Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 AC025524.1-201ENST00000518489 606 ntTSL 4 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SNX13Q9Y5W8 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SNX13Q9Y5W8 AC114550.2-201ENST00000524008 397 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SNX13Q9Y5W8 AP002892.1-201ENST00000537727 550 ntTSL 4 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SNX13Q9Y5W8 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SNX13Q9Y5W8 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
SNX13Q9Y5W8 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SNX13Q9Y5W8 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SNX13Q9Y5W8 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SNX13Q9Y5W8 ADGRG2-206ENST00000360279 4702 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
SNX13Q9Y5W8 RNFT1-201ENST00000305783 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
SNX13Q9Y5W8 AC110597.3-202ENST00000583493 3289 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.86
SNX13Q9Y5W8 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
SNX13Q9Y5W8 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SNX13Q9Y5W8 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SNX13Q9Y5W8 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SNX13Q9Y5W8 RNA5SP515-201ENST00000364570 118 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SNX13Q9Y5W8 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SNX13Q9Y5W8 GPRC6A-202ENST00000368549 2622 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
SNX13Q9Y5W8 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SNX13Q9Y5W8 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SNX13Q9Y5W8 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SNX13Q9Y5W8 AL022329.2-201ENST00000413494 660 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SNX13Q9Y5W8 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SNX13Q9Y5W8 AC106873.1-201ENST00000420664 459 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SNX13Q9Y5W8 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SNX13Q9Y5W8 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SNX13Q9Y5W8 AL360091.2-201ENST00000446847 650 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SNX13Q9Y5W8 MTND5P20-201ENST00000448677 143 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SNX13Q9Y5W8 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SNX13Q9Y5W8 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SNX13Q9Y5W8 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SNX13Q9Y5W8 RNU4ATAC3P-201ENST00000516699 126 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SNX13Q9Y5W8 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SNX13Q9Y5W8 DNAJC8P1-201ENST00000554535 372 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SNX13Q9Y5W8 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SNX13Q9Y5W8 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SNX13Q9Y5W8 AC006077.1-201ENST00000604746 343 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SNX13Q9Y5W8 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SNX13Q9Y5W8 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SNX13Q9Y5W8 FP236240.3-201ENST00000623061 327 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SNX13Q9Y5W8 MIR7641-1-201ENST00000627518 61 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SNX13Q9Y5W8 ZNF99-202ENST00000596209 7817 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SNX13Q9Y5W8 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SNX13Q9Y5W8 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
SNX13Q9Y5W8 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
SNX13Q9Y5W8 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SNX13Q9Y5W8 DCUN1D1-201ENST00000292782 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
SNX13Q9Y5W8 FNDC3A-202ENST00000398316 5714 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
SNX13Q9Y5W8 MIR372-201ENST00000362225 67 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SNX13Q9Y5W8 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SNX13Q9Y5W8 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SNX13Q9Y5W8 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SNX13Q9Y5W8 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SNX13Q9Y5W8 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SNX13Q9Y5W8 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SNX13Q9Y5W8 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
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SNX13Q9Y5W8 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SNX13Q9Y5W8 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
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SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.604-201ENST00000410574 102 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
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SNX13Q9Y5W8 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SNX13Q9Y5W8 AC007527.1-201ENST00000535528 313 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
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SNX13Q9Y5W8 AC026333.2-201ENST00000542164 106 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SNX13Q9Y5W8 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SNX13Q9Y5W8 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SNX13Q9Y5W8 AL121821.2-201ENST00000556081 394 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SNX13Q9Y5W8 AC073878.2-201ENST00000565449 385 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
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SNX13Q9Y5W8 MIR4284-201ENST00000578924 81 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SNX13Q9Y5W8 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SNX13Q9Y5W8 UBE2V2P2-201ENST00000587677 504 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SNX13Q9Y5W8 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SNX13Q9Y5W8 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SNX13Q9Y5W8 AL355073.2-201ENST00000612106 557 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SNX13Q9Y5W8 AL138686.1-201ENST00000612699 315 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
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