Protein–RNA interactions for Protein: Q96RQ1

ERGIC2, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 2, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERGIC2Q96RQ1 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ERGIC2Q96RQ1 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ERGIC2Q96RQ1 CFHR4-204ENST00000608469 1601 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
ERGIC2Q96RQ1 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
ERGIC2Q96RQ1 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
ERGIC2Q96RQ1 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
ERGIC2Q96RQ1 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
ERGIC2Q96RQ1 NACAP2-201ENST00000318548 624 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ERGIC2Q96RQ1 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
ERGIC2Q96RQ1 RNU6-1097P-201ENST00000363586 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ERGIC2Q96RQ1 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ERGIC2Q96RQ1 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ERGIC2Q96RQ1 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ERGIC2Q96RQ1 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ERGIC2Q96RQ1 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
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ERGIC2Q96RQ1 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ERGIC2Q96RQ1 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ERGIC2Q96RQ1 CDK8P2-201ENST00000415020 547 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ERGIC2Q96RQ1 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC2.55□□□□□ -2
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ERGIC2Q96RQ1 GPR143P-201ENST00000434155 205 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ERGIC2Q96RQ1 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
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ERGIC2Q96RQ1 BRK1P2-201ENST00000442875 223 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ERGIC2Q96RQ1 FABP5P13-201ENST00000452144 328 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ERGIC2Q96RQ1 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ERGIC2Q96RQ1 AL359915.2-203ENST00000457043 540 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
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ERGIC2Q96RQ1 AC097467.3-212ENST00000512269 568 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
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ERGIC2Q96RQ1 LINC2194-202ENST00000567624 506 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
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ERGIC2Q96RQ1 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
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ERGIC2Q96RQ1 AC099842.1-201ENST00000619919 596 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ERGIC2Q96RQ1 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
ERGIC2Q96RQ1 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
ERGIC2Q96RQ1 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
ERGIC2Q96RQ1 Y_RNA.51-201ENST00000362725 102 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ERGIC2Q96RQ1 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ERGIC2Q96RQ1 IVNS1ABP-201ENST00000367497 746 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
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