Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZQ9

TMOD4, Tropomodulin-4, humanhuman

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD4Q9NZQ9 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
TMOD4Q9NZQ9 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
TMOD4Q9NZQ9 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TMOD4Q9NZQ9 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TMOD4Q9NZQ9 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TMOD4Q9NZQ9 RN7SKP220-201ENST00000410611 288 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TMOD4Q9NZQ9 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TMOD4Q9NZQ9 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TMOD4Q9NZQ9 AC073311.1-201ENST00000420146 505 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
TMOD4Q9NZQ9 AL139413.1-201ENST00000421309 217 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TMOD4Q9NZQ9 LINC01683-201ENST00000443479 412 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
TMOD4Q9NZQ9 AC095032.1-201ENST00000444810 527 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
TMOD4Q9NZQ9 AC068580.2-201ENST00000449749 338 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
TMOD4Q9NZQ9 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TMOD4Q9NZQ9 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
TMOD4Q9NZQ9 AC097375.2-201ENST00000510416 579 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
TMOD4Q9NZQ9 AC074344.1-201ENST00000512823 224 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TMOD4Q9NZQ9 AC004054.1-201ENST00000515111 270 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
TMOD4Q9NZQ9 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TMOD4Q9NZQ9 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
TMOD4Q9NZQ9 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
TMOD4Q9NZQ9 AL138976.2-201ENST00000563989 694 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TMOD4Q9NZQ9 FOPNL-205ENST00000573429 646 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
TMOD4Q9NZQ9 MIR548S-201ENST00000581352 82 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TMOD4Q9NZQ9 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TMOD4Q9NZQ9 AC004832.5-201ENST00000608677 401 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TMOD4Q9NZQ9 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TMOD4Q9NZQ9 AC006111.3-201ENST00000622137 383 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TMOD4Q9NZQ9 DST-204ENST00000361203 22431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
TMOD4Q9NZQ9 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TMOD4Q9NZQ9 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
TMOD4Q9NZQ9 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
TMOD4Q9NZQ9 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
TMOD4Q9NZQ9 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
TMOD4Q9NZQ9 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TMOD4Q9NZQ9 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TMOD4Q9NZQ9 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TMOD4Q9NZQ9 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TMOD4Q9NZQ9 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TMOD4Q9NZQ9 AL078645.1-201ENST00000414377 423 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
TMOD4Q9NZQ9 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TMOD4Q9NZQ9 TAAR7P-201ENST00000436141 242 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TMOD4Q9NZQ9 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
TMOD4Q9NZQ9 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TMOD4Q9NZQ9 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TMOD4Q9NZQ9 RPL39P36-201ENST00000490784 156 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TMOD4Q9NZQ9 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
TMOD4Q9NZQ9 SNORD60.2-201ENST00000516883 86 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TMOD4Q9NZQ9 AC087439.1-201ENST00000517920 398 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
TMOD4Q9NZQ9 LINCR-0001-203ENST00000524047 545 ntTSL 4 BASIC3.63□□□□□ -1.83
TMOD4Q9NZQ9 AP000790.2-201ENST00000534388 522 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
TMOD4Q9NZQ9 MRPL51-203ENST00000538814 501 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
TMOD4Q9NZQ9 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
TMOD4Q9NZQ9 SARNP-203ENST00000552080 726 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
TMOD4Q9NZQ9 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TMOD4Q9NZQ9 AC009271.1-202ENST00000588803 492 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
TMOD4Q9NZQ9 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TMOD4Q9NZQ9 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TMOD4Q9NZQ9 uc_338.11-201ENST00000619132 160 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TMOD4Q9NZQ9 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
TMOD4Q9NZQ9 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
TMOD4Q9NZQ9 HERC5-203ENST00000508159 2243 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
TMOD4Q9NZQ9 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
TMOD4Q9NZQ9 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
TMOD4Q9NZQ9 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TMOD4Q9NZQ9 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TMOD4Q9NZQ9 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TMOD4Q9NZQ9 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TMOD4Q9NZQ9 AL606923.1-201ENST00000406616 190 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TMOD4Q9NZQ9 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TMOD4Q9NZQ9 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TMOD4Q9NZQ9 RPL21P40-201ENST00000428586 483 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TMOD4Q9NZQ9 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TMOD4Q9NZQ9 RPL36AP53-201ENST00000432891 316 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TMOD4Q9NZQ9 AC004691.1-201ENST00000440376 547 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
TMOD4Q9NZQ9 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TMOD4Q9NZQ9 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TMOD4Q9NZQ9 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
TMOD4Q9NZQ9 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TMOD4Q9NZQ9 RNU7-180P-201ENST00000459240 63 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TMOD4Q9NZQ9 CFAP44-AS1-201ENST00000473329 396 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
TMOD4Q9NZQ9 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TMOD4Q9NZQ9 KC877373.1-201ENST00000479066 408 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TMOD4Q9NZQ9 RPS4XP22-201ENST00000480755 780 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TMOD4Q9NZQ9 AC025244.2-201ENST00000509215 422 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
TMOD4Q9NZQ9 RNU4-29P-201ENST00000515943 174 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TMOD4Q9NZQ9 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TMOD4Q9NZQ9 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
TMOD4Q9NZQ9 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TMOD4Q9NZQ9 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
TMOD4Q9NZQ9 AC090607.4-201ENST00000558192 369 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
TMOD4Q9NZQ9 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
TMOD4Q9NZQ9 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TMOD4Q9NZQ9 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TMOD4Q9NZQ9 DUXAP9-208ENST00000622815 614 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TMOD4Q9NZQ9 MTND1P37-201ENST00000636562 264 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TMOD4Q9NZQ9 ROS1-202ENST00000368508 7435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
TMOD4Q9NZQ9 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
TMOD4Q9NZQ9 LINC01416-201ENST00000563553 2310 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
TMOD4Q9NZQ9 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104 ms