Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 AC087883.1-201ENST00000551882 391 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 AC107304.1-201ENST00000604229 296 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 AL445584.2-201ENST00000614030 616 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 AC124864.2-201ENST00000624736 186 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 AC006020.1-201ENST00000420179 1854 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 Y_RNA.372-201ENST00000365599 102 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 RNU6-1103P-201ENST00000384150 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 AC137499.1-201ENST00000427602 88 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 RPL7L1P10-201ENST00000427790 463 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 AL139415.2-201ENST00000431968 163 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC2.51□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 TAAR7P-201ENST00000436141 242 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 AL136380.1-201ENST00000447970 162 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 AC093899.1-201ENST00000457984 376 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 AC126182.1-201ENST00000478134 357 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 UMAD1-204ENST00000482067 569 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 TTC39CP1-201ENST00000512513 755 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 HMGB1P41-201ENST00000520234 440 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 AL358937.1-201ENST00000524512 336 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 AC011979.2-201ENST00000527568 352 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 AP003072.2-201ENST00000527756 676 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 AC007368.1-201ENST00000536422 974 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 AC008741.1-201ENST00000569456 510 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 AP003465.2-201ENST00000602571 373 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 AC007684.1-201ENST00000609671 477 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 LINC00305-201ENST00000323355 873 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 Y_RNA.1-201ENST00000352915 104 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 RNU6-74P-201ENST00000384235 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 AL592114.1-201ENST00000403842 483 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 AL139397.2-201ENST00000404529 772 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 RPS3AP44-201ENST00000425466 790 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 AC073464.1-201ENST00000429823 534 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 HMGB3P12-201ENST00000438745 556 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC2.5□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 AC013267.1-201ENST00000458227 267 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 AC233702.1-201ENST00000482905 502 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 AC007182.2-201ENST00000489251 402 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 AC019235.1-201ENST00000503847 207 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 AC011352.1-201ENST00000512300 793 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 AC004053.1-201ENST00000515127 575 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 RNU2-10P-201ENST00000516375 211 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 RPS3AP4-201ENST00000555161 764 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
RUNX3Q13761 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.3 ms