Protein–RNA interactions for Protein: Q15046

KARS, Lysine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KARSQ15046 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KARSQ15046 MIR7844-201ENST00000616161 122 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KARSQ15046 AC079248.2-201ENST00000623779 326 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KARSQ15046 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KARSQ15046 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KARSQ15046 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KARSQ15046 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KARSQ15046 RNU5F-6P-201ENST00000362979 116 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KARSQ15046 RNU6-809P-201ENST00000384461 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KARSQ15046 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KARSQ15046 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KARSQ15046 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KARSQ15046 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KARSQ15046 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KARSQ15046 MTND5P25-201ENST00000430499 799 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KARSQ15046 AC025038.1-201ENST00000433249 336 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
KARSQ15046 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KARSQ15046 AC118469.1-201ENST00000442943 488 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KARSQ15046 AC013269.3-201ENST00000450486 444 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
KARSQ15046 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KARSQ15046 RPS3AP22-201ENST00000488297 769 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KARSQ15046 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KARSQ15046 AC092436.1-201ENST00000506450 503 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KARSQ15046 RPL37P25-201ENST00000507308 276 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KARSQ15046 AC096736.1-201ENST00000512609 947 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
KARSQ15046 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KARSQ15046 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KARSQ15046 ZNF706-202ENST00000517844 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
KARSQ15046 BTF3P12-201ENST00000519620 469 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KARSQ15046 LINC02290-203ENST00000556662 577 ntTSL 4 BASIC2.53□□□□□ -2
KARSQ15046 AL035425.2-201ENST00000563887 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.53□□□□□ -2
KARSQ15046 AC012435.1-202ENST00000568772 240 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KARSQ15046 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
KARSQ15046 LINC01897-203ENST00000591503 369 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
KARSQ15046 BNIP3P9-201ENST00000603714 553 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KARSQ15046 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KARSQ15046 AL365204.3-201ENST00000612448 685 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KARSQ15046 AC008162.2-201ENST00000613352 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
KARSQ15046 AC104010.1-201ENST00000616889 150 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KARSQ15046 AC093591.3-201ENST00000634516 308 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KARSQ15046 CU459211.1-201ENST00000635667 749 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KARSQ15046 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KARSQ15046 TEX21P-201ENST00000447107 1476 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KARSQ15046 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KARSQ15046 OR6C76-201ENST00000328314 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KARSQ15046 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KARSQ15046 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KARSQ15046 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KARSQ15046 AC004543.1-201ENST00000418764 369 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KARSQ15046 MTND4P20-201ENST00000424125 869 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KARSQ15046 MTCO3P30-201ENST00000426425 670 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KARSQ15046 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KARSQ15046 AP000477.2-201ENST00000447405 778 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KARSQ15046 EPS15P1-201ENST00000448836 336 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KARSQ15046 ZNF114P1-201ENST00000453500 292 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KARSQ15046 RPL30P6-201ENST00000475925 342 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KARSQ15046 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KARSQ15046 OCIAD1-AS1-201ENST00000513576 265 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KARSQ15046 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KARSQ15046 RNU6-232P-201ENST00000517144 64 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KARSQ15046 SMIM18-201ENST00000517349 905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KARSQ15046 AC091996.1-201ENST00000522274 600 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KARSQ15046 MTND4LP18-201ENST00000526864 291 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KARSQ15046 ZNF519P3-201ENST00000557158 1032 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KARSQ15046 AC135628.1-201ENST00000568867 534 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KARSQ15046 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KARSQ15046 AC007363.1-201ENST00000604736 620 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KARSQ15046 AC121334.2-201ENST00000605387 271 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KARSQ15046 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KARSQ15046 AC010678.1-201ENST00000614118 713 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KARSQ15046 CAPZA2-214ENST00000628758 525 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KARSQ15046 MTND5P42-201ENST00000637720 498 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KARSQ15046 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KARSQ15046 AC092104.1-201ENST00000497346 1441 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
KARSQ15046 AC093536.2-201ENST00000565257 1406 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
KARSQ15046 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KARSQ15046 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
KARSQ15046 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KARSQ15046 RNU5A-2P-201ENST00000384337 116 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
KARSQ15046 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
KARSQ15046 MAGI2-AS2-201ENST00000411616 476 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KARSQ15046 RPS12P24-201ENST00000412619 387 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
KARSQ15046 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KARSQ15046 AL133217.1-201ENST00000450980 425 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
KARSQ15046 MTND1P12-201ENST00000455231 147 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
KARSQ15046 AL137847.2-201ENST00000458111 527 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KARSQ15046 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
KARSQ15046 FSBP-201ENST00000481490 1158 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KARSQ15046 AC112204.1-201ENST00000502591 103 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
KARSQ15046 MTND1P22-201ENST00000510572 951 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
KARSQ15046 RNU2-10P-201ENST00000516375 211 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
KARSQ15046 AC107934.1-201ENST00000522215 217 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
KARSQ15046 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
KARSQ15046 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KARSQ15046 AC005261.5-201ENST00000596280 355 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
KARSQ15046 WISP1-OT1-201ENST00000602893 642 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
KARSQ15046 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
KARSQ15046 AC105129.3-201ENST00000605455 485 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
KARSQ15046 AP000770.2-201ENST00000623694 100 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
KARSQ15046 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
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