Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 AC010255.3-204ENST00000514637 454 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
RAB39AQ14964 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RAB39AQ14964 AC103957.1-201ENST00000517681 503 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
RAB39AQ14964 AC068992.1-201ENST00000521411 543 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
RAB39AQ14964 RGS5-206ENST00000527988 373 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
RAB39AQ14964 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC3.57□□□□□ -1.84
RAB39AQ14964 AC011602.1-201ENST00000546484 331 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RAB39AQ14964 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
RAB39AQ14964 LINC02386-202ENST00000551287 564 ntTSL 4 BASIC3.57□□□□□ -1.84
RAB39AQ14964 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RAB39AQ14964 AC025627.2-201ENST00000576220 160 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RAB39AQ14964 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RAB39AQ14964 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RAB39AQ14964 AL591034.3-201ENST00000605511 685 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RAB39AQ14964 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RAB39AQ14964 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RAB39AQ14964 AC002076.2-201ENST00000617362 122 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RAB39AQ14964 AF127577.6-201ENST00000623352 2191 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RAB39AQ14964 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RAB39AQ14964 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RAB39AQ14964 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RAB39AQ14964 TFEC-201ENST00000265440 6628 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
RAB39AQ14964 MUC15-201ENST00000281268 2968 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
RAB39AQ14964 OR10AG1-202ENST00000641071 2807 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
RAB39AQ14964 KIAA0586-215ENST00000619722 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
RAB39AQ14964 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
RAB39AQ14964 AC004160.1-212ENST00000421121 2078 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
RAB39AQ14964 WDR72-201ENST00000360509 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
RAB39AQ14964 MAPK10-372ENST00000641954 3413 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RAB39AQ14964 ZNF85-201ENST00000300540 1531 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
RAB39AQ14964 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
RAB39AQ14964 PRRG1-202ENST00000449135 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
RAB39AQ14964 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
RAB39AQ14964 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RAB39AQ14964 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RAB39AQ14964 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RAB39AQ14964 RNA5SP130-201ENST00000364431 114 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RAB39AQ14964 RN7SKP227-201ENST00000364445 330 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RAB39AQ14964 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RAB39AQ14964 LINC02337-201ENST00000401043 374 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
RAB39AQ14964 RPL5P18-201ENST00000406671 891 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RAB39AQ14964 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
RAB39AQ14964 SNORA57.3-201ENST00000411095 141 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RAB39AQ14964 HSPE1P12-201ENST00000412576 301 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RAB39AQ14964 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
RAB39AQ14964 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RAB39AQ14964 LINC01757-201ENST00000435552 480 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
RAB39AQ14964 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RAB39AQ14964 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RAB39AQ14964 FPGT-203ENST00000467578 601 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
RAB39AQ14964 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RAB39AQ14964 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RAB39AQ14964 RN7SKP209-201ENST00000516888 304 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RAB39AQ14964 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RAB39AQ14964 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RAB39AQ14964 AC113192.1-201ENST00000527270 321 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
RAB39AQ14964 MIR5684-201ENST00000585074 65 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RAB39AQ14964 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RAB39AQ14964 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RAB39AQ14964 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RAB39AQ14964 MIR7151-201ENST00000617477 60 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RAB39AQ14964 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RAB39AQ14964 MIR492-201ENST00000638676 116 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RAB39AQ14964 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
RAB39AQ14964 UFM1-201ENST00000239878 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
RAB39AQ14964 SYT14-208ENST00000637265 13567 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
RAB39AQ14964 PCDH11X-208ENST00000504220 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
RAB39AQ14964 ADGRG4-203ENST00000394143 9931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
RAB39AQ14964 SNORA60-201ENST00000362396 134 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RAB39AQ14964 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RAB39AQ14964 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RAB39AQ14964 RNU6-283P-201ENST00000364788 107 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RAB39AQ14964 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RAB39AQ14964 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RAB39AQ14964 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RAB39AQ14964 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RAB39AQ14964 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RAB39AQ14964 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RAB39AQ14964 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RAB39AQ14964 AC099548.1-201ENST00000421443 426 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RAB39AQ14964 AC017083.1-201ENST00000428093 483 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RAB39AQ14964 AC097713.2-201ENST00000430199 356 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RAB39AQ14964 IGKV1OR9-2-201ENST00000431378 277 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RAB39AQ14964 AC083863.1-201ENST00000438811 231 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RAB39AQ14964 AL162151.2-201ENST00000448875 158 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RAB39AQ14964 RPL23AP45-201ENST00000476406 468 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RAB39AQ14964 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RAB39AQ14964 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RAB39AQ14964 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RAB39AQ14964 LINC02014-201ENST00000514010 713 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
RAB39AQ14964 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RAB39AQ14964 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RAB39AQ14964 NDUFB9P3-201ENST00000521269 501 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RAB39AQ14964 PRB1-204ENST00000546254 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
RAB39AQ14964 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
RAB39AQ14964 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RAB39AQ14964 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RAB39AQ14964 AL020997.2-201ENST00000602607 184 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RAB39AQ14964 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RAB39AQ14964 MIR6867-201ENST00000610636 67 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.5 ms