Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 RPS27AP13-201ENST00000498403 237 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SSPNQ14714 AL592156.1-201ENST00000508758 304 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SSPNQ14714 AC005921.1-201ENST00000510589 286 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SSPNQ14714 LINC02149-201ENST00000511443 558 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
SSPNQ14714 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
SSPNQ14714 RNA5SP49-201ENST00000516450 115 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SSPNQ14714 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SSPNQ14714 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
SSPNQ14714 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SSPNQ14714 AC015911.9-201ENST00000591634 185 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
SSPNQ14714 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
SSPNQ14714 FAM27D1-201ENST00000612308 341 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SSPNQ14714 SNORD39.4-201ENST00000620099 78 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SSPNQ14714 MIR4496-201ENST00000635896 61 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SSPNQ14714 ATG12-208ENST00000509910 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
SSPNQ14714 PATJ-202ENST00000316485 3657 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
SSPNQ14714 U2SURP-208ENST00000473835 7276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
SSPNQ14714 PTPN13-202ENST00000411767 8119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
SSPNQ14714 ATP2C1-205ENST00000504381 3498 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
SSPNQ14714 ABI3BP-201ENST00000284322 4498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
SSPNQ14714 ELAVL4-206ENST00000371827 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
SSPNQ14714 PIKFYVE-201ENST00000264380 9901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
SSPNQ14714 BAZ2B-204ENST00000392783 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
SSPNQ14714 C18orf54-202ENST00000382911 4056 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SSPNQ14714 GAB1-203ENST00000505913 2477 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SSPNQ14714 AP5M1-201ENST00000261558 11737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
SSPNQ14714 RBBP6-202ENST00000348022 5739 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
SSPNQ14714 USP44-201ENST00000258499 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
SSPNQ14714 OBSCN-204ENST00000366707 26772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SSPNQ14714 MIR448-201ENST00000362131 111 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SSPNQ14714 RNA5SP388-201ENST00000362584 119 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SSPNQ14714 RNA5SP307-201ENST00000362863 116 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SSPNQ14714 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SSPNQ14714 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SSPNQ14714 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SSPNQ14714 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SSPNQ14714 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SSPNQ14714 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SSPNQ14714 AL157831.1-201ENST00000426134 473 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SSPNQ14714 AC017083.1-201ENST00000428093 483 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SSPNQ14714 AL589765.1-201ENST00000457548 386 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SSPNQ14714 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SSPNQ14714 RPL35AP15-201ENST00000468042 339 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SSPNQ14714 RPL29-203ENST00000475248 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SSPNQ14714 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SSPNQ14714 ATP6V1G1P6-201ENST00000504007 334 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SSPNQ14714 LINC02122-201ENST00000511395 577 ntTSL 4 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SSPNQ14714 RN7SKP46-201ENST00000515942 234 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SSPNQ14714 RNA5SP446-201ENST00000515955 82 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SSPNQ14714 AC068992.1-201ENST00000521411 543 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SSPNQ14714 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SSPNQ14714 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SSPNQ14714 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SSPNQ14714 RPL23AP87-202ENST00000573039 466 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SSPNQ14714 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SSPNQ14714 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SSPNQ14714 AL591034.3-201ENST00000605511 685 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SSPNQ14714 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SSPNQ14714 AC112484.5-201ENST00000624189 228 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SSPNQ14714 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
SSPNQ14714 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SSPNQ14714 ARL15-202ENST00000504924 2486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
SSPNQ14714 ARL15-207ENST00000620747 2486 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SSPNQ14714 ZFAND6-212ENST00000559775 1602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SSPNQ14714 OSBPL6-201ENST00000190611 10513 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
SSPNQ14714 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
SSPNQ14714 AL133383.2-201ENST00000622958 2336 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SSPNQ14714 CENPE-202ENST00000380026 8241 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
SSPNQ14714 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SSPNQ14714 ORC4-201ENST00000264169 6598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SSPNQ14714 LRRC63-203ENST00000595396 2327 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SSPNQ14714 OR6P1-202ENST00000641540 3255 ntAPPRIS P1 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SSPNQ14714 OR5J2-201ENST00000312298 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SSPNQ14714 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SSPNQ14714 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SSPNQ14714 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SSPNQ14714 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SSPNQ14714 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SSPNQ14714 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SSPNQ14714 IGLV5-37-201ENST00000390300 374 ntAPPRIS P1 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SSPNQ14714 MS4A4E-201ENST00000398984 479 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SSPNQ14714 HSPE1P8-201ENST00000406997 288 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SSPNQ14714 RNA5SP317-201ENST00000410176 116 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SSPNQ14714 SNORA74C-2-201ENST00000411179 201 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SSPNQ14714 RNA5SP311-201ENST00000411290 116 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SSPNQ14714 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SSPNQ14714 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SSPNQ14714 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SSPNQ14714 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
SSPNQ14714 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
SSPNQ14714 AC005828.1-201ENST00000431604 524 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SSPNQ14714 BX679664.1-201ENST00000434429 253 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SSPNQ14714 OR4C10P-201ENST00000434991 931 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SSPNQ14714 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SSPNQ14714 LINC01698-201ENST00000443636 727 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SSPNQ14714 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SSPNQ14714 AC034195.1-202ENST00000451031 610 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SSPNQ14714 TTTY23B-202ENST00000451467 512 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
SSPNQ14714 BX276092.4-201ENST00000452056 248 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SSPNQ14714 TTTY23-201ENST00000452889 512 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
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