Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 HMGB1P38-201ENST00000490557 577 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SPTAN1Q13813 AP001269.3-201ENST00000588718 329 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SPTAN1Q13813 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SPTAN1Q13813 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SPTAN1Q13813 RABGGTB-202ENST00000370826 512 ntTSL 2 BASIC0.18□□□□□ -2.38
SPTAN1Q13813 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SPTAN1Q13813 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SPTAN1Q13813 AL161935.1-201ENST00000420945 421 ntTSL 3 BASIC0.18□□□□□ -2.38
SPTAN1Q13813 AC009158.1-205ENST00000452511 895 ntTSL 3 BASIC0.18□□□□□ -2.38
SPTAN1Q13813 AC010301.1-201ENST00000473936 355 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SPTAN1Q13813 AC104248.1-202ENST00000524134 486 ntTSL 5 BASIC0.18□□□□□ -2.38
SPTAN1Q13813 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SPTAN1Q13813 NUTF2P8-201ENST00000604593 363 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SPTAN1Q13813 MIR198-201ENST00000637333 62 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SPTAN1Q13813 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SPTAN1Q13813 RNU6-920P-201ENST00000410926 92 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SPTAN1Q13813 AL109924.3-201ENST00000413324 393 ntTSL 2 BASIC0.18□□□□□ -2.38
SPTAN1Q13813 LINC01953-201ENST00000426870 717 ntTSL 5 BASIC0.18□□□□□ -2.38
SPTAN1Q13813 AC020571.1-201ENST00000430904 768 ntTSL 2 BASIC0.18□□□□□ -2.38
SPTAN1Q13813 AC024597.1-201ENST00000442753 706 ntTSL 5 BASIC0.18□□□□□ -2.38
SPTAN1Q13813 HRAT17-201ENST00000447785 547 ntTSL 4 BASIC0.18□□□□□ -2.38
SPTAN1Q13813 AL445488.1-201ENST00000457272 706 ntTSL 5 BASIC0.18□□□□□ -2.38
SPTAN1Q13813 RNA5SP134-201ENST00000516492 96 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SPTAN1Q13813 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SPTAN1Q13813 AL121839.1-201ENST00000556233 1185 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SPTAN1Q13813 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC0.18□□□□□ -2.38
SPTAN1Q13813 AP000873.2-201ENST00000602381 406 ntTSL 2 BASIC0.18□□□□□ -2.38
SPTAN1Q13813 AP002791.1-201ENST00000623291 381 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SPTAN1Q13813 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SPTAN1Q13813 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SPTAN1Q13813 AL359095.1-201ENST00000457383 635 ntTSL 3 BASIC0.17□□□□□ -2.38
SPTAN1Q13813 AC087241.1-201ENST00000508615 429 ntTSL 5 BASIC0.17□□□□□ -2.38
SPTAN1Q13813 AC114284.1-201ENST00000511422 1114 ntTSL 2 BASIC0.17□□□□□ -2.38
SPTAN1Q13813 AC009597.1-201ENST00000521215 584 ntTSL 4 BASIC0.17□□□□□ -2.38
SPTAN1Q13813 AGGF1P5-201ENST00000567900 919 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SPTAN1Q13813 AC025165.5-201ENST00000602802 578 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SPTAN1Q13813 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SPTAN1Q13813 PDCL2-201ENST00000295645 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.16□□□□□ -2.38
SPTAN1Q13813 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.16□□□□□ -2.38
SPTAN1Q13813 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SPTAN1Q13813 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SPTAN1Q13813 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SPTAN1Q13813 OFD1P18Y-201ENST00000420889 959 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SPTAN1Q13813 AC022022.1-201ENST00000430304 178 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SPTAN1Q13813 AL645638.1-201ENST00000440519 361 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SPTAN1Q13813 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SPTAN1Q13813 OR10V3P-201ENST00000525712 725 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SPTAN1Q13813 CENPUP2-201ENST00000555897 1186 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SPTAN1Q13813 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SPTAN1Q13813 FAM157B-203ENST00000639350 358 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SPTAN1Q13813 CYP3A43-203ENST00000342499 1396 ntTSL 1 (best) BASIC0.16□□□□□ -2.38
SPTAN1Q13813 Y_RNA.468-201ENST00000384298 102 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SPTAN1Q13813 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SPTAN1Q13813 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SPTAN1Q13813 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SPTAN1Q13813 PPFIA2-AS1-202ENST00000549161 1080 ntTSL 3 BASIC0.16□□□□□ -2.38
SPTAN1Q13813 AC074051.3-201ENST00000570238 358 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SPTAN1Q13813 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC0.16□□□□□ -2.38
SPTAN1Q13813 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SPTAN1Q13813 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SPTAN1Q13813 AC083798.2-205ENST00000608015 575 ntTSL 5 BASIC0.16□□□□□ -2.38
SPTAN1Q13813 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SPTAN1Q13813 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC0.15□□□□□ -2.38
SPTAN1Q13813 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC0.15□□□□□ -2.38
SPTAN1Q13813 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC0.15□□□□□ -2.38
SPTAN1Q13813 LANCL1-AS1-202ENST00000420418 476 ntTSL 3 BASIC0.15□□□□□ -2.38
SPTAN1Q13813 AL606495.1-201ENST00000422100 813 ntBASIC0.15□□□□□ -2.38
SPTAN1Q13813 LINC01758-201ENST00000448001 458 ntTSL 3 BASIC0.15□□□□□ -2.38
SPTAN1Q13813 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC0.15□□□□□ -2.38
SPTAN1Q13813 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC0.15□□□□□ -2.38
SPTAN1Q13813 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC0.15□□□□□ -2.38
SPTAN1Q13813 HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 97 ntBASIC0.15□□□□□ -2.38
SPTAN1Q13813 AC079150.1-201ENST00000413043 383 ntTSL 3 BASIC0.15□□□□□ -2.39
SPTAN1Q13813 AC099063.1-201ENST00000437128 324 ntTSL 5 BASIC0.15□□□□□ -2.39
SPTAN1Q13813 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SPTAN1Q13813 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC0.15□□□□□ -2.39
SPTAN1Q13813 AC010627.1-201ENST00000503819 1294 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SPTAN1Q13813 RN7SKP34-201ENST00000516142 244 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SPTAN1Q13813 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SPTAN1Q13813 AC109635.4-202ENST00000531666 412 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SPTAN1Q13813 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SPTAN1Q13813 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SPTAN1Q13813 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SPTAN1Q13813 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SPTAN1Q13813 AL445584.2-201ENST00000614030 616 ntTSL 5 BASIC0.15□□□□□ -2.39
SPTAN1Q13813 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SPTAN1Q13813 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SPTAN1Q13813 SNORA4.1-201ENST00000364263 144 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SPTAN1Q13813 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SPTAN1Q13813 MIR607-201ENST00000385241 96 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SPTAN1Q13813 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SPTAN1Q13813 AC009518.2-201ENST00000418056 731 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SPTAN1Q13813 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SPTAN1Q13813 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SPTAN1Q13813 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SPTAN1Q13813 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC0.14□□□□□ -2.39
SPTAN1Q13813 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SPTAN1Q13813 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SPTAN1Q13813 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SPTAN1Q13813 SATB1-AS1-258ENST00000629405 664 ntTSL 5 BASIC0.14□□□□□ -2.39
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