Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 AC107029.2-201ENST00000462011 2305 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
DDX39BQ13838 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 RNY3P13-201ENST00000365542 102 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 AL136980.1-201ENST00000426764 543 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 ZNF736P11Y-201ENST00000442535 1213 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 ITGA9-AS1-208ENST00000449586 726 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 AC003071.1-201ENST00000451219 789 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 AC004263.1-201ENST00000479327 332 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 AC010486.1-201ENST00000511793 424 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 AC023050.2-201ENST00000544968 387 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 AL133166.1-201ENST00000551040 1034 ntTSL 4 BASIC2.08□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 MIR3146-201ENST00000580367 79 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 AC092953.2-201ENST00000608000 699 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 CEP57L1-203ENST00000368970 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 ANKRD36BP1-202ENST00000604892 1417 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 RNU6-931P-201ENST00000363850 107 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 KLRC2-202ENST00000381902 1221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 RNU6-906P-201ENST00000384700 70 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 MIR620-201ENST00000385232 95 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 FCF1P10-201ENST00000407590 479 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 AL731563.2-201ENST00000431293 291 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 AL359771.1-201ENST00000441809 379 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 PTPRG-AS1-202ENST00000466893 823 ntTSL 4 BASIC2.07□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 RNU6-678P-201ENST00000516832 109 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 AC112187.2-201ENST00000604345 283 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 AC107952.2-201ENST00000606048 486 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 uc_338.12-201ENST00000616344 181 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 TLR6-205ENST00000610323 1443 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 Y_RNA.46-201ENST00000362695 102 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 AC005005.2-201ENST00000420779 380 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 LINC01427-201ENST00000420928 504 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 AL136234.1-201ENST00000437080 349 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 AL354936.1-201ENST00000441521 649 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 NFIA-AS1-201ENST00000442027 384 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 AC069549.1-201ENST00000451584 499 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 MTCO1P42-201ENST00000457379 726 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 RPS3AP22-201ENST00000488297 769 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 AC034234.1-202ENST00000508696 339 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 ARL2BPP2-201ENST00000550907 489 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 AC092104.1-201ENST00000497346 1441 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
DDX39BQ13838 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
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