Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

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Length 3,210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 NUCB2-202ENST00000458064 1279 ntTSL 1 (best) BASIC-0.05□□□□□ -2.42
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CENPFP49454 AP1S2P1-201ENST00000457344 379 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
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CENPFP49454 AC008562.1-201ENST00000521763 330 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
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CENPFP49454 EIF1P4-201ENST00000572664 335 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CENPFP49454 PART1_2.1-201ENST00000612397 250 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
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CENPFP49454 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CENPFP49454 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CENPFP49454 AC020571.1-201ENST00000430904 768 ntTSL 2 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
CENPFP49454 RPL7P31-201ENST00000450192 724 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CENPFP49454 AC093677.1-201ENST00000514414 678 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CENPFP49454 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CENPFP49454 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
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CENPFP49454 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
CENPFP49454 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
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CENPFP49454 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CENPFP49454 Y_RNA.55-201ENST00000362797 102 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CENPFP49454 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
CENPFP49454 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CENPFP49454 OR5AK1P-201ENST00000524837 922 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CENPFP49454 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CENPFP49454 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CENPFP49454 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
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CENPFP49454 MTCO2P8-201ENST00000412213 658 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CENPFP49454 AL590365.1-201ENST00000450788 243 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CENPFP49454 GYPA-204ENST00000504786 357 ntTSL 1 (best) BASIC-0.08□□□□□ -2.42
CENPFP49454 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CENPFP49454 LINC02464-201ENST00000552060 368 ntTSL 2 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
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CENPFP49454 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
CENPFP49454 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
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CENPFP49454 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
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CENPFP49454 DIRC1-201ENST00000308100 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.11□□□□□ -2.43
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CENPFP49454 AC147055.4-201ENST00000504399 745 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
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CENPFP49454 CC2D2B-209ENST00000618242 980 ntTSL 5 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
CENPFP49454 ZNF461-214ENST00000618437 774 ntTSL 5 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
CENPFP49454 RNY4P7-201ENST00000364600 96 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CENPFP49454 AC108120.2-201ENST00000512973 294 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CENPFP49454 AC074051.3-201ENST00000570238 358 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
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