Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 AC093534.2-201ENST00000511418 420 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 AC092440.1-201ENST00000512563 571 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 AC091979.2-201ENST00000607514 214 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 AL136164.3-201ENST00000624429 3978 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 BBX-206ENST00000415149 8930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 POU2F1-206ENST00000429375 13651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 GLIPR1-201ENST00000266659 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 TCHHL1-201ENST00000368806 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 SYT16-205ENST00000568344 13978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 QSER1-201ENST00000399302 9335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 EPHA7-202ENST00000369303 6588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 ZNF445-201ENST00000396077 18299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 ERGIC2-212ENST00000611644 4961 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 IQCH-206ENST00000546225 3112 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 SLC38A9-223ENST00000515629 2673 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 ANK3-202ENST00000355288 3811 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 SNORA7.2-201ENST00000364446 145 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 TPT1P12-201ENST00000448968 492 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 AL451050.1-201ENST00000450126 415 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 NUTF2P7-201ENST00000453086 375 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 RN7SKP272-201ENST00000516988 232 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 AC091178.1-203ENST00000584586 279 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 AC012603.1-201ENST00000606424 528 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 AK9-201ENST00000285397 2566 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 FEZ2-201ENST00000305852 1782 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 U2SURP-208ENST00000473835 7276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 ADCY10-202ENST00000367851 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 ZNF638-203ENST00000409544 6821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 PLCB4-204ENST00000378501 5833 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 MS4A14-201ENST00000300187 2997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 AC118273.1-201ENST00000525324 3006 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 PLD1-203ENST00000356327 5855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 SNORA71.2-201ENST00000364941 134 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 SNORD96B-201ENST00000386148 79 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 RPL23AP93-201ENST00000440847 484 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 RPS23P7-201ENST00000466210 444 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 RPL21P126-201ENST00000470049 478 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 KIAA1524-208ENST00000625495 147 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 ARHGAP42-203ENST00000524892 5685 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 SUPT16HP1-201ENST00000537175 3133 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 FAM204A-203ENST00000369183 13889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 OXR1-206ENST00000449762 2621 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 EXOC1-202ENST00000349598 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 CRISP1-202ENST00000335847 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 GLCE-201ENST00000261858 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 MARK2P15-201ENST00000432204 2186 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 ZNF534-204ENST00000433050 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 OR8H2-203ENST00000641311 3092 ntAPPRIS P2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 AC106871.1-201ENST00000568324 3102 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 MIR548M-201ENST00000408260 86 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 AL160275.2-201ENST00000412010 394 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 RPL21P66-201ENST00000426566 466 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 AC023669.2-201ENST00000436266 239 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 UBE2CP3-201ENST00000502715 450 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 AC024153.1-201ENST00000603103 365 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 ARHGAP28-202ENST00000314319 5415 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 C6orf10-207ENST00000533191 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
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