PDE3BQ13370 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PDE3BQ13370 CCDC121-201ENST00000324364 2342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
PDE3BQ13370 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PDE3BQ13370 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PDE3BQ13370 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PDE3BQ13370 RANP8-201ENST00000444720 713 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PDE3BQ13370 AC115115.1-201ENST00000449927 248 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PDE3BQ13370 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PDE3BQ13370 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PDE3BQ13370 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PDE3BQ13370 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PDE3BQ13370 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
PDE3BQ13370 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
PDE3BQ13370 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PDE3BQ13370 LINC00976-201ENST00000625513 783 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PDE3BQ13370 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PDE3BQ13370 CNGA1-201ENST00000358519 2627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
PDE3BQ13370 KCNJ16-209ENST00000589377 3684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PDE3BQ13370 ZNF92-204ENST00000450302 2957 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
PDE3BQ13370 RTTN-201ENST00000255674 6960 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PDE3BQ13370 ADAM28-201ENST00000265769 7052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
PDE3BQ13370 LRRN3-203ENST00000422987 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
PDE3BQ13370 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
PDE3BQ13370 GLIPR1-201ENST00000266659 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
PDE3BQ13370 RNU1-18P-201ENST00000363062 164 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PDE3BQ13370 RNA5SP50-201ENST00000363731 107 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PDE3BQ13370 CD84-204ENST00000368048 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
PDE3BQ13370 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PDE3BQ13370 MIR490-201ENST00000384865 128 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PDE3BQ13370 AL445529.1-201ENST00000398713 389 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PDE3BQ13370 GPC5-AS1-201ENST00000419288 393 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PDE3BQ13370 RPS15AP6-201ENST00000420703 385 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PDE3BQ13370 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PDE3BQ13370 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PDE3BQ13370 RPL7P5-201ENST00000471472 736 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PDE3BQ13370 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PDE3BQ13370 AC099499.1-201ENST00000505040 558 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PDE3BQ13370 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PDE3BQ13370 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PDE3BQ13370 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PDE3BQ13370 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PDE3BQ13370 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PDE3BQ13370 AC244205.2-202ENST00000635781 342 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PDE3BQ13370 AC119674.1-207ENST00000641355 633 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PDE3BQ13370 ATP8B4-201ENST00000284509 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PDE3BQ13370 FAM71D-211ENST00000612183 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PDE3BQ13370 LBR-202ENST00000338179 3812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PDE3BQ13370 SDAD1P2-201ENST00000441308 2028 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PDE3BQ13370 SLC25A17-202ENST00000402844 2405 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PDE3BQ13370 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PDE3BQ13370 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PDE3BQ13370 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PDE3BQ13370 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PDE3BQ13370 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PDE3BQ13370 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PDE3BQ13370 LINC00279-201ENST00000413486 473 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PDE3BQ13370 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PDE3BQ13370 EI24P1-201ENST00000416584 867 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PDE3BQ13370 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PDE3BQ13370 RPS3AP46-201ENST00000448352 682 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PDE3BQ13370 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PDE3BQ13370 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PDE3BQ13370 AC128713.1-201ENST00000471495 306 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PDE3BQ13370 HMGB1P22-201ENST00000505315 124 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PDE3BQ13370 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PDE3BQ13370 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PDE3BQ13370 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PDE3BQ13370 AC008056.1-201ENST00000553322 394 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PDE3BQ13370 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PDE3BQ13370 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PDE3BQ13370 ZNF99-202ENST00000596209 7817 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PDE3BQ13370 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PDE3BQ13370 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.6 ms