Protein–RNA interactions for Protein: O43310

CTIF, CBP80/20-dependent translation initiation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIFO43310 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CTIFO43310 MIR591-201ENST00000385290 95 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CTIFO43310 AL645937.1-202ENST00000421799 937 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CTIFO43310 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CTIFO43310 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CTIFO43310 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CTIFO43310 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CTIFO43310 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CTIFO43310 PRSS3P4-201ENST00000453323 162 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CTIFO43310 RPL7P49-201ENST00000471402 708 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CTIFO43310 AC103851.1-201ENST00000506833 274 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CTIFO43310 HMGB3P15-201ENST00000507326 574 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CTIFO43310 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CTIFO43310 MEPE-206ENST00000511670 550 ntTSL 4 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CTIFO43310 AC022690.1-201ENST00000526681 550 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CTIFO43310 AP002992.1-202ENST00000530842 551 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CTIFO43310 SYF2P1-201ENST00000550658 413 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CTIFO43310 ZNF192P1-203ENST00000565888 810 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CTIFO43310 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
CTIFO43310 AC087499.8-201ENST00000578406 226 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CTIFO43310 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CTIFO43310 AL121772.2-201ENST00000614331 297 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CTIFO43310 MBNL1-206ENST00000357472 5256 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CTIFO43310 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CTIFO43310 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CTIFO43310 HSPA8P4-201ENST00000511877 1920 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CTIFO43310 OR10AG1-202ENST00000641071 2807 ntAPPRIS P1 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CTIFO43310 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CTIFO43310 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CTIFO43310 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
CTIFO43310 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CTIFO43310 ZBTB20-201ENST00000357258 27125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
CTIFO43310 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
CTIFO43310 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
CTIFO43310 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
CTIFO43310 SNORA63.1-201ENST00000362493 131 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CTIFO43310 RNA5SP124-201ENST00000362739 110 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CTIFO43310 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CTIFO43310 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CTIFO43310 RNA5SP197-201ENST00000363357 119 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CTIFO43310 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CTIFO43310 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CTIFO43310 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CTIFO43310 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CTIFO43310 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CTIFO43310 MIR7-3-201ENST00000384898 110 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CTIFO43310 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CTIFO43310 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CTIFO43310 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
CTIFO43310 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CTIFO43310 RAB9AP3-201ENST00000412737 573 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CTIFO43310 RPS20P15-201ENST00000412792 311 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CTIFO43310 AL365400.1-201ENST00000431854 640 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CTIFO43310 AL138900.2-201ENST00000434098 156 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CTIFO43310 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CTIFO43310 RPS24P13-201ENST00000442520 397 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CTIFO43310 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CTIFO43310 RPS3AP12-201ENST00000443616 753 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CTIFO43310 FTH1P25-201ENST00000447665 469 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CTIFO43310 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CTIFO43310 RAB9AP1-201ENST00000449393 573 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CTIFO43310 MCHR2-AS1-203ENST00000451220 429 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CTIFO43310 AC067945.3-201ENST00000456176 386 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CTIFO43310 AC007547.1-201ENST00000462177 490 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CTIFO43310 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CTIFO43310 MTCO3P9-201ENST00000506989 781 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CTIFO43310 AC110799.1-201ENST00000509098 449 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CTIFO43310 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CTIFO43310 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CTIFO43310 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CTIFO43310 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CTIFO43310 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CTIFO43310 AL442067.2-201ENST00000614033 363 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CTIFO43310 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CTIFO43310 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CTIFO43310 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CTIFO43310 ZNF285B-201ENST00000561698 1767 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CTIFO43310 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CTIFO43310 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
CTIFO43310 AL049641.1-201ENST00000441055 1948 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CTIFO43310 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CTIFO43310 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CTIFO43310 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CTIFO43310 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CTIFO43310 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CTIFO43310 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CTIFO43310 TRAV26-1-201ENST00000390455 537 ntAPPRIS P1 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CTIFO43310 AL357075.1-201ENST00000404107 726 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CTIFO43310 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CTIFO43310 AC063979.1-201ENST00000415539 377 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CTIFO43310 AL513365.2-201ENST00000423060 529 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CTIFO43310 SAR1AP4-201ENST00000429225 591 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CTIFO43310 YME1L1P1-201ENST00000429435 297 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CTIFO43310 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CTIFO43310 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CTIFO43310 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CTIFO43310 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CTIFO43310 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CTIFO43310 U3.44-201ENST00000458938 192 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CTIFO43310 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
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