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| FHL3 | Q13643 | AL138721.1-201 | ENST00000616756 | 179 nt | BASIC | 3.21 | □□□□□ -1.9 | | |
| FHL3 | Q13643 | AC244196.2-201 | ENST00000621184 | 411 nt | APPRIS P1 BASIC | 3.21 | □□□□□ -1.9 | | |
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| FHL3 | Q13643 | QSER1-201 | ENST00000399302 | 9335 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.2 | □□□□□ -1.9 | | |
| FHL3 | Q13643 | MYSM1-203 | ENST00000472487 | 7785 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.2 | □□□□□ -1.9 | | |
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| FHL3 | Q13643 | SLAIN2-205 | ENST00000512093 | 4219 nt | TSL 5 BASIC | 3.2 | □□□□□ -1.9 | | |
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| FHL3 | Q13643 | OR56A3-203 | ENST00000641160 | 4438 nt | APPRIS P1 BASIC | 3.2 | □□□□□ -1.9 | | |
| FHL3 | Q13643 | COPS2-203 | ENST00000542928 | 1580 nt | TSL 2 BASIC | 3.2 | □□□□□ -1.9 | | |
| FHL3 | Q13643 | CEP295-201 | ENST00000325212 | 8057 nt | APPRIS P2 TSL 2 BASIC | 3.2 | □□□□□ -1.9 | | |
| FHL3 | Q13643 | OTUD6B-AS1-201 | ENST00000522817 | 4275 nt | TSL 2 BASIC | 3.2 | □□□□□ -1.9 | | |
| FHL3 | Q13643 | SELENOI-201 | ENST00000260585 | 8101 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 3.2 | □□□□□ -1.9 | | |
| FHL3 | Q13643 | EFR3A-208 | ENST00000637848 | 2547 nt | TSL 5 BASIC | 3.2 | □□□□□ -1.9 | | |
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| FHL3 | Q13643 | ZNF43-207 | ENST00000595461 | 3399 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 3.2 | □□□□□ -1.9 | | |
| FHL3 | Q13643 | MUC15-205 | ENST00000529533 | 2084 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.2 | □□□□□ -1.9 | | |
| FHL3 | Q13643 | ADAM3A-203 | ENST00000461344 | 2157 nt | BASIC | 3.19 | □□□□□ -1.9 | | |
| FHL3 | Q13643 | ZNF85-201 | ENST00000300540 | 1531 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.19 | □□□□□ -1.9 | | |
| FHL3 | Q13643 | PRLR-217 | ENST00000618457 | 11688 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.19 | □□□□□ -1.9 | | |
| FHL3 | Q13643 | NLGN1-201 | ENST00000361589 | 5092 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.19 | □□□□□ -1.9 | | |
| FHL3 | Q13643 | HSPA8P1-201 | ENST00000425843 | 1833 nt | BASIC | 3.19 | □□□□□ -1.9 | | |
| FHL3 | Q13643 | PTP4A1-205 | ENST00000626021 | 2203 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.19 | □□□□□ -1.9 | | |
| FHL3 | Q13643 | F8-202 | ENST00000360256 | 9059 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.19 | □□□□□ -1.9 | | |
| FHL3 | Q13643 | VPS13C-202 | ENST00000261517 | 13400 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 3.19 | □□□□□ -1.9 | | |
| FHL3 | Q13643 | RNU6-1280P-201 | ENST00000365211 | 107 nt | BASIC | 3.19 | □□□□□ -1.9 | | |
| FHL3 | Q13643 | Y_RNA.401-201 | ENST00000383965 | 117 nt | BASIC | 3.19 | □□□□□ -1.9 | | |
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| FHL3 | Q13643 | AC069257.1-202 | ENST00000425275 | 422 nt | TSL 3 BASIC | 3.19 | □□□□□ -1.9 | | |
| FHL3 | Q13643 | AL159987.2-201 | ENST00000432754 | 307 nt | BASIC | 3.19 | □□□□□ -1.9 | | |
| FHL3 | Q13643 | AL714022.1-201 | ENST00000439897 | 151 nt | BASIC | 3.19 | □□□□□ -1.9 | | |
| FHL3 | Q13643 | EHHADH-202 | ENST00000440662 | 656 nt | TSL 3 BASIC | 3.19 | □□□□□ -1.9 | | |
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| FHL3 | Q13643 | AC010974.1-201 | ENST00000450509 | 374 nt | TSL 3 BASIC | 3.19 | □□□□□ -1.9 | | |
| FHL3 | Q13643 | AC010099.1-201 | ENST00000455434 | 375 nt | BASIC | 3.19 | □□□□□ -1.9 | | |
| FHL3 | Q13643 | PCMTD1P1-201 | ENST00000455560 | 355 nt | BASIC | 3.19 | □□□□□ -1.9 | | |
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| FHL3 | Q13643 | U8.21-201 | ENST00000459536 | 136 nt | BASIC | 3.19 | □□□□□ -1.9 | | |
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| FHL3 | Q13643 | RNU6-1170P-201 | ENST00000515974 | 106 nt | BASIC | 3.19 | □□□□□ -1.9 | | |
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| FHL3 | Q13643 | AP000867.2-201 | ENST00000532468 | 320 nt | BASIC | 3.19 | □□□□□ -1.9 | | |
| FHL3 | Q13643 | AC078889.1-201 | ENST00000536412 | 523 nt | TSL 2 BASIC | 3.19 | □□□□□ -1.9 | | |
| FHL3 | Q13643 | AL117187.1-201 | ENST00000555482 | 181 nt | BASIC | 3.19 | □□□□□ -1.9 | | |
| FHL3 | Q13643 | AC021739.1-201 | ENST00000559631 | 174 nt | BASIC | 3.19 | □□□□□ -1.9 | | |
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