Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 AC097478.1-204ENST00000509723 547 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
FAM3AP98173 AC093772.1-201ENST00000513519 506 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
FAM3AP98173 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
FAM3AP98173 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
FAM3AP98173 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
FAM3AP98173 RNU6-64P-201ENST00000517119 105 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
FAM3AP98173 AC114550.2-201ENST00000524008 397 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
FAM3AP98173 AC026771.1-201ENST00000564672 415 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
FAM3AP98173 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
FAM3AP98173 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
FAM3AP98173 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
FAM3AP98173 AC022150.3-201ENST00000599143 880 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
FAM3AP98173 AC068620.3-201ENST00000602749 560 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
FAM3AP98173 SEPT7P9-203ENST00000604116 343 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
FAM3AP98173 AC245297.2-201ENST00000610119 565 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
FAM3AP98173 AC090970.3-201ENST00000612566 866 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
FAM3AP98173 AC013470.4-201ENST00000619978 986 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
FAM3AP98173 AC012150.2-201ENST00000621300 544 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
FAM3AP98173 AP003476.1-201ENST00000623984 516 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
FAM3AP98173 SERPINI2-209ENST00000616363 1769 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
FAM3AP98173 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
FAM3AP98173 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
FAM3AP98173 AC127391.1-201ENST00000411737 98 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
FAM3AP98173 AC069282.1-201ENST00000411911 526 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
FAM3AP98173 AC003084.1-201ENST00000427030 435 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
FAM3AP98173 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
FAM3AP98173 OPA1-AS1-201ENST00000433105 492 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
FAM3AP98173 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
FAM3AP98173 AC007879.4-201ENST00000440545 361 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
FAM3AP98173 BRK1P2-201ENST00000442875 223 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
FAM3AP98173 AL135787.1-201ENST00000450154 302 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
FAM3AP98173 USP9YP10-201ENST00000454868 628 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
FAM3AP98173 AL359915.2-203ENST00000457043 540 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
FAM3AP98173 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
FAM3AP98173 BZW1P2-201ENST00000473537 826 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
FAM3AP98173 SUMO2P5-201ENST00000506790 245 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
FAM3AP98173 RNU6-678P-201ENST00000516832 109 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
FAM3AP98173 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
FAM3AP98173 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
FAM3AP98173 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
FAM3AP98173 ZNF573-209ENST00000585724 453 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
FAM3AP98173 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
FAM3AP98173 AC126118.1-201ENST00000607744 628 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
FAM3AP98173 AC131235.4-201ENST00000609288 620 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
FAM3AP98173 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
FAM3AP98173 FKTN-204ENST00000448551 1700 ntTSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
FAM3AP98173 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
FAM3AP98173 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
FAM3AP98173 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
FAM3AP98173 RNU6-621P-201ENST00000364752 109 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
FAM3AP98173 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
FAM3AP98173 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
FAM3AP98173 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
FAM3AP98173 LINC01780-201ENST00000420059 442 ntTSL 2 BASIC1.48□□□□□ -2.17
FAM3AP98173 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
FAM3AP98173 AL590399.3-201ENST00000438072 543 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
FAM3AP98173 MTND4P25-201ENST00000441039 533 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
FAM3AP98173 CHODL-AS1-201ENST00000447175 1117 ntTSL 2 BASIC1.48□□□□□ -2.17
FAM3AP98173 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
FAM3AP98173 KATNBL1P6-201ENST00000453433 915 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
FAM3AP98173 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
FAM3AP98173 RPL7P18-201ENST00000478965 734 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
FAM3AP98173 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
FAM3AP98173 AC104629.1-201ENST00000494226 508 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
FAM3AP98173 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
FAM3AP98173 DUXAP5-201ENST00000529668 529 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
FAM3AP98173 AC022880.1-201ENST00000534017 973 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
FAM3AP98173 AC123905.1-201ENST00000552098 541 ntTSL 4 BASIC1.48□□□□□ -2.17
FAM3AP98173 MTCYBP23-201ENST00000558717 1102 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
FAM3AP98173 AL670379.10-201ENST00000604330 253 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
FAM3AP98173 AL670379.9-201ENST00000605428 253 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
FAM3AP98173 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
FAM3AP98173 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
FAM3AP98173 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
FAM3AP98173 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
FAM3AP98173 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
FAM3AP98173 MTND5P33-201ENST00000571250 1450 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
FAM3AP98173 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
FAM3AP98173 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.48□□□□□ -2.17
FAM3AP98173 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
FAM3AP98173 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
FAM3AP98173 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
FAM3AP98173 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
FAM3AP98173 RNU6-278P-201ENST00000390945 109 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
FAM3AP98173 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
FAM3AP98173 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
FAM3AP98173 OR9R1P-201ENST00000412200 877 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
FAM3AP98173 AP000432.1-201ENST00000416641 516 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
FAM3AP98173 AL136369.2-201ENST00000420825 537 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
FAM3AP98173 ZBTB20-AS2-201ENST00000478301 372 ntTSL 2 BASIC1.47□□□□□ -2.17
FAM3AP98173 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
FAM3AP98173 AC109445.1-201ENST00000512356 383 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
FAM3AP98173 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
FAM3AP98173 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC1.47□□□□□ -2.17
FAM3AP98173 OR5B19P-201ENST00000531766 928 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
FAM3AP98173 AP003498.1-201ENST00000532530 347 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
FAM3AP98173 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
FAM3AP98173 AC012378.1-201ENST00000561155 364 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
FAM3AP98173 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
FAM3AP98173 AC099811.4-201ENST00000592536 496 ntTSL 2 BASIC1.47□□□□□ -2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.7 ms