Protein–RNA interactions for Protein: O43186

CRX, Cone-rod homeobox protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRXO43186 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CRXO43186 LINC02098-202ENST00000609260 554 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
CRXO43186 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CRXO43186 AC010149.2-201ENST00000637608 315 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CRXO43186 SLC25A46-206ENST00000509432 1596 ntTSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
CRXO43186 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
CRXO43186 LIPJ-201ENST00000371939 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
CRXO43186 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CRXO43186 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CRXO43186 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CRXO43186 AL136310.1-201ENST00000404926 654 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CRXO43186 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CRXO43186 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CRXO43186 VPS26BP1-201ENST00000417155 755 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CRXO43186 LINC01953-201ENST00000426870 717 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
CRXO43186 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
CRXO43186 C1orf185-202ENST00000467127 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
CRXO43186 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
CRXO43186 MTND4P2-201ENST00000507767 1203 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CRXO43186 AC091965.2-201ENST00000512324 613 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CRXO43186 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
CRXO43186 MTND1P36-201ENST00000522384 936 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CRXO43186 CD44-AS1-201ENST00000528869 587 ntTSL 4 BASIC1.5□□□□□ -2.17
CRXO43186 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CRXO43186 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CRXO43186 AC090049.1-201ENST00000551075 1011 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
CRXO43186 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
CRXO43186 AC009712.1-201ENST00000564938 316 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CRXO43186 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
CRXO43186 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
CRXO43186 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CRXO43186 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CRXO43186 AC099566.1-205ENST00000609411 657 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
CRXO43186 PART1_2.1-201ENST00000612397 250 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CRXO43186 AC008162.2-201ENST00000613352 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
CRXO43186 AC107308.1-201ENST00000615897 301 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CRXO43186 CD44-239ENST00000639002 528 ntTSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
CRXO43186 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
CRXO43186 TMEM161B-210ENST00000511218 1351 ntTSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
CRXO43186 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
CRXO43186 RNU6-462P-201ENST00000362659 105 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CRXO43186 FCF1P10-201ENST00000407590 479 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CRXO43186 RN7SKP266-201ENST00000410232 287 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CRXO43186 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CRXO43186 RAC1P6-201ENST00000423911 575 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CRXO43186 AC008267.5-201ENST00000424928 265 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CRXO43186 AL139415.2-201ENST00000431968 163 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CRXO43186 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CRXO43186 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CRXO43186 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
CRXO43186 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
CRXO43186 AC069549.1-201ENST00000451584 499 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
CRXO43186 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CRXO43186 RPS3AP22-201ENST00000488297 769 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CRXO43186 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
CRXO43186 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
CRXO43186 MTCYBP43-201ENST00000513621 740 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CRXO43186 AC025678.1-201ENST00000567861 338 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CRXO43186 AL356432.3-201ENST00000568952 465 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CRXO43186 AC008741.1-201ENST00000569456 510 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
CRXO43186 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CRXO43186 AL358072.1-201ENST00000604156 575 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CRXO43186 AC097468.3-201ENST00000607956 456 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CRXO43186 AL121895.2-201ENST00000619558 447 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CRXO43186 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CRXO43186 RGS13-201ENST00000391995 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
CRXO43186 Y_RNA.192-201ENST00000363977 102 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CRXO43186 RNU5A-8P-201ENST00000364102 114 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CRXO43186 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CRXO43186 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC1.48□□□□□ -2.17
CRXO43186 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CRXO43186 AC104777.3-201ENST00000416350 545 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
CRXO43186 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CRXO43186 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CRXO43186 AL035407.1-201ENST00000429211 571 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CRXO43186 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CRXO43186 SPIN4-AS1-201ENST00000451979 426 ntTSL 2 BASIC1.48□□□□□ -2.17
CRXO43186 AC108059.3-201ENST00000456388 214 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CRXO43186 PCDH9-AS4-201ENST00000456459 436 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
CRXO43186 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC1.48□□□□□ -2.17
CRXO43186 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CRXO43186 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CRXO43186 AC135279.1-201ENST00000543493 504 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CRXO43186 TIMM9-203ENST00000555061 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
CRXO43186 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
CRXO43186 FBXW7-AS1-201ENST00000605147 372 ntTSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
CRXO43186 AC021646.1-201ENST00000605469 484 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CRXO43186 AC093788.1-201ENST00000609356 927 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CRXO43186 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
CRXO43186 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CRXO43186 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CRXO43186 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CRXO43186 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CRXO43186 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CRXO43186 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CRXO43186 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CRXO43186 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CRXO43186 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CRXO43186 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CRXO43186 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132 ms