Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 AC060788.1-201ENST00000521318 469 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SGCBQ16585 OR5AQ1P-201ENST00000527596 927 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SGCBQ16585 AC087883.1-201ENST00000551882 391 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SGCBQ16585 AC090607.4-201ENST00000558192 369 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SGCBQ16585 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SGCBQ16585 AC110760.3-201ENST00000598794 467 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SGCBQ16585 AC012409.4-201ENST00000612923 249 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SGCBQ16585 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SGCBQ16585 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
SGCBQ16585 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SGCBQ16585 AC093536.2-201ENST00000565257 1406 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SGCBQ16585 ANKRD36BP1-202ENST00000604892 1417 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SGCBQ16585 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SGCBQ16585 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
SGCBQ16585 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SGCBQ16585 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SGCBQ16585 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
SGCBQ16585 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SGCBQ16585 U8.3-201ENST00000363321 132 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SGCBQ16585 RNY4P34-201ENST00000364779 95 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SGCBQ16585 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SGCBQ16585 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SGCBQ16585 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SGCBQ16585 RPS27L-202ENST00000411926 528 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SGCBQ16585 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SGCBQ16585 AC013401.1-202ENST00000422017 626 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SGCBQ16585 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SGCBQ16585 SLC44A3-AS1-205ENST00000424505 612 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SGCBQ16585 AL512656.1-201ENST00000427492 401 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SGCBQ16585 INTS6L-AS1-201ENST00000430820 398 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SGCBQ16585 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SGCBQ16585 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SGCBQ16585 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SGCBQ16585 MTND2P22-201ENST00000444325 1033 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SGCBQ16585 AC069549.1-201ENST00000451584 499 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
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SGCBQ16585 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
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SGCBQ16585 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SGCBQ16585 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
SGCBQ16585 AL157786.1-204ENST00000594870 506 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
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SGCBQ16585 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
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SGCBQ16585 LINC01491-201ENST00000558434 505 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
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SGCBQ16585 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
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SGCBQ16585 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SGCBQ16585 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SGCBQ16585 CD44-239ENST00000639002 528 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
SGCBQ16585 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
SGCBQ16585 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
SGCBQ16585 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SGCBQ16585 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
SGCBQ16585 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SGCBQ16585 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SGCBQ16585 RNU6-169P-201ENST00000365336 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
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