Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

Predictions only

Length 1,050 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 SPINK7-205ENST00000523535 299 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 AC100763.1-201ENST00000532735 522 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 ADI1P3-201ENST00000549509 470 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC2.78□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 AC009269.4-201ENST00000557828 440 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 BNIP3P9-201ENST00000603714 553 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 AP001330.5-201ENST00000607176 411 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 LINC01090-203ENST00000632331 466 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 SEPT14P19-202ENST00000632397 370 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 SEPT14P19-203ENST00000633205 211 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 ZBTB26-202ENST00000373656 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 Y_RNA.6-201ENST00000362350 114 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 MIR181A1-201ENST00000385026 110 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 AC003985.1-201ENST00000414127 362 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 UBE2V1P10-201ENST00000414685 269 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 AL645937.1-202ENST00000421799 937 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC2.77□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 AC069549.1-201ENST00000451584 499 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 CECR9-201ENST00000453421 199 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 LINC00430-201ENST00000457672 597 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 AC079943.1-201ENST00000491909 466 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 AC098591.2-201ENST00000510152 315 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 AF279873.4-202ENST00000521714 511 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 AP003033.1-201ENST00000527244 415 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 OR5AL2P-201ENST00000532185 920 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 OR5V1-216ENST00000543825 1048 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 ZNF519P2-201ENST00000557032 169 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 AC008536.2-201ENST00000607284 349 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 AC135507.2-201ENST00000612443 309 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 AC068792.1-201ENST00000621354 417 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 AL589986.2-201ENST00000429352 397 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 UBE2E2-AS1-202ENST00000430018 499 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 DPPA3P1-201ENST00000448050 469 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 LINC00571-203ENST00000454060 525 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 AC027673.1-201ENST00000456245 405 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 SRRM1P2-201ENST00000464531 1192 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 AC019235.1-201ENST00000503847 207 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 AC109927.2-201ENST00000506416 303 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 AC009646.1-201ENST00000510455 318 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 AC105417.1-201ENST00000514691 285 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 RNU6-123P-201ENST00000516163 102 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 ZDHHC20P3-201ENST00000531576 336 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 AC009269.3-201ENST00000558429 472 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 AC138761.3-201ENST00000579993 334 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 AC004492.1-201ENST00000607036 742 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 AF250324.2-201ENST00000608299 610 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 AC092954.2-201ENST00000609103 430 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 uc_338.11-201ENST00000619132 160 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 AC139792.3-201ENST00000623525 224 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 CR381653.2-201ENST00000624041 768 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 AL157786.1-207ENST00000627771 695 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HERC3Q15034 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
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