Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 AC004832.5-201ENST00000608677 401 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 Y_RNA.279-201ENST00000364763 95 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 MIS12-201ENST00000381165 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
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CCDC6Q16204 RNU6-1103P-201ENST00000384150 107 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 TRAJ17-201ENST00000390520 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 snosnR66.1-201ENST00000391095 99 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 FGFR1OP2P1-201ENST00000395943 500 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 RPS4XP8-201ENST00000402039 771 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
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CCDC6Q16204 NUP35P1-201ENST00000422734 947 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 AL353777.1-201ENST00000425552 326 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 AC024082.2-201ENST00000434771 238 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 AC112518.1-201ENST00000436089 575 ntTSL 4 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 AC093156.1-201ENST00000440382 670 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 SNRPGP6-201ENST00000451124 220 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 AC092264.1-201ENST00000456002 713 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 AL049874.1-201ENST00000489560 388 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 RPL39P36-201ENST00000490784 156 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 TTC39CP1-201ENST00000512513 755 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
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CCDC6Q16204 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 AL352984.1-201ENST00000556949 276 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
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CCDC6Q16204 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
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CCDC6Q16204 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
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CCDC6Q16204 SNORA51.2-201ENST00000364595 132 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
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CCDC6Q16204 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 RNU6-767P-201ENST00000384132 107 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
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CCDC6Q16204 AL049734.2-201ENST00000441066 616 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 AC034195.1-202ENST00000451031 610 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 RNU6-261P-201ENST00000459506 102 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 VN1R17P-201ENST00000472048 1090 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 PTPRG-AS1-210ENST00000498655 547 ntTSL 4 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 RNU6-835P-201ENST00000516974 104 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 AC114550.2-201ENST00000524008 397 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 SUB1P1-201ENST00000524415 382 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 AC022690.1-201ENST00000526681 550 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 OR5AL2P-201ENST00000532185 920 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 RBBP8-210ENST00000581687 617 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 PIGX-211ENST00000639474 777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
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