Protein–RNA interactions for Protein: O75364

PITX3, Pituitary homeobox 3, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3O75364 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC0.8□□□□□ -2.28
PITX3O75364 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC0.8□□□□□ -2.28
PITX3O75364 LINC01495-201ENST00000532380 421 ntTSL 2 BASIC0.8□□□□□ -2.28
PITX3O75364 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
PITX3O75364 AC078880.1-201ENST00000546696 553 ntTSL 4 BASIC0.8□□□□□ -2.28
PITX3O75364 MRPS36P5-201ENST00000551909 298 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
PITX3O75364 ROCK1P1-201ENST00000573767 549 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
PITX3O75364 AC021549.1-201ENST00000580937 433 ntTSL 3 BASIC0.8□□□□□ -2.28
PITX3O75364 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
PITX3O75364 BNIP3P24-201ENST00000593398 557 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
PITX3O75364 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC0.8□□□□□ -2.28
PITX3O75364 SLC10A5P1-201ENST00000379063 1306 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
PITX3O75364 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC0.8□□□□□ -2.28
PITX3O75364 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.79□□□□□ -2.28
PITX3O75364 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
PITX3O75364 OR5T3-201ENST00000303059 1023 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
PITX3O75364 RNU6-252P-201ENST00000363232 107 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
PITX3O75364 RPS12P24-201ENST00000412619 387 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
PITX3O75364 AC004870.3-202ENST00000412996 432 ntTSL 3 BASIC0.79□□□□□ -2.28
PITX3O75364 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC0.79□□□□□ -2.28
PITX3O75364 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC0.79□□□□□ -2.28
PITX3O75364 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
PITX3O75364 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC0.79□□□□□ -2.28
PITX3O75364 AC002542.1-201ENST00000440683 193 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
PITX3O75364 AC002381.1-201ENST00000447049 280 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
PITX3O75364 AL034345.2-203ENST00000453417 383 ntTSL 3 BASIC0.79□□□□□ -2.28
PITX3O75364 AL160287.1-201ENST00000455612 432 ntTSL 3 BASIC0.79□□□□□ -2.28
PITX3O75364 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
PITX3O75364 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
PITX3O75364 AC093677.1-201ENST00000514414 678 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
PITX3O75364 RNU6-760P-201ENST00000516078 97 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
PITX3O75364 NRON-201ENST00000517270 370 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
PITX3O75364 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC0.79□□□□□ -2.28
PITX3O75364 LINC02384-205ENST00000539404 785 ntTSL 3 BASIC0.79□□□□□ -2.28
PITX3O75364 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC0.79□□□□□ -2.28
PITX3O75364 AC069061.2-202ENST00000580280 357 ntTSL 3 BASIC0.79□□□□□ -2.28
PITX3O75364 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC0.79□□□□□ -2.28
PITX3O75364 AC087045.1-201ENST00000605856 382 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
PITX3O75364 AC104820.1-201ENST00000624183 307 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
PITX3O75364 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC0.79□□□□□ -2.28
PITX3O75364 MTND5P11-201ENST00000511037 1812 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
PITX3O75364 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
PITX3O75364 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
PITX3O75364 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
PITX3O75364 PIGPP2-201ENST00000411569 458 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
PITX3O75364 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
PITX3O75364 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
PITX3O75364 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
PITX3O75364 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
PITX3O75364 AF131216.2-201ENST00000512316 564 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
PITX3O75364 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
PITX3O75364 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
PITX3O75364 AP003034.1-201ENST00000534621 422 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
PITX3O75364 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
PITX3O75364 ADAM3B-201ENST00000569937 840 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
PITX3O75364 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
PITX3O75364 AC004853.1-201ENST00000604902 698 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
PITX3O75364 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
PITX3O75364 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
PITX3O75364 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC0.78□□□□□ -2.29
PITX3O75364 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC0.77□□□□□ -2.29
PITX3O75364 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
PITX3O75364 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
PITX3O75364 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC0.77□□□□□ -2.29
PITX3O75364 ACAP2-IT1-201ENST00000419899 690 ntTSL 3 BASIC0.77□□□□□ -2.29
PITX3O75364 USP9YP26-201ENST00000421008 661 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
PITX3O75364 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
PITX3O75364 MTND2P5-201ENST00000432656 1006 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
PITX3O75364 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
PITX3O75364 USP9YP17-201ENST00000444617 696 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
PITX3O75364 AL391704.1-202ENST00000453889 874 ntTSL 3 BASIC0.77□□□□□ -2.29
PITX3O75364 RNU6-775P-201ENST00000459318 96 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
PITX3O75364 AC095056.1-201ENST00000503918 425 ntTSL 3 BASIC0.77□□□□□ -2.29
PITX3O75364 AC113347.4-201ENST00000506032 685 ntTSL 3 BASIC0.77□□□□□ -2.29
PITX3O75364 AC109927.2-201ENST00000506416 303 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
PITX3O75364 AC048346.1-201ENST00000510247 144 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
PITX3O75364 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC0.77□□□□□ -2.29
PITX3O75364 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC0.77□□□□□ -2.29
PITX3O75364 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC0.77□□□□□ -2.29
PITX3O75364 AP003122.4-201ENST00000530980 758 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
PITX3O75364 OR5B19P-201ENST00000531766 928 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
PITX3O75364 LINC01493-203ENST00000534756 509 ntTSL 3 BASIC0.77□□□□□ -2.29
PITX3O75364 KLRF1-203ENST00000537723 598 ntTSL 1 (best) BASIC0.77□□□□□ -2.29
PITX3O75364 AC096558.1-203ENST00000550516 574 ntTSL 3 BASIC0.77□□□□□ -2.29
PITX3O75364 AC011451.2-201ENST00000604303 598 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
PITX3O75364 AL109620.1-201ENST00000618738 1197 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
PITX3O75364 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
PITX3O75364 AC073052.2-202ENST00000622296 775 ntTSL 5 BASIC0.77□□□□□ -2.29
PITX3O75364 AC079416.3-201ENST00000624479 549 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
PITX3O75364 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
PITX3O75364 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.77□□□□□ -2.29
PITX3O75364 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
PITX3O75364 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
PITX3O75364 AL136133.1-201ENST00000413694 376 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
PITX3O75364 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
PITX3O75364 ISCA1P6-201ENST00000427740 390 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
PITX3O75364 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
PITX3O75364 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
PITX3O75364 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
PITX3O75364 AC108729.1-201ENST00000487812 947 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.5 ms