Protein–RNA interactions for Protein: Q14123

PDE1C, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1CQ14123 AP003033.1-201ENST00000527244 415 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 AP001646.1-201ENST00000527936 915 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 AP002992.1-202ENST00000530842 551 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 OR5B19P-201ENST00000531766 928 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 AC044798.1-201ENST00000565146 418 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 AC007938.3-201ENST00000604965 623 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 AC007684.1-201ENST00000609671 477 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 KCNIP4-207ENST00000509207 1301 ntTSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 Y_RNA.1-201ENST00000352915 104 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 RNU6-1097P-201ENST00000363586 107 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 AC068050.1-201ENST00000394891 380 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 AL138885.1-201ENST00000405921 675 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 Y_RNA.599-201ENST00000410489 109 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 AC245054.2-201ENST00000415639 319 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 AL513365.2-201ENST00000423060 529 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 AC002486.1-201ENST00000435098 391 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 MTND1P34-201ENST00000438556 671 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 BRK1P2-201ENST00000442875 223 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 UQCRHP3-201ENST00000451503 251 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 AC073326.1-201ENST00000451832 557 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 NDUFAF4P4-201ENST00000454883 502 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 AC109927.2-201ENST00000506416 303 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 AC010493.1-201ENST00000513479 292 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 BTF3P12-201ENST00000519620 469 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 AC104211.1-202ENST00000521307 866 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 MTCYBP20-201ENST00000524239 1129 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 AC080078.2-201ENST00000603766 501 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 AF250324.2-201ENST00000608299 610 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 uc_338.25-201ENST00000613756 156 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 AC093648.1-201ENST00000623546 606 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 AC124864.2-201ENST00000624736 186 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 BAZ2B-202ENST00000343439 2364 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC3.15□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.9
PDE1CQ14123 LINC00305-201ENST00000323355 873 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
PDE1CQ14123 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
PDE1CQ14123 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
PDE1CQ14123 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PDE1CQ14123 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PDE1CQ14123 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PDE1CQ14123 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PDE1CQ14123 OR51A5P-201ENST00000415429 942 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PDE1CQ14123 AL353193.1-201ENST00000421444 268 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PDE1CQ14123 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PDE1CQ14123 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
PDE1CQ14123 AC018693.1-201ENST00000442829 550 ntTSL 4 BASIC3.15□□□□□ -1.91
PDE1CQ14123 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PDE1CQ14123 AL358075.2-201ENST00000452785 339 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
PDE1CQ14123 AC092001.1-201ENST00000453012 261 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PDE1CQ14123 S100A11P2-201ENST00000467589 312 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PDE1CQ14123 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
PDE1CQ14123 AC093206.1-201ENST00000515364 497 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
PDE1CQ14123 RNU6-506P-201ENST00000516553 94 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PDE1CQ14123 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PDE1CQ14123 LINC02398-201ENST00000536666 431 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
PDE1CQ14123 AC008083.3-201ENST00000547777 329 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
PDE1CQ14123 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
PDE1CQ14123 AL049869.2-201ENST00000556634 365 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
PDE1CQ14123 UBL5P2-201ENST00000583788 219 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PDE1CQ14123 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
PDE1CQ14123 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
PDE1CQ14123 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PDE1CQ14123 AC068792.1-201ENST00000621354 417 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PDE1CQ14123 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
PDE1CQ14123 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PDE1CQ14123 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PDE1CQ14123 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
PDE1CQ14123 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PDE1CQ14123 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
PDE1CQ14123 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
PDE1CQ14123 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
PDE1CQ14123 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
PDE1CQ14123 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PDE1CQ14123 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 144.5 ms