Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 AC007998.5-201ENST00000622938 237 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 AC139792.3-201ENST00000623525 224 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 SLC38A9-201ENST00000318672 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 API5P2-201ENST00000397055 1498 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 HSFY2-201ENST00000304790 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 RNU6-1120P-201ENST00000362988 108 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 Y_RNA.381-201ENST00000365666 102 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 LINC01707-201ENST00000425517 627 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 AL589986.2-201ENST00000429352 397 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 AL596276.1-201ENST00000434465 418 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 MTATP6P16-201ENST00000434543 526 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 FDX1P2-201ENST00000450769 375 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 AC008481.1-201ENST00000463278 396 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 MTCO3P38-201ENST00000468910 766 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 FAM92A1P2-202ENST00000504766 877 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 AC092673.1-201ENST00000510203 428 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 AC021736.1-201ENST00000521143 563 ntTSL 4 BASIC2.78□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 AC104237.1-201ENST00000527443 539 ntTSL 4 BASIC2.78□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 AC011979.2-201ENST00000527568 352 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 AL359212.1-201ENST00000556608 614 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 DLGAP1-AS4-201ENST00000582054 757 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 AC012507.3-201ENST00000603556 477 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 Z84480.1-201ENST00000605131 311 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 LGI1-201ENST00000371413 1247 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 MAPK8-202ENST00000374174 739 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 RNU6-1158P-201ENST00000391167 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 AC064852.1-201ENST00000427571 851 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 AL139415.2-201ENST00000431968 163 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 LINC01626-201ENST00000431997 452 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 AC000111.3-201ENST00000433478 193 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 AL139289.1-201ENST00000436713 731 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 HMGB3P12-201ENST00000438745 556 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 ACBD3-AS1-201ENST00000440540 535 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 AC073326.1-201ENST00000451832 557 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 RNU6-420P-201ENST00000458780 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 AC012181.1-201ENST00000479895 423 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 AC092989.1-201ENST00000481235 277 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 AC079382.1-201ENST00000493346 557 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 LINC02101-201ENST00000505861 725 ntTSL 4 BASIC2.77□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 SNORA70.16-201ENST00000516390 95 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 AHI1-217ENST00000534469 680 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 AL512360.1-201ENST00000555346 234 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 AC046158.1-201ENST00000563408 719 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 AC025678.1-201ENST00000567861 338 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 AC020978.4-201ENST00000569088 460 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 AC104365.1-201ENST00000588835 394 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 AC022150.3-201ENST00000599143 880 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 AL390240.1-201ENST00000612950 384 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 AL445584.2-201ENST00000614030 616 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 AC005609.4-201ENST00000625071 447 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 MIR1321-201ENST00000637766 79 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 LRRC39-201ENST00000342895 1881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 ZNF680P1-201ENST00000436625 1469 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NECTIN1Q15223 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
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