Protein–RNA interactions for Protein: Q15464

SHB, SH2 domain-containing adapter protein B, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHBQ15464 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SHBQ15464 ZNF826P-207ENST00000622273 1910 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SHBQ15464 RMDN2-205ENST00000407257 2280 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SHBQ15464 SERPINA7-201ENST00000327674 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
SHBQ15464 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SHBQ15464 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SHBQ15464 ATXN3-248ENST00000558190 26812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
SHBQ15464 AL589740.1-207ENST00000607823 1962 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SHBQ15464 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SHBQ15464 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SHBQ15464 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SHBQ15464 RNU6-1287P-201ENST00000362914 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SHBQ15464 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SHBQ15464 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SHBQ15464 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SHBQ15464 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SHBQ15464 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SHBQ15464 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SHBQ15464 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SHBQ15464 SNORA48.8-201ENST00000391324 134 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SHBQ15464 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SHBQ15464 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SHBQ15464 RPS20P15-201ENST00000412792 311 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SHBQ15464 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SHBQ15464 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SHBQ15464 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SHBQ15464 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SHBQ15464 IGKV1OR-3-201ENST00000446944 348 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SHBQ15464 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SHBQ15464 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SHBQ15464 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SHBQ15464 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SHBQ15464 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SHBQ15464 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SHBQ15464 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SHBQ15464 APOOP4-201ENST00000513530 597 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SHBQ15464 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SHBQ15464 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SHBQ15464 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SHBQ15464 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SHBQ15464 ATP5F1P5-201ENST00000526403 760 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SHBQ15464 RGS5-206ENST00000527988 373 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
SHBQ15464 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SHBQ15464 AC096558.2-201ENST00000546678 506 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SHBQ15464 BNIP3P6-201ENST00000549284 499 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SHBQ15464 PCED1B-AS1-208ENST00000551898 359 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SHBQ15464 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SHBQ15464 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SHBQ15464 uc_338.11-201ENST00000619132 160 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SHBQ15464 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SHBQ15464 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SHBQ15464 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SHBQ15464 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SHBQ15464 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SHBQ15464 GPRC6A-202ENST00000368549 2622 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
SHBQ15464 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SHBQ15464 ABCA5-208ENST00000588877 6525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
SHBQ15464 RAD17-202ENST00000305138 3164 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
SHBQ15464 FPGT-TNNI3K-202ENST00000370895 7566 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SHBQ15464 PRRG1-202ENST00000449135 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
SHBQ15464 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
SHBQ15464 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SHBQ15464 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SHBQ15464 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SHBQ15464 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SHBQ15464 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SHBQ15464 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SHBQ15464 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SHBQ15464 AC017074.1-201ENST00000424612 561 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SHBQ15464 AL353705.1-201ENST00000433468 480 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SHBQ15464 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SHBQ15464 HMGB3P11-201ENST00000440127 604 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SHBQ15464 AC004691.1-201ENST00000440376 547 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SHBQ15464 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SHBQ15464 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SHBQ15464 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SHBQ15464 AC096576.1-201ENST00000489014 359 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SHBQ15464 MTND4LP22-201ENST00000508209 276 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SHBQ15464 AC006445.2-201ENST00000510061 472 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SHBQ15464 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SHBQ15464 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SHBQ15464 RPL7P20-201ENST00000520308 745 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SHBQ15464 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SHBQ15464 HIGD1AP1-201ENST00000550979 275 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SHBQ15464 AL118558.2-201ENST00000556294 238 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SHBQ15464 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SHBQ15464 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SHBQ15464 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SHBQ15464 AL670379.4-201ENST00000605279 254 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SHBQ15464 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SHBQ15464 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SHBQ15464 AC022149.2-201ENST00000621061 203 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SHBQ15464 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SHBQ15464 AC007405.1-203ENST00000623667 932 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SHBQ15464 AC245427.9-201ENST00000633713 53 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SHBQ15464 MCF2-210ENST00000536274 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SHBQ15464 GABRG2-208ENST00000638552 3710 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SHBQ15464 TET2-204ENST00000413648 4973 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
SHBQ15464 AC118273.1-201ENST00000525324 3006 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SHBQ15464 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.5 ms