Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CCBE1Q6UXH8 AC019097.1-201ENST00000424783 735 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CCBE1Q6UXH8 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CCBE1Q6UXH8 AC104850.1-201ENST00000435940 476 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CCBE1Q6UXH8 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CCBE1Q6UXH8 BNIP3P2-201ENST00000441221 577 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CCBE1Q6UXH8 CBWD4P-201ENST00000445695 655 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CCBE1Q6UXH8 AL138830.2-202ENST00000446358 786 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CCBE1Q6UXH8 IGKV1OR-3-201ENST00000446944 348 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CCBE1Q6UXH8 SLC16A12-AS1-202ENST00000454270 478 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CCBE1Q6UXH8 MTND1P12-201ENST00000455231 147 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CCBE1Q6UXH8 OFD1P4Y-201ENST00000455273 1179 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CCBE1Q6UXH8 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CCBE1Q6UXH8 Z84488.1-201ENST00000476099 530 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CCBE1Q6UXH8 PLS1-AS1-201ENST00000485338 346 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CCBE1Q6UXH8 AC079943.2-201ENST00000488999 716 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CCBE1Q6UXH8 AC034226.1-201ENST00000506429 487 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CCBE1Q6UXH8 AL117351.2-201ENST00000513571 157 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CCBE1Q6UXH8 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CCBE1Q6UXH8 MTCO2P4-201ENST00000517968 247 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CCBE1Q6UXH8 AC084116.3-201ENST00000519123 429 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CCBE1Q6UXH8 AC023200.1-201ENST00000519660 651 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CCBE1Q6UXH8 AC087883.1-201ENST00000551882 391 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CCBE1Q6UXH8 AC012100.2-201ENST00000558317 304 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CCBE1Q6UXH8 SLC12A1-210ENST00000561031 735 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CCBE1Q6UXH8 MIR5004-201ENST00000579078 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CCBE1Q6UXH8 MIR2682-201ENST00000580305 110 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CCBE1Q6UXH8 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CCBE1Q6UXH8 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CCBE1Q6UXH8 ZNF788-206ENST00000596883 692 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CCBE1Q6UXH8 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CCBE1Q6UXH8 AL133173.2-201ENST00000614270 90 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CCBE1Q6UXH8 FRG1KP-201ENST00000623592 341 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CCBE1Q6UXH8 C17orf112-201ENST00000623702 835 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CCBE1Q6UXH8 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CCBE1Q6UXH8 SEPT14P19-203ENST00000633205 211 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CCBE1Q6UXH8 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.59□□□□□ -2
CCBE1Q6UXH8 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
CCBE1Q6UXH8 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -2
CCBE1Q6UXH8 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
CCBE1Q6UXH8 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC2.59□□□□□ -2
CCBE1Q6UXH8 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
CCBE1Q6UXH8 OR1S2-201ENST00000302592 978 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CCBE1Q6UXH8 Y_RNA.6-201ENST00000362350 114 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CCBE1Q6UXH8 RNU5E-1-201ENST00000362477 120 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CCBE1Q6UXH8 EQTN-201ENST00000380031 725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
CCBE1Q6UXH8 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CCBE1Q6UXH8 RNU4-47P-201ENST00000410876 114 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CCBE1Q6UXH8 LINC01780-201ENST00000420059 442 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
CCBE1Q6UXH8 TRIM60P10Y-201ENST00000425589 751 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CCBE1Q6UXH8 BX005214.1-201ENST00000427327 476 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
CCBE1Q6UXH8 C8orf59P1-201ENST00000429930 303 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CCBE1Q6UXH8 RPL31P35-201ENST00000431058 377 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CCBE1Q6UXH8 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CCBE1Q6UXH8 DNAJC19P4-201ENST00000440115 345 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CCBE1Q6UXH8 AC024908.1-202ENST00000441907 764 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
CCBE1Q6UXH8 AC025428.1-201ENST00000444137 403 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
CCBE1Q6UXH8 MTND1P1-201ENST00000445453 368 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CCBE1Q6UXH8 AC016696.1-201ENST00000446949 318 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CCBE1Q6UXH8 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CCBE1Q6UXH8 MTCO2P29-201ENST00000465212 189 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CCBE1Q6UXH8 AC117386.2-202ENST00000472821 522 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
CCBE1Q6UXH8 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CCBE1Q6UXH8 AC004924.1-201ENST00000480160 781 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CCBE1Q6UXH8 RPL9P6-201ENST00000492764 598 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CCBE1Q6UXH8 AC023794.1-201ENST00000504210 403 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
CCBE1Q6UXH8 AC010587.1-201ENST00000505809 469 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CCBE1Q6UXH8 AF213884.2-201ENST00000510417 903 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CCBE1Q6UXH8 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
CCBE1Q6UXH8 AC091133.4-201ENST00000511142 308 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CCBE1Q6UXH8 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
CCBE1Q6UXH8 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CCBE1Q6UXH8 RNU2-10P-201ENST00000516375 211 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CCBE1Q6UXH8 C14orf105-204ENST00000526336 598 ntTSL 4 BASIC2.58□□□□□ -2
CCBE1Q6UXH8 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
CCBE1Q6UXH8 AC022080.3-201ENST00000544433 482 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CCBE1Q6UXH8 AC009135.1-201ENST00000549303 776 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
CCBE1Q6UXH8 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
CCBE1Q6UXH8 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
CCBE1Q6UXH8 AL391840.1-201ENST00000571144 367 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CCBE1Q6UXH8 NRBF2P1-201ENST00000587407 859 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CCBE1Q6UXH8 AC104763.2-201ENST00000604179 382 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CCBE1Q6UXH8 AF250324.2-201ENST00000608299 610 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CCBE1Q6UXH8 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CCBE1Q6UXH8 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CCBE1Q6UXH8 AL590491.2-201ENST00000614608 499 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
CCBE1Q6UXH8 AC006338.1-201ENST00000618453 749 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CCBE1Q6UXH8 AC010338.1-201ENST00000621823 717 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CCBE1Q6UXH8 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
CCBE1Q6UXH8 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CCBE1Q6UXH8 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
CCBE1Q6UXH8 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
CCBE1Q6UXH8 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
CCBE1Q6UXH8 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
CCBE1Q6UXH8 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
CCBE1Q6UXH8 OR5J1P-201ENST00000313544 939 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CCBE1Q6UXH8 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
CCBE1Q6UXH8 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CCBE1Q6UXH8 Y_RNA.296-201ENST00000364930 108 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CCBE1Q6UXH8 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.1 ms