Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC8.67□□□□□ -1.02
FOXD1Q16676 ODF2-205ENST00000393527 3653 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
FOXD1Q16676 RPS21P8-201ENST00000413365 247 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
FOXD1Q16676 PLCH1-203ENST00000447496 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
FOXD1Q16676 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
FOXD1Q16676 AC113192.5-201ENST00000528779 486 ntTSL 2 BASIC8.67□□□□□ -1.02
FOXD1Q16676 MYL6-213ENST00000549017 502 ntTSL 3 BASIC8.67□□□□□ -1.02
FOXD1Q16676 MIR132-201ENST00000591554 101 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
FOXD1Q16676 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
FOXD1Q16676 AC116447.1-201ENST00000613153 453 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
FOXD1Q16676 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
FOXD1Q16676 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
FOXD1Q16676 PRDM2-202ENST00000311066 7437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
FOXD1Q16676 AC090673.1-202ENST00000356215 4617 ntTSL 2 BASIC8.67□□□□□ -1.02
FOXD1Q16676 SGCD-202ENST00000435422 9755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
FOXD1Q16676 ZNF761-203ENST00000454407 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
FOXD1Q16676 EIF5AL1-201ENST00000520547 3840 ntAPPRIS P1 BASIC8.66□□□□□ -1.02
FOXD1Q16676 RASSF9-201ENST00000361228 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
FOXD1Q16676 ENPP3-203ENST00000414305 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
FOXD1Q16676 CFAP61-201ENST00000245957 4082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
FOXD1Q16676 BRIP1-202ENST00000577598 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
FOXD1Q16676 RNA5SP515-201ENST00000364570 118 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
FOXD1Q16676 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
FOXD1Q16676 SNORA11-201ENST00000408789 128 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
FOXD1Q16676 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
FOXD1Q16676 MIR3691-201ENST00000578066 90 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
FOXD1Q16676 AC005726.5-201ENST00000585189 298 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
FOXD1Q16676 SMIM24-204ENST00000591708 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
FOXD1Q16676 MIR7155-201ENST00000615925 56 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
FOXD1Q16676 IGLV10-54-202ENST00000640991 351 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
FOXD1Q16676 TUSC7-203ENST00000477539 2415 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
FOXD1Q16676 RASGRP1-203ENST00000450598 2296 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
FOXD1Q16676 POLQ-204ENST00000621776 9055 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
FOXD1Q16676 GLRA2-204ENST00000443437 3182 ntTSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
FOXD1Q16676 PROX1-202ENST00000366958 8240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
FOXD1Q16676 LINC01566-202ENST00000569242 2801 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
FOXD1Q16676 IARS-213ENST00000627121 4587 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
FOXD1Q16676 UNC13B-209ENST00000635942 14550 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
FOXD1Q16676 LDHAL6CP-202ENST00000550738 3224 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
FOXD1Q16676 MTOR-202ENST00000376838 4017 ntTSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.02
FOXD1Q16676 SMAP1-206ENST00000619054 3150 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
FOXD1Q16676 ZNF227-208ENST00000589005 2943 ntTSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.02
FOXD1Q16676 OR13C1P-202ENST00000641378 2919 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
FOXD1Q16676 BNC2-203ENST00000380672 12844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.02
FOXD1Q16676 CUL2-209ENST00000537177 4271 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
FOXD1Q16676 NFAT5-202ENST00000354436 13229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
FOXD1Q16676 CASC11-201ENST00000502463 3301 ntTSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.02
FOXD1Q16676 NFAT5-212ENST00000627621 5875 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.02
FOXD1Q16676 SNORD8-201ENST00000363915 110 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
FOXD1Q16676 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
FOXD1Q16676 RNU6-634P-201ENST00000459134 106 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
FOXD1Q16676 RN7SL352P-201ENST00000466002 277 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
FOXD1Q16676 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
FOXD1Q16676 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC8.65□□□□□ -1.02
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FOXD1Q16676 CLEC12B-202ENST00000396502 3029 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
FOXD1Q16676 ERI2-206ENST00000563117 2903 ntTSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.03
FOXD1Q16676 ZNF484-201ENST00000332591 2836 ntTSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.03
FOXD1Q16676 ABLIM1-202ENST00000369252 7690 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.03
FOXD1Q16676 ZNF311-203ENST00000377179 2730 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.03
FOXD1Q16676 GNS-202ENST00000418919 4877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
FOXD1Q16676 RAPGEF4-204ENST00000409036 3975 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
FOXD1Q16676 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
FOXD1Q16676 ADGB-205ENST00000397944 5325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
FOXD1Q16676 DDX6-208ENST00000620157 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
FOXD1Q16676 WDR72-203ENST00000557913 5900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
FOXD1Q16676 AC019080.1-201ENST00000397057 5202 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
FOXD1Q16676 ZNF43-210ENST00000598381 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
FOXD1Q16676 CAST-203ENST00000338252 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
FOXD1Q16676 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
FOXD1Q16676 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
FOXD1Q16676 AL445665.1-202ENST00000452436 324 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
FOXD1Q16676 RBMY2UP-201ENST00000453474 324 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
FOXD1Q16676 PPP4R1L-209ENST00000497138 4680 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
FOXD1Q16676 RNA5SP362-201ENST00000516048 118 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
FOXD1Q16676 AC092078.1-201ENST00000558370 325 ntTSL 3 BASIC8.64□□□□□ -1.03
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FOXD1Q16676 ATXN7-208ENST00000484332 2741 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
FOXD1Q16676 LINC00939-201ENST00000502479 4972 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
FOXD1Q16676 AC007402.1-201ENST00000440698 3939 ntTSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
FOXD1Q16676 MKL2-202ENST00000571589 8799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
FOXD1Q16676 QRSL1-202ENST00000369046 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
FOXD1Q16676 FTO-204ENST00000463855 3056 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
FOXD1Q16676 FGF1-216ENST00000621536 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
FOXD1Q16676 AC019117.3-201ENST00000637807 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
FOXD1Q16676 GPM6A-201ENST00000280187 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
FOXD1Q16676 RNU6-600P-201ENST00000362524 99 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
FOXD1Q16676 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
FOXD1Q16676 RNA5SP211-201ENST00000365516 117 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
FOXD1Q16676 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
FOXD1Q16676 ARPP21-211ENST00000427542 568 ntTSL 4 BASIC8.63□□□□□ -1.03
FOXD1Q16676 AL445584.1-201ENST00000431451 330 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
FOXD1Q16676 H3F3BP1-201ENST00000440551 403 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
FOXD1Q16676 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
FOXD1Q16676 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
FOXD1Q16676 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
FOXD1Q16676 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
FOXD1Q16676 KIAA0040-206ENST00000619513 4340 ntTSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
FOXD1Q16676 ZC3H11A-201ENST00000332127 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
FOXD1Q16676 CLCC1-205ENST00000369969 4343 ntTSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
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