Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 SLC25A46-206ENST00000509432 1596 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 XGY1-201ENST00000381172 446 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 OR5H15-201ENST00000383696 930 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 SNORA20.2-201ENST00000383922 131 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 Y_RNA.559-201ENST00000384686 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.51□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 AC127391.1-201ENST00000411737 98 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 AC064871.1-202ENST00000413954 382 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 BX295541.1-201ENST00000417774 250 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 ELOCP4-201ENST00000420090 333 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 RAC1P6-201ENST00000423911 575 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 LINC01828-202ENST00000450294 955 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 AL358075.2-201ENST00000452785 339 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 AC013267.1-201ENST00000458227 267 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 AC005920.2-201ENST00000509833 332 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 RNU2-10P-201ENST00000516375 211 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 AC011979.2-201ENST00000527568 352 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 AP001646.1-201ENST00000527936 915 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 AC073591.1-201ENST00000552736 597 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 AC084756.1-201ENST00000558237 606 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 AL133173.2-201ENST00000614270 90 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 CEP57L1-203ENST00000368970 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 EQTN-201ENST00000380031 725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 BCL2L15-203ENST00000393320 276 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 AL365356.1-201ENST00000411512 736 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 PIGFP2-201ENST00000421400 651 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 AC137499.1-201ENST00000427602 88 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC2.5□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 MTCO2P11-201ENST00000431069 680 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 RPS15AP9-201ENST00000439856 381 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 AL138830.2-202ENST00000446358 786 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 MTCO2P7-201ENST00000446518 666 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 AL136380.1-201ENST00000447970 162 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 OFD1P4Y-201ENST00000455273 1179 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 AC079943.2-201ENST00000488999 716 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 AC007182.2-201ENST00000489251 402 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 SMIM18-201ENST00000517349 905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 HMGB1P41-201ENST00000520234 440 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 OR5B19P-201ENST00000531766 928 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 AC245014.2-201ENST00000603689 287 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 AL670379.6-201ENST00000603753 252 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 AL670379.11-201ENST00000604059 253 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 AL136363.2-201ENST00000604173 851 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 AC008162.1-201ENST00000604718 254 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 AL670379.12-201ENST00000605291 253 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 AC246785.4-201ENST00000605374 287 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 Y_RNA.41-201ENST00000362646 102 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 CRLS1-202ENST00000378868 994 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 RNU6-74P-201ENST00000384235 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 ISCA1P1-201ENST00000426679 387 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 AC114808.2-201ENST00000428335 536 ntTSL 4 BASIC2.49□□□□□ -2.01
LRRTM2O43300 AL353612.1-201ENST00000428769 465 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
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