Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 MALRD1-204ENST00000454679 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 ADGRG2-201ENST00000340581 3594 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 DNAH6-202ENST00000389394 12795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 ERBIN-208ENST00000506030 4386 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 LINC01102-204ENST00000451400 3778 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 ZNF660-201ENST00000322734 5834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 PCDH15-209ENST00000395433 6942 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 SPINK5-201ENST00000256084 3535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 OR5A1-202ENST00000641045 8612 ntAPPRIS P1 BASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 RNU1-20P-201ENST00000363314 162 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 RNU6-746P-201ENST00000384112 109 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 MIR34A-201ENST00000385130 110 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 RAB9AP3-201ENST00000412737 573 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 NDUFB4P7-201ENST00000423198 363 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 RAB9AP1-201ENST00000449393 573 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 RPL21P11-201ENST00000461458 483 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 SCARNA13-201ENST00000516672 275 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 AC005476.1-201ENST00000554427 397 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 AC013565.1-201ENST00000565938 597 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 AL160290.3-201ENST00000604869 165 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 AC012314.7-201ENST00000619693 93 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 ACE2-202ENST00000427411 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 ASB5-201ENST00000296525 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 TAOK3-202ENST00000419821 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 MAPK10-320ENST00000641462 6696 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 ANGPTL1-202ENST00000367629 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 GPAM-201ENST00000348367 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 RASA1-205ENST00000512763 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 PCDH15-212ENST00000395442 2970 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 TFPI-203ENST00000392365 3649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 WDR72-202ENST00000396328 7507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
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FOXQ1Q9C009 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 RPL36AP10-201ENST00000421785 322 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 AC092919.1-201ENST00000467896 229 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 ENSA-211ENST00000503345 793 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 AC026784.1-201ENST00000507986 352 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 RNA5SP73-201ENST00000516744 108 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 MIR3910-1-201ENST00000580936 111 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
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FOXQ1Q9C009 SNORA51-201ENST00000606420 132 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 CCT7-217ENST00000626868 249 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 PRKACB-201ENST00000370680 1914 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 FGD4-210ENST00000525053 2925 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 CDR1-201ENST00000370532 2467 ntAPPRIS P1 BASIC4.3□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 RASGEF1B-207ENST00000509081 3016 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 CCDC102B-201ENST00000360242 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 SPAG5-AS1-202ENST00000424210 1551 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 MIR124-3-201ENST00000384866 87 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 TOMM22P1-201ENST00000418578 312 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 AL591623.2-201ENST00000449978 222 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 RPL23AP81-201ENST00000455252 467 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 AC132825.2-201ENST00000483901 504 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 HMGB1P22-201ENST00000505315 124 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 AC104393.1-201ENST00000517495 255 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 UTS2-201ENST00000054668 420 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 AC243829.5-201ENST00000578447 247 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 RN7SL435P-201ENST00000584418 282 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 SNRPGP15-201ENST00000600149 222 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
FOXQ1Q9C009 LINC00310-206ENST00000609947 892 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
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