Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 LINC01204-201ENST00000422047 639 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
EHD3Q9NZN3 GPM6BP2-201ENST00000432046 144 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
EHD3Q9NZN3 AL355340.1-201ENST00000433085 344 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
EHD3Q9NZN3 AC073063.1-201ENST00000434352 607 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
EHD3Q9NZN3 GPM6BP1-201ENST00000446387 144 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
EHD3Q9NZN3 RN7SL132P-201ENST00000478131 296 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
EHD3Q9NZN3 AC132825.2-201ENST00000483901 504 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
EHD3Q9NZN3 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
EHD3Q9NZN3 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
EHD3Q9NZN3 MTCYBP40-201ENST00000509390 1135 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
EHD3Q9NZN3 LEF1-218ENST00000512172 598 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
EHD3Q9NZN3 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
EHD3Q9NZN3 RNU6-1256P-201ENST00000516539 103 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
EHD3Q9NZN3 AC136777.1-201ENST00000517765 369 ntTSL 4 BASIC3.52□□□□□ -1.85
EHD3Q9NZN3 RGS5-206ENST00000527988 373 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
EHD3Q9NZN3 AC136475.4-201ENST00000534271 280 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
EHD3Q9NZN3 AP002892.1-201ENST00000537727 550 ntTSL 4 BASIC3.52□□□□□ -1.85
EHD3Q9NZN3 AC009320.1-201ENST00000549070 349 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
EHD3Q9NZN3 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC3.52□□□□□ -1.85
EHD3Q9NZN3 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
EHD3Q9NZN3 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
EHD3Q9NZN3 IGKV2OR2-8-201ENST00000558710 300 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
EHD3Q9NZN3 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
EHD3Q9NZN3 AC090772.1-201ENST00000583782 507 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
EHD3Q9NZN3 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
EHD3Q9NZN3 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
EHD3Q9NZN3 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
EHD3Q9NZN3 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
EHD3Q9NZN3 AC112200.1-201ENST00000625015 234 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
EHD3Q9NZN3 AC245427.9-201ENST00000633713 53 ntAPPRIS P1 BASIC3.52□□□□□ -1.85
EHD3Q9NZN3 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
EHD3Q9NZN3 MARCH6-215ENST00000640713 231 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
EHD3Q9NZN3 SDAD1P2-201ENST00000441308 2028 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
EHD3Q9NZN3 OXR1-207ENST00000497705 2007 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
EHD3Q9NZN3 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC3.52□□□□□ -1.85
EHD3Q9NZN3 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
EHD3Q9NZN3 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
EHD3Q9NZN3 DPP10-205ENST00000410059 6278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
EHD3Q9NZN3 EFTUD1P2-201ENST00000514817 1603 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
EHD3Q9NZN3 USP33-201ENST00000357428 4155 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
EHD3Q9NZN3 SYT14-204ENST00000472886 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
EHD3Q9NZN3 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
EHD3Q9NZN3 AL161457.2-203ENST00000590767 2663 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
EHD3Q9NZN3 MAP3K7-202ENST00000369325 4633 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
EHD3Q9NZN3 PSMA5-201ENST00000271308 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
EHD3Q9NZN3 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
EHD3Q9NZN3 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
EHD3Q9NZN3 TCEAL7-202ENST00000372666 852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
EHD3Q9NZN3 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
EHD3Q9NZN3 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
EHD3Q9NZN3 SNORA48.8-201ENST00000391324 134 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
EHD3Q9NZN3 NT5C3A-205ENST00000409467 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
EHD3Q9NZN3 AL590783.1-201ENST00000424138 456 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
EHD3Q9NZN3 AL137789.1-201ENST00000439443 682 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
EHD3Q9NZN3 RPS29P31-201ENST00000446147 164 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
EHD3Q9NZN3 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
EHD3Q9NZN3 snoU13.4-201ENST00000458916 104 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
EHD3Q9NZN3 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
EHD3Q9NZN3 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
EHD3Q9NZN3 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
EHD3Q9NZN3 AC026784.1-201ENST00000507986 352 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
EHD3Q9NZN3 AC131956.2-201ENST00000510922 512 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
EHD3Q9NZN3 RNU6-1045P-201ENST00000516321 107 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
EHD3Q9NZN3 AC090985.1-201ENST00000554440 480 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
EHD3Q9NZN3 AC012182.1-201ENST00000570133 895 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
EHD3Q9NZN3 MIR4474-201ENST00000579189 78 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
EHD3Q9NZN3 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
EHD3Q9NZN3 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
EHD3Q9NZN3 KLKP1-201ENST00000595979 403 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
EHD3Q9NZN3 AC116312.1-201ENST00000606841 314 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
EHD3Q9NZN3 RMST_8.1-201ENST00000610287 165 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
EHD3Q9NZN3 AL355810.1-201ENST00000614629 552 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
EHD3Q9NZN3 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
EHD3Q9NZN3 AP000553.6-201ENST00000641242 118 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
EHD3Q9NZN3 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
EHD3Q9NZN3 AL079305.1-201ENST00000623159 3008 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
EHD3Q9NZN3 FAP-201ENST00000188790 2780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
EHD3Q9NZN3 MTND5P19-201ENST00000424872 1794 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
EHD3Q9NZN3 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
EHD3Q9NZN3 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
EHD3Q9NZN3 PCAT4-201ENST00000504263 2091 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
EHD3Q9NZN3 SPZ1-201ENST00000296739 1868 ntAPPRIS P2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
EHD3Q9NZN3 GABRG2-208ENST00000638552 3710 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
EHD3Q9NZN3 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
EHD3Q9NZN3 RFX3-203ENST00000381984 364 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
EHD3Q9NZN3 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
EHD3Q9NZN3 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
EHD3Q9NZN3 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
EHD3Q9NZN3 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
EHD3Q9NZN3 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC3.5□□□□□ -1.85
EHD3Q9NZN3 RN7SKP156-201ENST00000410308 342 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
EHD3Q9NZN3 RNU2-71P-201ENST00000411395 189 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
EHD3Q9NZN3 CYCSP19-201ENST00000411715 316 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
EHD3Q9NZN3 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
EHD3Q9NZN3 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
EHD3Q9NZN3 AC106873.1-201ENST00000420664 459 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
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