Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 Z99755.1-201ENST00000414048 380 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 AC245291.1-201ENST00000419501 328 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 AL139254.1-201ENST00000421114 376 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 AC097713.2-201ENST00000430199 356 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 AL390961.1-201ENST00000446557 319 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 RPL7P49-201ENST00000471402 708 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 AC093663.1-201ENST00000497190 394 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 AC131956.2-201ENST00000510922 512 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 AC087439.1-201ENST00000517920 398 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 AP001804.3-201ENST00000525146 880 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 AC092747.3-201ENST00000603769 301 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 AC009233.1-201ENST00000616477 371 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 DNAH12-208ENST00000495027 12146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 PHTF2-201ENST00000248550 4778 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 AL356274.2-201ENST00000624379 3752 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 MME-211ENST00000492661 2854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 C12orf4-201ENST00000261250 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 RNU4-73P-201ENST00000363164 141 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 RNA5SP197-201ENST00000363357 119 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 LINC00862-202ENST00000367356 759 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 Y_RNA.509-201ENST00000384506 99 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 AL356968.1-201ENST00000416622 474 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 AC073311.1-201ENST00000420146 505 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 AL162726.4-201ENST00000422010 673 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 AL136322.1-201ENST00000422250 548 ntTSL 4 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 AL365400.1-201ENST00000431854 640 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 LINC01650-201ENST00000438093 602 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 AC004691.1-201ENST00000440376 547 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 AL356124.2-201ENST00000442449 391 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 RPS24P13-201ENST00000442520 397 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 AC068580.2-201ENST00000449749 338 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 HMGN1P18-201ENST00000457642 277 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 RPL23AP67-201ENST00000465341 474 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 AC021205.2-201ENST00000480069 347 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 MEPE-206ENST00000511670 550 ntTSL 4 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 AC107934.2-201ENST00000518653 310 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 AC105029.1-201ENST00000520250 669 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 AC102945.1-201ENST00000522640 407 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 AC139497.1-201ENST00000524042 501 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 AC007631.1-201ENST00000578545 189 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 AC104564.2-201ENST00000581240 270 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 MIR3944-201ENST00000581277 108 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 KNL1-202ENST00000399668 7607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 DOPEY1-203ENST00000369739 7743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 TTN-204ENST00000360870 18218 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 AC093725.1-201ENST00000508135 2672 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 DCUN1D1-201ENST00000292782 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 MT-ND4L-201ENST00000361335 297 ntAPPRIS P1 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 MIR208A-201ENST00000362287 71 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 AC126124.2-201ENST00000413542 321 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 USP9YP20-201ENST00000419224 558 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 AL355303.1-201ENST00000428920 680 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 AC005019.1-201ENST00000436455 431 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 RPL23AP22-201ENST00000437556 453 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 UBE2V1P7-201ENST00000446395 340 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.3 ms