Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 THEM7P-202ENST00000525689 764 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 AC137627.1-201ENST00000545761 289 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 AC060780.2-201ENST00000589047 198 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 AL591926.8-201ENST00000616876 211 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 MME-201ENST00000360490 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 AP001273.1-201ENST00000624493 3152 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 ZNF493-202ENST00000355504 4386 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 ADGRG2-203ENST00000356606 4630 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 MFSD8-216ENST00000641147 4009 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 GPX8-201ENST00000296734 3245 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 RAD17-220ENST00000616683 3057 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 AC068538.1-201ENST00000376856 336 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 RPL21P17-201ENST00000397467 475 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 MIR1290-201ENST00000408735 78 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 AL450992.2-201ENST00000434182 506 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 RPL12P39-201ENST00000455456 496 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 AC091153.1-201ENST00000466297 402 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 UQCRHP4-201ENST00000471686 272 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 UBE2CP3-201ENST00000502715 450 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 SCARNA15.2-201ENST00000516409 127 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 KIRREL3-AS2-201ENST00000532988 492 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 MIR3921-201ENST00000577308 85 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 FGF1-214ENST00000612258 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 GVQW2-203ENST00000641401 327 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 TC2N-203ENST00000435962 5146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 SPATA5-201ENST00000274008 8137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 AL121839.2-201ENST00000565058 6943 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 SEC31A-217ENST00000505984 3596 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 TRPM6-203ENST00000361255 8271 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 LINC02225-201ENST00000510444 4069 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 RALGAPA1P1-201ENST00000443361 6232 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 FCRL5-202ENST00000368189 4424 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 EDIL3-202ENST00000380138 4244 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 SNCA-AS1-201ENST00000501215 2646 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 DDX3Y-201ENST00000336079 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 MROH2B-203ENST00000506092 3745 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 GNG5P5-201ENST00000420444 220 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 RPL34P20-201ENST00000442771 351 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 FLJ27354-202ENST00000443562 770 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 AC112498.1-201ENST00000444401 332 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 AL451050.1-201ENST00000450126 415 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 AL591473.1-201ENST00000464297 313 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 RNU6-1256P-201ENST00000516539 103 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 BMS1P21-201ENST00000634565 365 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 RALGAPB-202ENST00000397040 8435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 RASA1-205ENST00000512763 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 ARAP2-210ENST00000618163 2592 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 TNFSF4-202ENST00000367718 3429 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 C1orf112-201ENST00000286031 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 SLC26A7-201ENST00000276609 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 WDR17-201ENST00000280190 4705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 OR52E5-201ENST00000610445 2244 ntAPPRIS P1 BASIC6.17□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 PCDH15-215ENST00000409834 5401 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 IFIT2-203ENST00000638108 3703 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 LINC02389-201ENST00000535058 3546 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 PTRH2-203ENST00000470557 4114 ntAPPRIS P3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 AGBL2-201ENST00000357610 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 DNA2-201ENST00000358410 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 ZNF559-201ENST00000317221 2732 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 ZNF382-201ENST00000292928 8329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 NELL2-205ENST00000452445 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 U3.15-201ENST00000365398 212 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 AC140172.1-201ENST00000502928 141 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 AC027801.4-201ENST00000518420 395 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 ASB8-204ENST00000536071 568 ntTSL 4 BASIC6.16□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 AC009137.1-201ENST00000562790 260 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 AC009962.1-201ENST00000567327 3813 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 MIR1254-2-201ENST00000579553 63 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 MIR4737-201ENST00000583979 81 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 AC062037.1-201ENST00000605302 128 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 ZNF765-201ENST00000396408 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 DPP8-203ENST00000341861 8699 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 ALB-202ENST00000401494 1659 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 EMCN-201ENST00000296420 4037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 DNTTIP2-202ENST00000436063 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 CYP19A1-201ENST00000396402 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 PIGN-239ENST00000639902 4439 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
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