Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 ZNF99-202ENST00000596209 7817 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRRQ15256 RAD17-202ENST00000305138 3164 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRRQ15256 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRRQ15256 C2orf78-201ENST00000409561 3045 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRRQ15256 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRRQ15256 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRRQ15256 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRRQ15256 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRRQ15256 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRRQ15256 RN7SKP53-201ENST00000411337 315 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRRQ15256 AL355989.1-202ENST00000419406 408 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRRQ15256 AC073311.1-201ENST00000420146 505 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRRQ15256 AL360169.1-201ENST00000435116 143 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRRQ15256 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRRQ15256 LINC01683-201ENST00000443479 412 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRRQ15256 U3.44-201ENST00000458938 192 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRRQ15256 LINC02146-201ENST00000504244 509 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRRQ15256 AL359273.1-203ENST00000506295 602 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRRQ15256 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRRQ15256 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRRQ15256 IGKV2D-19-201ENST00000523346 262 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRRQ15256 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRRQ15256 AP004242.1-201ENST00000533701 349 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRRQ15256 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRRQ15256 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRRQ15256 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRRQ15256 DNAJC8P1-201ENST00000554535 372 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRRQ15256 MIR3186-201ENST00000577404 85 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRRQ15256 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRRQ15256 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRRQ15256 SNORA51-201ENST00000606420 132 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRRQ15256 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRRQ15256 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRRQ15256 AC244205.2-202ENST00000635781 342 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRRQ15256 AC092442.1-201ENST00000636216 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRRQ15256 AL732372.2-225ENST00000642124 456 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRRQ15256 FIGNL1-203ENST00000419119 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRRQ15256 UACA-202ENST00000379983 4859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRRQ15256 DENND2C-203ENST00000393277 4730 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRRQ15256 ANGPTL1-202ENST00000367629 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRRQ15256 AL049641.1-201ENST00000441055 1948 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRRQ15256 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRRQ15256 WNK3-205ENST00000620763 5400 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRRQ15256 IDE-202ENST00000371581 4480 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRRQ15256 OR4G2P-202ENST00000641004 1759 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRRQ15256 CENPJ-205ENST00000545981 4299 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRRQ15256 UFM1-201ENST00000239878 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRRQ15256 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRRQ15256 LINC00907-209ENST00000593234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRRQ15256 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRRQ15256 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRRQ15256 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRRQ15256 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRRQ15256 NT5C3A-205ENST00000409467 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRRQ15256 AC063979.1-201ENST00000415539 377 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRRQ15256 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRRQ15256 TOMM22P1-201ENST00000418578 312 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRRQ15256 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRRQ15256 HIGD1AP11-201ENST00000438361 280 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRRQ15256 AL137789.1-201ENST00000439443 682 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRRQ15256 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRRQ15256 DARS-AS1-205ENST00000444649 558 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRRQ15256 AC098484.1-201ENST00000447572 484 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRRQ15256 AC008264.1-201ENST00000447612 367 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRRQ15256 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRRQ15256 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRRQ15256 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRRQ15256 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRRQ15256 RNU6-1231P-201ENST00000517185 103 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRRQ15256 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRRQ15256 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRRQ15256 AC104237.1-201ENST00000527443 539 ntTSL 4 BASIC3.55□□□□□ -1.84
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PTPRRQ15256 AL352979.2-201ENST00000556988 366 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRRQ15256 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRRQ15256 AC092718.6-202ENST00000563072 408 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRRQ15256 LINC01897-203ENST00000591503 369 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRRQ15256 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRRQ15256 MIR92B-201ENST00000607575 96 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRRQ15256 AC027045.1-201ENST00000609065 202 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRRQ15256 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRRQ15256 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRRQ15256 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRRQ15256 DOCK7-202ENST00000340370 6731 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRRQ15256 CKAP5-201ENST00000312055 6532 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRRQ15256 PLS3-203ENST00000420625 3150 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRRQ15256 TET2-204ENST00000413648 4973 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPRRQ15256 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPRRQ15256 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPRRQ15256 GALNT1-201ENST00000269195 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPRRQ15256 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPRRQ15256 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPRRQ15256 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPRRQ15256 DEFB110-201ENST00000371148 384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPRRQ15256 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPRRQ15256 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPRRQ15256 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPRRQ15256 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPRRQ15256 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPRRQ15256 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
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