Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 DEUP1-203ENST00000527307 767 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 CD44-AS1-201ENST00000528869 587 ntTSL 4 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 AP004247.1-201ENST00000531556 1289 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 AP000462.2-203ENST00000540545 715 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 FAM96A-206ENST00000559950 561 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 AL513324.1-201ENST00000575236 632 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 AL158042.1-201ENST00000605338 460 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 587 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 AL157392.4-201ENST00000609756 345 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 TEX21P-201ENST00000447107 1476 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 EMCN-202ENST00000305864 1575 ntTSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 RNU6-769P-201ENST00000384407 104 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 GSTA9P-201ENST00000406231 611 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 MIR1302-8-201ENST00000408342 128 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 SRIP2-201ENST00000428470 166 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 AC092001.1-201ENST00000453012 261 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 AC117386.2-202ENST00000472821 522 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 AC010261.1-201ENST00000514411 457 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 SMURF2P1-201ENST00000514992 481 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 AC105185.1-201ENST00000518705 535 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 MIR544B-201ENST00000582372 78 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 SOX2-OT-224ENST00000595313 716 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 BNIP3P23-201ENST00000599655 511 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 AL670379.6-201ENST00000603753 252 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 AL670379.11-201ENST00000604059 253 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 AC008162.1-201ENST00000604718 254 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 AL670379.12-201ENST00000605291 253 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 PDCD6IPP1-201ENST00000615124 579 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 AC009269.6-201ENST00000621778 588 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 AL596220.1-201ENST00000622121 542 ntTSL 4 BASIC2.04□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 AL356596.1-201ENST00000624230 379 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC2.03□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 ZNF736P9Y-201ENST00000439586 1345 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 RNA5SP88-201ENST00000365560 109 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 BCL2L15-203ENST00000393320 276 ntTSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 CASP3-203ENST00000393588 677 ntTSL 4 BASIC2.03□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 AC119751.3-201ENST00000399720 670 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 PIGPP2-201ENST00000411569 458 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 ELOCP9-201ENST00000418624 239 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 AL391336.1-201ENST00000424678 484 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 AL445669.1-201ENST00000426743 755 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 USP9YP8-201ENST00000441913 500 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 BRK1P2-201ENST00000442875 223 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 AC013269.3-201ENST00000450486 444 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 PMCHL2-203ENST00000457791 237 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 OARD1-209ENST00000471367 401 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 C4orf33-204ENST00000502887 1126 ntTSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 AC110751.1-201ENST00000511916 462 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC2.03□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 MTATP6P9-201ENST00000515039 680 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 AC027701.1-201ENST00000520155 823 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 AP003498.1-201ENST00000532530 347 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 AKIRIN1P1-201ENST00000547384 544 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 AC025811.1-201ENST00000604312 472 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 AC112187.2-201ENST00000604345 283 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 RNU4-5P-201ENST00000607255 135 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC2.03□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC2.03□□□□□ -2.09
CHRNA6Q15825 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
CHRNA6Q15825 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
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