Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CACNA1SQ13698 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CACNA1SQ13698 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CACNA1SQ13698 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CACNA1SQ13698 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CACNA1SQ13698 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CACNA1SQ13698 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CACNA1SQ13698 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CACNA1SQ13698 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CACNA1SQ13698 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CACNA1SQ13698 NDUFB4P7-201ENST00000423198 363 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CACNA1SQ13698 XKRYP1-201ENST00000423438 492 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CACNA1SQ13698 XKRYP2-201ENST00000432915 492 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CACNA1SQ13698 AC007327.1-201ENST00000447461 264 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CACNA1SQ13698 AL592447.1-201ENST00000447592 540 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CACNA1SQ13698 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CACNA1SQ13698 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CACNA1SQ13698 NRON-201ENST00000517270 370 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CACNA1SQ13698 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CACNA1SQ13698 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CACNA1SQ13698 AC068993.2-201ENST00000546563 395 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
CACNA1SQ13698 AC004217.2-201ENST00000547401 751 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
CACNA1SQ13698 AC087286.1-201ENST00000560712 568 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
CACNA1SQ13698 AC090616.5-201ENST00000581225 299 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
CACNA1SQ13698 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CACNA1SQ13698 AC090227.2-201ENST00000591105 340 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
CACNA1SQ13698 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CACNA1SQ13698 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CACNA1SQ13698 AC009237.15-201ENST00000610252 501 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CACNA1SQ13698 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CACNA1SQ13698 AL158163.2-201ENST00000619110 700 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CACNA1SQ13698 AP000720.1-201ENST00000625091 483 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CACNA1SQ13698 AC092447.10-201ENST00000620607 1652 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CACNA1SQ13698 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CACNA1SQ13698 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CACNA1SQ13698 RNU6-114P-201ENST00000384704 105 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CACNA1SQ13698 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CACNA1SQ13698 AL161449.1-201ENST00000414531 1199 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CACNA1SQ13698 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
CACNA1SQ13698 AP000431.2-201ENST00000450653 790 ntTSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
CACNA1SQ13698 HTR2A-AS1-202ENST00000452352 384 ntTSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
CACNA1SQ13698 TMEM251P1-201ENST00000503717 318 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CACNA1SQ13698 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CACNA1SQ13698 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
CACNA1SQ13698 AC009712.1-201ENST00000564938 316 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CACNA1SQ13698 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CACNA1SQ13698 AC006927.4-201ENST00000639187 543 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CACNA1SQ13698 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CACNA1SQ13698 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
CACNA1SQ13698 RNU6-278P-201ENST00000390945 109 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CACNA1SQ13698 MIR1305-201ENST00000408300 86 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CACNA1SQ13698 AC068533.2-201ENST00000411872 306 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CACNA1SQ13698 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CACNA1SQ13698 AC012368.2-201ENST00000423539 560 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
CACNA1SQ13698 MTND5P14-201ENST00000441481 1267 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CACNA1SQ13698 OFD1P7Y-201ENST00000454643 1155 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CACNA1SQ13698 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CACNA1SQ13698 AC104137.1-201ENST00000503625 385 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
CACNA1SQ13698 LINC02377-202ENST00000505436 523 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
CACNA1SQ13698 AC109454.3-201ENST00000512748 669 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
CACNA1SQ13698 LINC02484-201ENST00000513843 546 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
CACNA1SQ13698 LINC02353-201ENST00000515181 849 ntTSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
CACNA1SQ13698 RNU6-583P-201ENST00000516012 92 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CACNA1SQ13698 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CACNA1SQ13698 CCDC7-207ENST00000535327 700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
CACNA1SQ13698 LINC01584-203ENST00000567231 646 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
CACNA1SQ13698 AGGF1P5-201ENST00000567900 919 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CACNA1SQ13698 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CACNA1SQ13698 AC112220.2-201ENST00000605513 533 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CACNA1SQ13698 AC007038.2-201ENST00000608095 740 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CACNA1SQ13698 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CACNA1SQ13698 MUC15-204ENST00000527569 1386 ntTSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
CACNA1SQ13698 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CACNA1SQ13698 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CACNA1SQ13698 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CACNA1SQ13698 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CACNA1SQ13698 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
CACNA1SQ13698 RPS12P24-201ENST00000412619 387 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CACNA1SQ13698 RPL21P24-201ENST00000413752 448 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CACNA1SQ13698 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CACNA1SQ13698 ZNF863P-201ENST00000426746 417 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CACNA1SQ13698 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CACNA1SQ13698 AC092625.1-201ENST00000442706 393 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
CACNA1SQ13698 AL136380.1-201ENST00000447970 162 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CACNA1SQ13698 BZW1P2-201ENST00000473537 826 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CACNA1SQ13698 AC092902.1-201ENST00000486999 259 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CACNA1SQ13698 AC104629.1-201ENST00000494226 508 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CACNA1SQ13698 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CACNA1SQ13698 MTND3P13-201ENST00000574391 343 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CACNA1SQ13698 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
CACNA1SQ13698 AC103710.4-201ENST00000609301 899 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CACNA1SQ13698 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CACNA1SQ13698 AC109809.1-201ENST00000619665 545 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CACNA1SQ13698 AL138955.1-201ENST00000622881 1040 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CACNA1SQ13698 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CACNA1SQ13698 PCMTD1P7-201ENST00000634506 357 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CACNA1SQ13698 ANKRD26P2-201ENST00000445530 1710 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CACNA1SQ13698 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
CACNA1SQ13698 C8orf59-201ENST00000321777 325 ntTSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
CACNA1SQ13698 HMGN1P14-201ENST00000412459 517 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.7 ms